45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC8801_3852 on replicon NC_011726
Organism: Cyanothece sp. PCC 8801



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011726  PCC8801_3852  GTP-binding protein HSR1-related  100 
 
 		 1415 aa  2912    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3901  GTP-binding protein HSR1-related  96.04 
 
 		 581 aa  1150    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0368648  normal  0.0698328 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3902  GTP-binding protein HSR1-related  99.16 
 
 		 829 aa  1694    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.12168  normal  0.150325 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2033  GTP-binding protein, HSR1-related  22.99 
 
 		 569 aa  72.8  0.00000000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00291841 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3193  GTP-binding protein, HSR1-related  30.37 
 
 		 1211 aa  62  0.00000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2751  GTP-binding protein, HSR1-related  38.36 
 
 		 549 aa  62  0.00000008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.859645  normal  0.205011 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5212  small GTP-binding protein  41.27 
 
 		 489 aa  55.1  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000545834 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2392  Dynamin family protein  23.33 
 
 		 1249 aa  53.5  0.00003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1387  GTP-binding protein Era  25.37 
 
 		 308 aa  53.1  0.00004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.263237  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3535  GTP-binding protein Era  33.08 
 
 		 324 aa  52.8  0.00004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0968  small GTP-binding protein  27.52 
 
 		 501 aa  52  0.00008  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3531  dynamin family protein  27.55 
 
 		 585 aa  52  0.00009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1118  GTP-binding protein Era  25.73 
 
 		 303 aa  52  0.00009  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4509  small GTP-binding protein domain-containing protein  29.45 
 
 		 457 aa  50.8  0.0002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0763  GTP-binding protein Era  32.77 
 
 		 291 aa  50.4  0.0002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.213549  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1436  small GTP-binding protein  36.76 
 
 		 479 aa  50.1  0.0003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.741449  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1407  small GTP-binding protein  36.76 
 
 		 479 aa  50.1  0.0003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0688  GTP-binding protein Era  33.33 
 
 		 291 aa  50.1  0.0003  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1344  GTP-binding protein Era  34.59 
 
 		 302 aa  49.7  0.0004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000010527  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2664  GTP-binding protein, HSR1-like  26.09 
 
 		 581 aa  48.9  0.0006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.760188 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1193  hypothetical protein  26.21 
 
 		 614 aa  48.9  0.0006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.108086  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0107  small GTP-binding protein domain-containing protein  25.56 
 
 		 472 aa  48.9  0.0008  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.130324  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3839  small GTP-binding protein  24.74 
 
 		 481 aa  48.1  0.001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.674432 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1323  GTP-binding protein Era  30.43 
 
 		 298 aa  48.1  0.001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0411499  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0758  GTP-binding protein Era  29.76 
 
 		 290 aa  47  0.002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.334312  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3709  small GTP-binding protein  29.13 
 
 		 462 aa  47.4  0.002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0499  small GTP-binding protein  32.35 
 
 		 475 aa  47.8  0.002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.362987  normal  0.723657 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0828  hypothetical protein  34.17 
 
 		 516 aa  47.4  0.002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000529126  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1338  GTP-binding protein Era  34.31 
 
 		 291 aa  47.4  0.002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.548125  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1654  dynamin  29.29 
 
 		 686 aa  46.6  0.003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0311974  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15170  small GTP-binding protein domain/GTP-binding conserved hypothetical protein  29.23 
 
 		 527 aa  46.6  0.003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00982196  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4633  GTP-binding protein EngA  29.45 
 
 		 511 aa  46.6  0.003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1234  GTP-binding protein EngA  36.67 
 
 		 444 aa  46.2  0.004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5156  small GTP-binding protein  27.33 
 
 		 566 aa  46.6  0.004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.61556 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1154  hypothetical protein  23.97 
 
 		 435 aa  45.8  0.006  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1116  GTP-binding protein Era  34.48 
 
 		 303 aa  45.8  0.006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1422  ribosome-associated GTPase EngA  34.62 
 
 		 484 aa  45.8  0.007  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0764  GTP-binding protein HSR1-related  28.22 
 
 		 469 aa  45.4  0.008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.796008  normal  0.847657 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1412  GTP-binding protein Era  30.17 
 
 		 300 aa  45.1  0.009  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000752923  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1377  dynamin family protein  27.08 
 
 		 585 aa  45.4  0.009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.682843  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2103  GTP-binding protein EngA  23.18 
 
 		 441 aa  45.4  0.009  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0813  hypothetical protein  31.67 
 
 		 516 aa  45.1  0.009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1439  Dynamin family protein  20 
 
 		 546 aa  45.1  0.009  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.784928  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10221  GTPase SAR1 and related small G protein  26.78 
 
 		 516 aa  45.1  0.01  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.524471  normal  0.183753 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0192  GTP-binding protein EngA  25 
 
 		 445 aa  45.1  0.01  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>