More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cla_0758 on replicon NC_012039
Organism: Campylobacter lari RM2100



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012039  Cla_0758  GTP-binding protein Era  100 
 
 		 290 aa  585  1e-166  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.334312  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0688  GTP-binding protein Era  67.93 
 
 		 291 aa  409  1e-113  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0763  GTP-binding protein Era  67.24 
 
 		 291 aa  406  1.0000000000000001e-112  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.213549  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1338  GTP-binding protein Era  66.21 
 
 		 291 aa  395  1e-109  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.548125  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1972  GTP-binding protein Era  58.89 
 
 		 289 aa  359  3e-98  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1003  GTP-binding protein Era  56.84 
 
 		 289 aa  347  2e-94  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1223  GTP-binding protein Era  58.89 
 
 		 289 aa  345  6e-94  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.225861  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1060  GTP-binding protein Era  54.51 
 
 		 289 aa  321  9.999999999999999e-87  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  decreased coverage  0.00411947  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1032  GTP-binding protein Era  49.65 
 
 		 296 aa  294  1e-78  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.238  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1378  GTP-binding protein Era  51.04 
 
 		 300 aa  276  2e-73  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  decreased coverage  0.0000347783  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0646  GTP-binding protein Era  39.12 
 
 		 305 aa  204  1e-51  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.601606  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4275  GTP-binding protein Era  35.96 
 
 		 303 aa  202  5e-51  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2315  GTP-binding protein Era  37.84 
 
 		 298 aa  200  3e-50  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0597  GTP-binding protein Era  35.15 
 
 		 348 aa  196  3e-49  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00117321 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2226  GTP-binding protein Era  36.3 
 
 		 299 aa  196  5.000000000000001e-49  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1405  GTP-binding protein Era  37.54 
 
 		 303 aa  194  1e-48  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00334874  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1062  GTP-binding protein Era  37.63 
 
 		 297 aa  194  2e-48  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.3553700000000001e-19 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1067  GTP-binding protein Era  39.66 
 
 		 297 aa  191  1e-47  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3150  GTP-binding protein Era  36.99 
 
 		 297 aa  190  2.9999999999999997e-47  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0326426  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0579  GTP-binding protein Era  36.77 
 
 		 298 aa  189  5e-47  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0651  putative GTP-binding protein  33.67 
 
 		 312 aa  188  1e-46  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.181354  normal  0.422678 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0332  GTP-binding protein Era  37.88 
 
 		 293 aa  186  3e-46  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2272  GTP-binding protein Era  35.74 
 
 		 296 aa  186  4e-46  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1946  GTP-binding protein Era  31.4 
 
 		 303 aa  186  5e-46  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4199  GTP-binding protein Era  36.18 
 
 		 301 aa  185  9e-46  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.0000030589  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4524  GTP-binding protein Era  36.18 
 
 		 301 aa  185  9e-46  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.00000023252  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1726  GTP-binding protein Era  36.55 
 
 		 296 aa  185  9e-46  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4380  GTP-binding protein Era  36.18 
 
 		 301 aa  184  1.0000000000000001e-45  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00000332799  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4037  GTP-binding protein Era  36.18 
 
 		 301 aa  184  1.0000000000000001e-45  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000298362  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4047  GTP-binding protein Era  36.18 
 
 		 301 aa  184  1.0000000000000001e-45  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.0000000000669103  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4322  GTP-binding protein Era  36.18 
 
 		 301 aa  184  1.0000000000000001e-45  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  9.08796e-57 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4433  GTP-binding protein Era  36.18 
 
 		 301 aa  184  1.0000000000000001e-45  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000109784  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1987  GTP-binding protein Era  35.4 
 
 		 296 aa  184  1.0000000000000001e-45  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2127  GTP-binding protein Era  36.18 
 
 		 296 aa  184  1.0000000000000001e-45  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.148937  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12510  GTP-binding protein Era  33.33 
 
 		 294 aa  184  2.0000000000000003e-45  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1116  GTP-binding protein Era  35.49 
 
 		 303 aa  184  2.0000000000000003e-45  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0819  GTP-binding protein Era  36.18 
 
 		 301 aa  182  4.0000000000000006e-45  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000201776  decreased coverage  1.20434e-22 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4151  GTP-binding protein Era  35.84 
 
 		 301 aa  182  4.0000000000000006e-45  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.000210779  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4417  GTP-binding protein Era  36.18 
 
 		 301 aa  182  4.0000000000000006e-45  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.0018216  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2479  GTP-binding protein Era  32.86 
 
 		 302 aa  182  7e-45  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.080148  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3026  GTP-binding protein Era  35.49 
 
 		 301 aa  182  7e-45  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.552288  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1134  GTP-binding protein Era  35.15 
 
 		 299 aa  181  9.000000000000001e-45  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.968945  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3535  GTP-binding protein Era  34.77 
 
 		 324 aa  181  1e-44  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0780  GTPase  37.5 
 
 		 303 aa  181  1e-44  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.00998411  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2421  GTP-binding protein Era  35.71 
 
 		 302 aa  181  1e-44  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1561  Era, Era/TrmE family GTP-binding protein  34.59 
 
 		 293 aa  180  2.9999999999999997e-44  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.400098  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1625  GTP-binding protein Era  34.13 
 
 		 299 aa  179  4e-44  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1659  GTP-binding protein Era  34.13 
 
 		 299 aa  179  4e-44  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1462  GTP-binding protein Era  33.33 
 
 		 293 aa  178  9e-44  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0973  GTP-binding protein Era  34.93 
 
 		 311 aa  177  1e-43  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1403  GTP-binding protein Era  34.23 
 
 		 321 aa  177  1e-43  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0138  GTP-binding protein Era  32.99 
 
 		 300 aa  178  1e-43  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1344  GTP-binding protein Era  34.93 
 
 		 302 aa  177  2e-43  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000010527  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2030  GTP-binding protein Era  34.69 
 
 		 294 aa  177  2e-43  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0924182  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0214  GTP-binding protein Era  32.41 
 
 		 293 aa  177  2e-43  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.890226  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0134  GTP-binding protein Era  35.96 
 
 		 299 aa  177  2e-43  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl266  GTP-binding protein Era  34.24 
 
 		 301 aa  176  3e-43  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  6.59888e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0874  GTP-binding protein Era  34.12 
 
 		 307 aa  176  3e-43  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2045  GTP-binding protein Era  31.82 
 
 		 308 aa  175  6e-43  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0881  GTP-binding protein Era  35.93 
 
 		 332 aa  176  6e-43  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.427391  normal  0.11596 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2619  GTP-binding protein Era  31.86 
 
 		 337 aa  175  7e-43  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1004  GTP-binding protein Era  34.93 
 
 		 311 aa  175  7e-43  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3266  GTP-binding protein Era  31.86 
 
 		 337 aa  175  7e-43  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0242334 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0600  GTP-binding protein Era  32.19 
 
 		 301 aa  175  8e-43  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1029  GTP-binding protein Era  33.67 
 
 		 302 aa  174  9.999999999999999e-43  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0397  GTP-binding protein Era  35.84 
 
 		 303 aa  174  9.999999999999999e-43  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3856  GTP-binding protein Era  34.01 
 
 		 308 aa  174  1.9999999999999998e-42  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00601446  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3237  GTP-binding protein Era  31.19 
 
 		 340 aa  174  1.9999999999999998e-42  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0752084  normal  0.147355 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1640  GTP-binding protein Era  32.2 
 
 		 307 aa  174  1.9999999999999998e-42  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0258714  hitchhiker  0.00261121 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2311  GTP-binding protein Era  35.14 
 
 		 309 aa  174  1.9999999999999998e-42  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.254696  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5260  GTP-binding protein Era  32.2 
 
 		 344 aa  174  1.9999999999999998e-42  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.678388  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1543  GTP-binding protein Era  33.33 
 
 		 314 aa  173  2.9999999999999996e-42  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5225  GTP-binding protein Era  33.9 
 
 		 306 aa  173  2.9999999999999996e-42  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.761652 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2169  GTP-binding protein Era  34.48 
 
 		 299 aa  173  2.9999999999999996e-42  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0368513  normal  0.378234 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1632  GTP-binding protein Era  33 
 
 		 299 aa  173  2.9999999999999996e-42  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.392106  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0908  GTP-binding protein Era  33.33 
 
 		 303 aa  173  2.9999999999999996e-42  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1197  GTP-binding protein Era  31.19 
 
 		 344 aa  173  2.9999999999999996e-42  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.194461  normal  0.0122322 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3060  GTP-binding protein Era  31.72 
 
 		 357 aa  172  7.999999999999999e-42  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.547585  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1038  GTP-binding protein Era  35.25 
 
 		 330 aa  171  9e-42  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00137835  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1011  GTP-binding protein Era  34.25 
 
 		 299 aa  171  9e-42  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.262432  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0929  GTP-binding protein Era  32.42 
 
 		 312 aa  171  1e-41  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.163867  normal  0.15052 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0735  GTP-binding protein Era  34.81 
 
 		 314 aa  171  1e-41  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.222854  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0994  GTP-binding protein Era  32.42 
 
 		 312 aa  171  1e-41  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.307835  normal  0.0847852 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3074  GTP-binding protein Era  31.83 
 
 		 298 aa  171  1e-41  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1387  GTP-binding protein Era  34.72 
 
 		 308 aa  171  1e-41  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.263237  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2928  GTP-binding protein Era  34.78 
 
 		 334 aa  171  1e-41  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4247  GTP-binding protein Era  34.02 
 
 		 299 aa  170  2e-41  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3148  GTP-binding protein Era  34.92 
 
 		 300 aa  170  2e-41  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0159525  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1149  GTP-binding protein Era  34.58 
 
 		 335 aa  170  2e-41  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.28675  normal  0.946741 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0655  GTP-binding protein Era  34.25 
 
 		 299 aa  170  3e-41  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1135  GTP-binding protein Era  34.25 
 
 		 299 aa  170  3e-41  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1878  GTP-binding protein Era  29.9 
 
 		 295 aa  169  5e-41  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3634  GTP-binding protein Era  31.38 
 
 		 314 aa  169  5e-41  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.407522  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0989  GTPase  34.24 
 
 		 305 aa  169  5e-41  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00032345  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1064  GTP-binding protein Era  32.42 
 
 		 298 aa  169  6e-41  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0212543  normal  0.0907756 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0482  GTP-binding protein Era  33.44 
 
 		 295 aa  169  7e-41  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1412  GTP-binding protein Era  34.35 
 
 		 300 aa  169  7e-41  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000752923  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1685  GTP-binding protein Era  33.11 
 
 		 295 aa  169  7e-41  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1118  GTP-binding protein Era  34.02 
 
 		 303 aa  168  8e-41  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2417  GTP-binding protein Era  34.24 
 
 		 312 aa  168  1e-40  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.262207 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>