39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflv_3193 on replicon NC_009338
Organism: Mycobacterium gilvum PYR-GCK



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009338  Mflv_3193  GTP-binding protein, HSR1-related  100 
 
 		 1211 aa  2437    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3852  GTP-binding protein HSR1-related  21.35 
 
 		 1415 aa  78.2  0.0000000000009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3901  GTP-binding protein HSR1-related  22.63 
 
 		 581 aa  69.3  0.0000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0368648  normal  0.0698328 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3192  hypothetical protein  30.19 
 
 		 465 aa  67  0.000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.279766  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3902  GTP-binding protein HSR1-related  30.37 
 
 		 829 aa  61.6  0.00000009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.12168  normal  0.150325 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0825  tRNA modification GTPase TrmE  28.74 
 
 		 442 aa  58.9  0.0000006  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1036  tRNA modification GTPase TrmE  27.14 
 
 		 442 aa  58.5  0.0000008  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.788526  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0979  tRNA modification GTPase TrmE  26.67 
 
 		 442 aa  57.4  0.000002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.523955  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3005  GTP-binding protein EngA  29.14 
 
 		 460 aa  53.1  0.00003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.325  normal  0.428179 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2448  GTP-binding protein EngA  30.08 
 
 		 459 aa  52.8  0.00004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.14966  normal  0.412824 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3776  GTP-binding protein EngA  28.08 
 
 		 456 aa  51.6  0.00009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0350234  normal  0.961635 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3505  GTP-binding protein EngA  30.37 
 
 		 459 aa  51.2  0.0001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0442058  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0548  tRNA modification GTPase TrmE  24.03 
 
 		 442 aa  50.1  0.0003  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1833  tRNA modification GTPase TrmE  28.57 
 
 		 444 aa  50.1  0.0003  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1204  GTP-binding protein EngA  31.4 
 
 		 442 aa  49.3  0.0004  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.109244  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0555  tRNA modification GTPase TrmE  21.66 
 
 		 438 aa  48.9  0.0005  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1395  GTP-binding protein EngA  30.58 
 
 		 441 aa  49.3  0.0005  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3566  ribosome-associated GTPase EngA  32.23 
 
 		 454 aa  48.9  0.0006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.173152  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0107  small GTP-binding protein domain-containing protein  29.87 
 
 		 472 aa  48.5  0.0007  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.130324  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2279  GTP-binding protein EngA  29.85 
 
 		 460 aa  48.5  0.0009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0830899  normal  0.567814 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2152  small GTP-binding protein  33.88 
 
 		 409 aa  47.8  0.001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0750  GTP-binding protein EngA  30.26 
 
 		 451 aa  47.8  0.001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.524371  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2751  GTP-binding protein, HSR1-related  28.09 
 
 		 549 aa  47.8  0.001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.859645  normal  0.205011 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1582  tRNA modification GTPase TrmE  31.25 
 
 		 462 aa  47  0.002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1177  GTP-binding protein  30.58 
 
 		 441 aa  47  0.002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1904  tRNA modification GTPase TrmE  34 
 
 		 472 aa  47.4  0.002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1624  GTP-binding protein EngA  28.47 
 
 		 437 aa  47  0.002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.565401  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1686  GTP-binding protein EngA  29.29 
 
 		 460 aa  47  0.003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0325003  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2020  GTP-binding protein EngA  27.64 
 
 		 455 aa  46.2  0.004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.866056  normal  1 
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf755  tRNA modification GTPase TrmE  26.7 
 
 		 442 aa  45.4  0.006  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4633  GTP-binding protein EngA  29.46 
 
 		 511 aa  45.4  0.006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0419  GTP-binding protein Era  32.81 
 
 		 305 aa  45.4  0.007  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  unclonable  0.0000000385747  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3152  tRNA modification GTPase TrmE  29.86 
 
 		 464 aa  45.1  0.008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000246642 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0569  tRNA modification GTPase TrmE  25.62 
 
 		 458 aa  45.1  0.008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0497  GTPase  32.59 
 
 		 420 aa  45.1  0.008  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2233  tRNA modification GTPase TrmE  30 
 
 		 461 aa  45.1  0.009  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2638  small GTP-binding protein  33.06 
 
 		 394 aa  45.1  0.009  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1325  hypothetical protein  32.28 
 
 		 441 aa  45.1  0.009  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1908  tRNA modification GTPase TrmE  27.15 
 
 		 464 aa  44.7  0.01  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.991823  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>