More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Synpcc7942_0107 on replicon NC_007604
Organism: Synechococcus elongatus PCC 7942



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007604  Synpcc7942_0107  small GTP-binding protein domain-containing protein  100 
 
 		 472 aa  925    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.130324  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5156  small GTP-binding protein  51.94 
 
 		 566 aa  442  1e-123  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.61556 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5212  small GTP-binding protein  49.15 
 
 		 489 aa  420  1e-116  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000545834 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1080  small GTP-binding protein  45.71 
 
 		 484 aa  416  9.999999999999999e-116  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3291  small GTP-binding protein domain-containing protein  45.65 
 
 		 492 aa  409  1e-113  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0499  small GTP-binding protein  45.97 
 
 		 475 aa  408  1.0000000000000001e-112  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.362987  normal  0.723657 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1407  small GTP-binding protein  48.37 
 
 		 479 aa  405  1e-111  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1436  small GTP-binding protein  48.37 
 
 		 479 aa  404  1e-111  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.741449  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1616  small GTP-binding protein  42.24 
 
 		 453 aa  313  3.9999999999999997e-84  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00206677 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2393  small GTP-binding protein  40.98 
 
 		 448 aa  285  1.0000000000000001e-75  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2342  small GTP-binding protein  40.98 
 
 		 448 aa  285  1.0000000000000001e-75  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3709  small GTP-binding protein  40 
 
 		 462 aa  284  2.0000000000000002e-75  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4509  small GTP-binding protein domain-containing protein  41.37 
 
 		 457 aa  279  7e-74  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3839  small GTP-binding protein  35.61 
 
 		 481 aa  247  3e-64  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.674432 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0764  GTP-binding protein HSR1-related  38 
 
 		 469 aa  236  9e-61  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.796008  normal  0.847657 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0497  GTPase  38.75 
 
 		 420 aa  206  5e-52  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_04921  GTPase SAR1  40.96 
 
 		 441 aa  199  1.0000000000000001e-49  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0975  small GTP-binding protein domain-containing protein  33.98 
 
 		 440 aa  192  2e-47  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18431  GTPase SAR1 and related small G proteins  33.43 
 
 		 440 aa  188  2e-46  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.491382 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_15631  GTPase SAR1 and related small G protein  36.76 
 
 		 440 aa  188  2e-46  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2178  small GTP-binding protein domain-containing protein  37.22 
 
 		 431 aa  182  9.000000000000001e-45  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.995116  normal  0.41065 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1322  small GTP-binding protein  30.13 
 
 		 531 aa  156  6e-37  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1326  small GTP-binding protein  30.05 
 
 		 529 aa  155  1e-36  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1351  small GTP-binding protein  29.87 
 
 		 531 aa  155  1e-36  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000851094 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4459  small GTP-binding protein  31.64 
 
 		 520 aa  153  5.9999999999999996e-36  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.859915  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1709  small GTP-binding protein domain-containing protein  32.58 
 
 		 513 aa  153  8e-36  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.000711006  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1544  small GTP-binding protein domain-containing protein  30.15 
 
 		 517 aa  149  1.0000000000000001e-34  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0624831 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4593  small GTP-binding protein  29.4 
 
 		 506 aa  145  2e-33  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.771946  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_16231  GTPase SAR1 and related small G proteins  26.63 
 
 		 413 aa  142  9.999999999999999e-33  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.283634  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1537  small GTP-binding protein domain-containing protein  27.54 
 
 		 413 aa  139  1e-31  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.273802  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_16501  GTPase SAR1 and related small G proteins  29.65 
 
 		 532 aa  137  5e-31  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.569133 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_16461  GTPase SAR1  24.43 
 
 		 413 aa  130  4.0000000000000003e-29  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1904  GTP-binding protein, HSR1-related  28.53 
 
 		 545 aa  127  3e-28  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.30473  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_16341  GTPase SAR1 and related small G protein  24.19 
 
 		 413 aa  126  8.000000000000001e-28  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1210  small GTP-binding protein domain-containing protein  30.07 
 
 		 529 aa  122  1.9999999999999998e-26  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10221  GTPase SAR1 and related small G protein  27.78 
 
 		 516 aa  119  7.999999999999999e-26  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.524471  normal  0.183753 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1260  hypothetical protein  28.84 
 
 		 529 aa  118  3e-25  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_09991  GTPase SAR1 and related small G proteins  23.34 
 
 		 496 aa  110  6e-23  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_07771  GTPase SAR1 and related small G proteins  25.47 
 
 		 517 aa  105  2e-21  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.1398  normal  0.0362439 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0145  small GTP-binding protein domain-containing protein  25.47 
 
 		 517 aa  103  5e-21  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0884  small GTP-binding protein domain-containing protein  24.94 
 
 		 499 aa  102  2e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.102699  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_09451  GTPase SAR1  25.62 
 
 		 499 aa  102  2e-20  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_09441  GTPase SAR1 and related small G protein  24.5 
 
 		 499 aa  99.8  9e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4193  hypothetical protein  24.88 
 
 		 471 aa  90.5  6e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.296514 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0765  hypothetical protein  27.18 
 
 		 472 aa  89  2e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.860476 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0732  hypothetical protein  26.59 
 
 		 481 aa  68.6  0.0000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.00108673  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3579  hypothetical protein  26.29 
 
 		 463 aa  67.4  0.0000000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2527  hypothetical protein  23.61 
 
 		 463 aa  65.5  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0683  small GTP-binding protein  32.21 
 
 		 408 aa  63.2  0.000000009  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00203334  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2529  hypothetical protein  23.51 
 
 		 475 aa  62.4  0.00000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0165  small GTP-binding protein  35.62 
 
 		 427 aa  61.2  0.00000004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1862  small GTP-binding protein  31.85 
 
 		 398 aa  58.2  0.0000003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.803475  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0670  GTP-binding protein  23.48 
 
 		 355 aa  57  0.0000008  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.417298  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3840  hypothetical protein  25.29 
 
 		 492 aa  56.6  0.0000009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.83902  normal  0.693476 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1701  ribosome-associated GTPase EngA  33.57 
 
 		 444 aa  56.2  0.000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0307524  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1243  small GTP-binding protein  32.89 
 
 		 425 aa  56.6  0.000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0475  small GTP-binding protein  29.71 
 
 		 404 aa  55.5  0.000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1458  GTP-binding protein EngA  26.63 
 
 		 445 aa  55.5  0.000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000548717  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0490  small GTP-binding protein  29.71 
 
 		 404 aa  55.5  0.000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1946  GTP-binding protein Era  32.21 
 
 		 303 aa  55.5  0.000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0359  GTP-binding protein EngA  29.63 
 
 		 436 aa  55.8  0.000002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2138  putative GTPase  30.12 
 
 		 290 aa  54.7  0.000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1620  GTP-binding protein EngA  29.41 
 
 		 436 aa  54.7  0.000004  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0750  GTP-binding protein EngA  32.12 
 
 		 451 aa  54.7  0.000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.524371  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02997  GTP-binding protein Era  29.7 
 
 		 314 aa  54.7  0.000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.249422  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1393  putative GTPase  27.35 
 
 		 290 aa  54.3  0.000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.139964 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4891  putative GTPase  26.94 
 
 		 290 aa  53.9  0.000006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0322  Dynamin family protein  35.51 
 
 		 585 aa  53.5  0.000007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3103  small GTP-binding protein  28.26 
 
 		 396 aa  53.9  0.000007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0146  small GTP-binding protein  35.07 
 
 		 398 aa  53.5  0.000008  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0325934  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0632  Dynamin family protein  26.62 
 
 		 589 aa  53.5  0.000009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl014  tRNA modification GTPase TrmE  31.21 
 
 		 452 aa  53.5  0.000009  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_44250  predicted protein  28.57 
 
 		 632 aa  53.5  0.000009  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.755773  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0914  Dynamin family protein  35 
 
 		 548 aa  52.8  0.00001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.440355 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3346  putative GTPase  28.92 
 
 		 290 aa  52.8  0.00001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1273  Dynamin family protein  31.64 
 
 		 407 aa  53.1  0.00001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.0000000146438  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2251  putative GTPase  29.52 
 
 		 290 aa  53.1  0.00001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.796861  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0738  GTP-binding protein Era  29.73 
 
 		 301 aa  52.8  0.00001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.979215  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2968  dynamin family protein  30.39 
 
 		 583 aa  53.1  0.00001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3535  GTP-binding protein Era  32.14 
 
 		 324 aa  53.1  0.00001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0053  GTP-binding protein EngA  25.37 
 
 		 460 aa  53.1  0.00001  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1784  GTP-binding protein, HSR1-related  28.26 
 
 		 616 aa  52.4  0.00002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1629  GTPases  32.39 
 
 		 416 aa  52  0.00002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000232915  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1387  small GTP-binding protein  31.47 
 
 		 410 aa  52  0.00002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0637341  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1172  small GTP-binding protein  31.65 
 
 		 438 aa  52  0.00002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2251  GTP-binding protein Era  25.36 
 
 		 311 aa  51.6  0.00003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.41102  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1361  small GTP-binding protein  27.69 
 
 		 396 aa  51.6  0.00003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.311924  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16490  iron-only hydrogenase maturation protein HydF  30.6 
 
 		 416 aa  51.6  0.00003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.520712  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0596  hypothetical protein  29.57 
 
 		 357 aa  51.6  0.00003  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4417  GTP-binding protein Era  26.83 
 
 		 301 aa  52  0.00003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.0018216  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1387  GTP-binding protein Era  32.19 
 
 		 308 aa  51.2  0.00004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.263237  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2315  GTP-binding protein Era  27.75 
 
 		 298 aa  51.2  0.00004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1582  tRNA modification GTPase TrmE  32.87 
 
 		 462 aa  51.2  0.00004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1501  small GTP-binding protein  36.84 
 
 		 408 aa  51.2  0.00004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.206775  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0488  GTP-binding protein EngA  30.37 
 
 		 483 aa  51.2  0.00004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2317  GTP-binding protein EngA  31.43 
 
 		 470 aa  51.2  0.00004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.318648  normal  0.678652 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0762  GTP-binding protein EngA  30 
 
 		 467 aa  50.8  0.00005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0334743 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3026  GTP-binding protein Era  25.44 
 
 		 301 aa  50.8  0.00005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.552288  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0819  GTP-binding protein Era  26.83 
 
 		 301 aa  50.8  0.00005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000201776  decreased coverage  1.20434e-22 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1071  putative GTPase  28.92 
 
 		 290 aa  50.8  0.00005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0467468 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>