208 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cyan7425_4459 on replicon NC_011884
Organism: Cyanothece sp. PCC 7425



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011729  PCC7424_1326  small GTP-binding protein  65.13 
 
 
529 aa  645    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1544  small GTP-binding protein domain-containing protein  65.08 
 
 
517 aa  660    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0624831 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4459  small GTP-binding protein  100 
 
 
520 aa  1035    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.859915  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4593  small GTP-binding protein  66.13 
 
 
506 aa  633  1e-180  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.771946  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1351  small GTP-binding protein  61.06 
 
 
531 aa  612  9.999999999999999e-175  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000851094 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1322  small GTP-binding protein  61.06 
 
 
531 aa  613  9.999999999999999e-175  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1904  GTP-binding protein, HSR1-related  57.92 
 
 
545 aa  570  1e-161  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.30473  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1709  small GTP-binding protein domain-containing protein  57.59 
 
 
513 aa  531  1e-150  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.000711006  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_16501  GTPase SAR1 and related small G proteins  46.14 
 
 
532 aa  392  1e-108  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.569133 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1260  hypothetical protein  44.84 
 
 
529 aa  374  1e-102  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10221  GTPase SAR1 and related small G protein  41.72 
 
 
516 aa  362  9e-99  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.524471  normal  0.183753 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0145  small GTP-binding protein domain-containing protein  42.29 
 
 
517 aa  359  6e-98  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_07771  GTPase SAR1 and related small G proteins  42.07 
 
 
517 aa  359  8e-98  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.1398  normal  0.0362439 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1210  small GTP-binding protein domain-containing protein  40.5 
 
 
529 aa  353  5e-96  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_09441  GTPase SAR1 and related small G protein  31.58 
 
 
499 aa  280  4e-74  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_09451  GTPase SAR1  34.29 
 
 
499 aa  275  1.0000000000000001e-72  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_09991  GTPase SAR1 and related small G proteins  33.89 
 
 
496 aa  272  9e-72  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0884  small GTP-binding protein domain-containing protein  33.1 
 
 
499 aa  251  2e-65  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.102699  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4193  hypothetical protein  28.32 
 
 
471 aa  179  8e-44  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.296514 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0765  hypothetical protein  28.54 
 
 
472 aa  169  1e-40  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.860476 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0732  hypothetical protein  26.16 
 
 
481 aa  157  4e-37  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.00108673  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3840  hypothetical protein  27.6 
 
 
492 aa  153  8e-36  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.83902  normal  0.693476 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0107  small GTP-binding protein domain-containing protein  31.64 
 
 
472 aa  153  8.999999999999999e-36  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.130324  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5156  small GTP-binding protein  30.48 
 
 
566 aa  146  9e-34  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.61556 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0499  small GTP-binding protein  30.49 
 
 
475 aa  144  3e-33  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.362987  normal  0.723657 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2527  hypothetical protein  25.25 
 
 
463 aa  141  1.9999999999999998e-32  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3579  hypothetical protein  24.85 
 
 
463 aa  139  2e-31  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2529  hypothetical protein  24.9 
 
 
475 aa  136  9.999999999999999e-31  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3291  small GTP-binding protein domain-containing protein  28.91 
 
 
492 aa  129  1.0000000000000001e-28  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1616  small GTP-binding protein  28.65 
 
 
453 aa  128  2.0000000000000002e-28  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00206677 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5212  small GTP-binding protein  28.12 
 
 
489 aa  127  3e-28  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000545834 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1407  small GTP-binding protein  30.56 
 
 
479 aa  127  5e-28  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3709  small GTP-binding protein  28.64 
 
 
462 aa  127  6e-28  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1436  small GTP-binding protein  30.56 
 
 
479 aa  126  9e-28  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.741449  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1080  small GTP-binding protein  28.61 
 
 
484 aa  119  9.999999999999999e-26  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4509  small GTP-binding protein domain-containing protein  29.08 
 
 
457 aa  117  6.9999999999999995e-25  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2342  small GTP-binding protein  26.49 
 
 
448 aa  115  1.0000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2393  small GTP-binding protein  26.49 
 
 
448 aa  115  3e-24  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0993  hypothetical protein  29.02 
 
 
459 aa  111  3e-23  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.455493 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0497  GTPase  27.56 
 
 
420 aa  107  4e-22  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_15631  GTPase SAR1 and related small G protein  27.72 
 
 
440 aa  106  1e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0764  GTP-binding protein HSR1-related  28.04 
 
 
469 aa  104  5e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.796008  normal  0.847657 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3839  small GTP-binding protein  27.25 
 
 
481 aa  104  5e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.674432 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18431  GTPase SAR1 and related small G proteins  23.05 
 
 
440 aa  100  8e-20  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.491382 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0975  small GTP-binding protein domain-containing protein  23.05 
 
 
440 aa  99.4  1e-19  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2178  small GTP-binding protein domain-containing protein  28.38 
 
 
431 aa  99  2e-19  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.995116  normal  0.41065 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_04921  GTPase SAR1  30.79 
 
 
441 aa  93.6  7e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0942  hypothetical protein  35.81 
 
 
409 aa  81.6  0.00000000000003  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_16461  GTPase SAR1  22.11 
 
 
413 aa  80.9  0.00000000000005  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_16341  GTPase SAR1 and related small G protein  23.45 
 
 
413 aa  80.9  0.00000000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1041  hypothetical protein  36.21 
 
 
427 aa  77.4  0.0000000000005  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_18671  hypothetical protein  35.38 
 
 
454 aa  77  0.0000000000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.407902 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0036  hypothetical protein  33.82 
 
 
451 aa  73.9  0.000000000006  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10501  hypothetical protein  27.22 
 
 
452 aa  73.6  0.000000000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.546761  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06561  hypothetical protein  33.82 
 
 
451 aa  73.6  0.000000000008  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0586116  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1537  small GTP-binding protein domain-containing protein  24.42 
 
 
413 aa  68.2  0.0000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.273802  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_16231  GTPase SAR1 and related small G proteins  24.18 
 
 
413 aa  65.9  0.000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.283634  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_06651  hypothetical protein  27.48 
 
 
441 aa  62.4  0.00000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.19344  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1260  tRNA modification GTPase TrmE  32.86 
 
 
449 aa  61.6  0.00000003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6543  GTP-binding protein Era  29.59 
 
 
289 aa  61.2  0.00000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1806  GTP-binding protein Era  36.8 
 
 
297 aa  60.8  0.00000006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0584484  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0600  hypothetical protein  25.95 
 
 
444 aa  59.7  0.0000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_06561  hypothetical protein  25.81 
 
 
444 aa  59.7  0.0000001  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_06261  hypothetical protein  25.81 
 
 
444 aa  59.7  0.0000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.307417  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2392  tRNA modification GTPase TrmE  34.56 
 
 
468 aa  57  0.0000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0118764  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0914  Dynamin family protein  33.83 
 
 
548 aa  54.3  0.000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.440355 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1439  Dynamin family protein  32.48 
 
 
546 aa  54.3  0.000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.784928  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2638  small GTP-binding protein  26.67 
 
 
394 aa  53.9  0.000007  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0318  small GTP-binding protein domain-containing protein  33.08 
 
 
402 aa  53.9  0.000007  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1715  hypothetical protein  33.91 
 
 
192 aa  53.1  0.00001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.691695  normal  0.639266 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1915  tRNA modification GTPase TrmE  36.3 
 
 
457 aa  52.4  0.00002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.410866  normal  0.314403 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0042  small GTP-binding protein  27.78 
 
 
400 aa  52.4  0.00002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_35696  predicted protein  30.43 
 
 
410 aa  52.8  0.00002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2081  small GTP-binding protein  32.26 
 
 
416 aa  52  0.00003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000627073  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1224  ribosome-associated GTPase EngA  32.28 
 
 
447 aa  51.2  0.00004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1141  GTP-binding protein Era  29.41 
 
 
296 aa  50.8  0.00005  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.891303 
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0562  GTP-binding protein Era  28.66 
 
 
300 aa  50.8  0.00006  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  0.204296  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0759  putative GTPase  27.91 
 
 
291 aa  50.4  0.00007  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1683  labile enterotoxin output A  25.64 
 
 
568 aa  50.4  0.00007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.281657  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2968  dynamin family protein  31.65 
 
 
583 aa  50.4  0.00008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3591  GTP-binding protein Era  30.14 
 
 
308 aa  50.1  0.00009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1862  small GTP-binding protein  29.06 
 
 
398 aa  50.1  0.00009  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.803475  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0358  GTP-binding protein Era  30.06 
 
 
300 aa  49.7  0.0001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.954921  normal  0.603117 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2152  small GTP-binding protein  28.17 
 
 
409 aa  49.7  0.0001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3205  tRNA modification GTPase TrmE  34.4 
 
 
440 aa  49.3  0.0002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2276  small GTP-binding protein domain-containing protein  33.33 
 
 
400 aa  48.5  0.0003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0322  Dynamin family protein  33.33 
 
 
585 aa  48.5  0.0003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03489  tRNA modification GTPase TrmE  36.75 
 
 
446 aa  48.1  0.0003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4065  ribosome biogenesis GTP-binding protein YsxC  29.87 
 
 
201 aa  48.5  0.0003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1851  GTP-binding protein Era  32.33 
 
 
309 aa  48.1  0.0004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3806  ribosome-associated GTPase  27.87 
 
 
306 aa  47.8  0.0005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.482923  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3856  GTP-binding protein Era  24.68 
 
 
308 aa  47.8  0.0005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00601446  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3777  GTP-binding protein Era  27.39 
 
 
295 aa  47.8  0.0005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1640  GTP-binding protein Era  26.94 
 
 
307 aa  47.4  0.0006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0258714  hitchhiker  0.00261121 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4310  tRNA modification GTPase TrmE  33.91 
 
 
460 aa  47.4  0.0006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.671502  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0858  tRNA modification GTPase TrmE  35.25 
 
 
442 aa  47.4  0.0006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1243  small GTP-binding protein  33.86 
 
 
425 aa  47.4  0.0006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1215  ferrous iron transport protein B  30.14 
 
 
764 aa  47.4  0.0007  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3324  tRNA modification GTPase TrmE  29.63 
 
 
461 aa  47.4  0.0007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0089  tRNA modification GTPase TrmE  28.47 
 
 
455 aa  47.4  0.0007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>