More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC7424_1326 on replicon NC_011729
Organism: Cyanothece sp. PCC 7424



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013161  Cyan8802_1351  small GTP-binding protein  72.98 
 
 		 531 aa  753    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000851094 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1544  small GTP-binding protein domain-containing protein  68.35 
 
 		 517 aa  713    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0624831 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4593  small GTP-binding protein  68.87 
 
 		 506 aa  687    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.771946  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1322  small GTP-binding protein  72.98 
 
 		 531 aa  752    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1326  small GTP-binding protein  100 
 
 		 529 aa  1063    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4459  small GTP-binding protein  63.08 
 
 		 520 aa  609  1e-173  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.859915  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1904  GTP-binding protein, HSR1-related  58.92 
 
 		 545 aa  608  9.999999999999999e-173  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.30473  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1709  small GTP-binding protein domain-containing protein  60.9 
 
 		 513 aa  592  1e-168  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.000711006  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_16501  GTPase SAR1 and related small G proteins  43.11 
 
 		 532 aa  431  1e-119  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.569133 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1260  hypothetical protein  47.11 
 
 		 529 aa  411  1e-113  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10221  GTPase SAR1 and related small G protein  43.36 
 
 		 516 aa  406  1.0000000000000001e-112  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.524471  normal  0.183753 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1210  small GTP-binding protein domain-containing protein  48.68 
 
 		 529 aa  398  1e-109  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0145  small GTP-binding protein domain-containing protein  46.65 
 
 		 517 aa  388  1e-106  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_07771  GTPase SAR1 and related small G proteins  46.41 
 
 		 517 aa  388  1e-106  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.1398  normal  0.0362439 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_09991  GTPase SAR1 and related small G proteins  34.52 
 
 		 496 aa  283  8.000000000000001e-75  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_09441  GTPase SAR1 and related small G protein  32.9 
 
 		 499 aa  281  2e-74  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_09451  GTPase SAR1  34.64 
 
 		 499 aa  277  3e-73  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0884  small GTP-binding protein domain-containing protein  31.87 
 
 		 499 aa  271  2e-71  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.102699  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4193  hypothetical protein  27.57 
 
 		 471 aa  196  8.000000000000001e-49  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.296514 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0765  hypothetical protein  29.91 
 
 		 472 aa  191  4e-47  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.860476 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3840  hypothetical protein  28.09 
 
 		 492 aa  169  1e-40  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.83902  normal  0.693476 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0732  hypothetical protein  26.14 
 
 		 481 aa  166  1.0000000000000001e-39  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.00108673  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2529  hypothetical protein  30.17 
 
 		 475 aa  162  1e-38  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0107  small GTP-binding protein domain-containing protein  30.05 
 
 		 472 aa  155  2e-36  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.130324  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2527  hypothetical protein  27.18 
 
 		 463 aa  152  1e-35  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3579  hypothetical protein  27.58 
 
 		 463 aa  150  7e-35  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1616  small GTP-binding protein  30.28 
 
 		 453 aa  142  1.9999999999999998e-32  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00206677 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0499  small GTP-binding protein  28.64 
 
 		 475 aa  140  7e-32  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.362987  normal  0.723657 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0764  GTP-binding protein HSR1-related  29.47 
 
 		 469 aa  138  3.0000000000000003e-31  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.796008  normal  0.847657 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2342  small GTP-binding protein  28.57 
 
 		 448 aa  135  3e-30  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2393  small GTP-binding protein  28.5 
 
 		 448 aa  134  6e-30  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5156  small GTP-binding protein  26.88 
 
 		 566 aa  132  2.0000000000000002e-29  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.61556 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3709  small GTP-binding protein  28.15 
 
 		 462 aa  127  6e-28  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1436  small GTP-binding protein  30.63 
 
 		 479 aa  123  9e-27  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.741449  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1407  small GTP-binding protein  30.63 
 
 		 479 aa  123  9e-27  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3291  small GTP-binding protein domain-containing protein  28.4 
 
 		 492 aa  122  9.999999999999999e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5212  small GTP-binding protein  26.9 
 
 		 489 aa  123  9.999999999999999e-27  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000545834 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4509  small GTP-binding protein domain-containing protein  29.12 
 
 		 457 aa  119  9.999999999999999e-26  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1080  small GTP-binding protein  27.92 
 
 		 484 aa  119  1.9999999999999998e-25  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2178  small GTP-binding protein domain-containing protein  30.69 
 
 		 431 aa  117  3.9999999999999997e-25  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.995116  normal  0.41065 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0993  hypothetical protein  27.47 
 
 		 459 aa  113  8.000000000000001e-24  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.455493 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_15631  GTPase SAR1 and related small G protein  27.95 
 
 		 440 aa  111  3e-23  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0497  GTPase  25.26 
 
 		 420 aa  111  4.0000000000000004e-23  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3839  small GTP-binding protein  25.07 
 
 		 481 aa  105  3e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.674432 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18431  GTPase SAR1 and related small G proteins  23.34 
 
 		 440 aa  101  3e-20  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.491382 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0975  small GTP-binding protein domain-containing protein  23.03 
 
 		 440 aa  99.4  1e-19  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_04921  GTPase SAR1  30.58 
 
 		 441 aa  89  2e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0942  hypothetical protein  29.51 
 
 		 409 aa  79.7  0.0000000000001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10501  hypothetical protein  28.99 
 
 		 452 aa  79.7  0.0000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.546761  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_16461  GTPase SAR1  20.81 
 
 		 413 aa  79  0.0000000000002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0036  hypothetical protein  27.48 
 
 		 451 aa  73.9  0.000000000007  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_16341  GTPase SAR1 and related small G protein  21.84 
 
 		 413 aa  73.9  0.000000000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06561  hypothetical protein  27.48 
 
 		 451 aa  73.6  0.000000000009  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0586116  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_18671  hypothetical protein  27.87 
 
 		 454 aa  72.8  0.00000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.407902 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1041  hypothetical protein  27.12 
 
 		 427 aa  70.1  0.00000000009  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1537  small GTP-binding protein domain-containing protein  22.34 
 
 		 413 aa  69.3  0.0000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.273802  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_06261  hypothetical protein  24.1 
 
 		 444 aa  65.9  0.000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.307417  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_06561  hypothetical protein  24.53 
 
 		 444 aa  65.5  0.000000002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_16231  GTPase SAR1 and related small G proteins  23.6 
 
 		 413 aa  65.9  0.000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.283634  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1806  GTP-binding protein Era  37.21 
 
 		 297 aa  63.2  0.00000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0584484  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0600  hypothetical protein  24.79 
 
 		 444 aa  62  0.00000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_06651  hypothetical protein  22.35 
 
 		 441 aa  61.6  0.00000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.19344  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0042  small GTP-binding protein  29.1 
 
 		 400 aa  60.8  0.00000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1609  GTP-binding protein EngA  29.82 
 
 		 449 aa  60.5  0.00000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.0528486 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1937  GTP-binding protein EngA  29.82 
 
 		 449 aa  60.5  0.00000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2392  tRNA modification GTPase TrmE  32.59 
 
 		 468 aa  59.7  0.0000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0118764  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0759  putative GTPase  28.93 
 
 		 291 aa  58.9  0.0000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1683  labile enterotoxin output A  26.48 
 
 		 568 aa  58.5  0.0000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.281657  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6543  GTP-binding protein Era  29.2 
 
 		 289 aa  57.4  0.0000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2033  GTP-binding protein, HSR1-related  27.36 
 
 		 569 aa  57  0.0000009  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00291841 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2152  small GTP-binding protein  29.79 
 
 		 409 aa  56.2  0.000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1224  ribosome-associated GTPase EngA  34.13 
 
 		 447 aa  56.6  0.000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1260  tRNA modification GTPase TrmE  32.52 
 
 		 449 aa  55.8  0.000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1915  tRNA modification GTPase TrmE  39.17 
 
 		 457 aa  55.8  0.000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.410866  normal  0.314403 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1439  Dynamin family protein  29.31 
 
 		 546 aa  55.5  0.000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.784928  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2387  tRNA modification GTPase TrmE  34.1 
 
 		 465 aa  55.5  0.000003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.188748  hitchhiker  0.000106684 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4365  tRNA modification GTPase TrmE  25.89 
 
 		 461 aa  55.5  0.000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0632  Dynamin family protein  28.57 
 
 		 589 aa  55.1  0.000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3727  ribosome-associated GTPase EngA  37.01 
 
 		 518 aa  55.1  0.000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.966187  normal  0.288742 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0914  Dynamin family protein  32.19 
 
 		 548 aa  54.7  0.000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.440355 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2930  tRNA modification GTPase TrmE  34.09 
 
 		 458 aa  54.7  0.000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.137366  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2472  tRNA modification GTPase TrmE  31.32 
 
 		 487 aa  54.7  0.000004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000689916 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3346  putative GTPase  29.93 
 
 		 290 aa  54.7  0.000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4891  putative GTPase  29.93 
 
 		 290 aa  54.7  0.000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1393  putative GTPase  29.93 
 
 		 290 aa  54.3  0.000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.139964 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2251  putative GTPase  29.93 
 
 		 290 aa  54.3  0.000006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.796861  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1071  putative GTPase  35.79 
 
 		 290 aa  53.9  0.000006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0467468 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3142  tRNA modification GTPase TrmE  36.51 
 
 		 461 aa  53.9  0.000006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.108144  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0683  small GTP-binding protein  31.01 
 
 		 408 aa  53.9  0.000006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00203334  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2138  putative GTPase  29.93 
 
 		 290 aa  54.3  0.000006  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03489  tRNA modification GTPase TrmE  34.19 
 
 		 446 aa  53.9  0.000007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0208  GTP-binding protein Era  32.84 
 
 		 297 aa  53.5  0.000008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0318  small GTP-binding protein domain-containing protein  35 
 
 		 402 aa  53.9  0.000008  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1243  small GTP-binding protein  33.33 
 
 		 425 aa  53.5  0.000008  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3777  GTP-binding protein Era  32.28 
 
 		 295 aa  53.9  0.000008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1851  GTP-binding protein Era  33.33 
 
 		 309 aa  53.1  0.00001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0372  GTP-binding protein Era  28 
 
 		 297 aa  52.8  0.00002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0680727  normal  0.750756 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16490  iron-only hydrogenase maturation protein HydF  34.19 
 
 		 416 aa  52.4  0.00002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.520712  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4310  tRNA modification GTPase TrmE  30.91 
 
 		 460 aa  52.8  0.00002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.671502  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3256  small GTP-binding protein  28.29 
 
 		 412 aa  52.4  0.00002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00305193  hitchhiker  0.00001491 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>