36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PMN2A_0036 on replicon NC_007335
Organism: Prochlorococcus marinus str. NATL2A



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007335  PMN2A_0036  hypothetical protein  100 
 
 		 451 aa  909    Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06561  hypothetical protein  98.23 
 
 		 451 aa  895    Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0586116  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10501  hypothetical protein  52.41 
 
 		 452 aa  462  1e-129  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.546761  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_18671  hypothetical protein  50.71 
 
 		 454 aa  446  1.0000000000000001e-124  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.407902 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0942  hypothetical protein  44.15 
 
 		 409 aa  358  9.999999999999999e-98  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1041  hypothetical protein  46.45 
 
 		 427 aa  345  1e-93  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0600  hypothetical protein  36.95 
 
 		 444 aa  311  1e-83  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_06651  hypothetical protein  36.99 
 
 		 441 aa  308  1.0000000000000001e-82  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.19344  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_06561  hypothetical protein  36.7 
 
 		 444 aa  299  5e-80  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_06261  hypothetical protein  36.45 
 
 		 444 aa  298  1e-79  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.307417  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0993  hypothetical protein  35.12 
 
 		 459 aa  97.8  3e-19  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.455493 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2527  hypothetical protein  26.03 
 
 		 463 aa  89.7  1e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3579  hypothetical protein  25.88 
 
 		 463 aa  88.6  2e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4193  hypothetical protein  40.16 
 
 		 471 aa  87  7e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.296514 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3840  hypothetical protein  33.94 
 
 		 492 aa  80.9  0.00000000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.83902  normal  0.693476 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0765  hypothetical protein  29.07 
 
 		 472 aa  78.2  0.0000000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.860476 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1544  small GTP-binding protein domain-containing protein  32.06 
 
 		 517 aa  76.3  0.000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0624831 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1904  GTP-binding protein, HSR1-related  23.39 
 
 		 545 aa  75.1  0.000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.30473  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4459  small GTP-binding protein  33.82 
 
 		 520 aa  73.9  0.000000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.859915  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1326  small GTP-binding protein  27.48 
 
 		 529 aa  73.9  0.000000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1351  small GTP-binding protein  28.24 
 
 		 531 aa  72.8  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000851094 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1322  small GTP-binding protein  28.24 
 
 		 531 aa  72.8  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4593  small GTP-binding protein  32.35 
 
 		 506 aa  71.6  0.00000000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.771946  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2529  hypothetical protein  24.58 
 
 		 475 aa  70.1  0.00000000009  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1709  small GTP-binding protein domain-containing protein  28.57 
 
 		 513 aa  65.9  0.000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.000711006  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0732  hypothetical protein  30.5 
 
 		 481 aa  65.9  0.000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.00108673  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_16501  GTPase SAR1 and related small G proteins  24.11 
 
 		 532 aa  65.1  0.000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.569133 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1260  hypothetical protein  31.69 
 
 		 529 aa  62  0.00000002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10221  GTPase SAR1 and related small G protein  30.15 
 
 		 516 aa  55.8  0.000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.524471  normal  0.183753 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1210  small GTP-binding protein domain-containing protein  27.88 
 
 		 529 aa  55.8  0.000001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_09451  GTPase SAR1  29.82 
 
 		 499 aa  54.7  0.000004  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_09441  GTPase SAR1 and related small G protein  28.95 
 
 		 499 aa  53.1  0.000009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_09991  GTPase SAR1 and related small G proteins  22.86 
 
 		 496 aa  48.5  0.0002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_07771  GTPase SAR1 and related small G proteins  26.67 
 
 		 517 aa  45.4  0.002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.1398  normal  0.0362439 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0884  small GTP-binding protein domain-containing protein  28.07 
 
 		 499 aa  45.4  0.002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.102699  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0145  small GTP-binding protein domain-containing protein  26.23 
 
 		 517 aa  45.4  0.002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>