More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrub_0914 on replicon NC_013946
Organism: Meiothermus ruber DSM 1279



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013946  Mrub_0914  Dynamin family protein  100 
 
 
548 aa  1083    Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.440355 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1439  Dynamin family protein  59.85 
 
 
546 aa  615  1e-175  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.784928  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0632  Dynamin family protein  34 
 
 
589 aa  305  9.000000000000001e-82  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2968  dynamin family protein  36.49 
 
 
583 aa  304  2.0000000000000002e-81  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2213  Dynamin family protein  36.17 
 
 
587 aa  302  1e-80  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3531  dynamin family protein  35.96 
 
 
585 aa  283  6.000000000000001e-75  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1377  dynamin family protein  34.42 
 
 
585 aa  279  8e-74  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.682843  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2106  dynamin  35.8 
 
 
564 aa  236  6e-61  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.78205 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0322  Dynamin family protein  33.16 
 
 
585 aa  217  4e-55  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_44250  predicted protein  39.05 
 
 
632 aa  184  5.0000000000000004e-45  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.755773  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6878  Dynamin family protein  33.45 
 
 
620 aa  131  3e-29  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1193  hypothetical protein  30.36 
 
 
614 aa  121  3.9999999999999996e-26  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.108086  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2910  dynamin family protein  30.56 
 
 
605 aa  120  6e-26  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.518789  normal  0.400566 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2259  Dynamin family protein  26.48 
 
 
444 aa  119  9.999999999999999e-26  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000551632  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2994  dynamin family protein  31.19 
 
 
614 aa  119  9.999999999999999e-26  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.214598  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3036  dynamin family protein  31.19 
 
 
614 aa  119  9.999999999999999e-26  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0241135  normal  0.688737 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6880  Dynamin family protein  32.57 
 
 
1164 aa  112  1.0000000000000001e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1273  Dynamin family protein  30.94 
 
 
407 aa  108  4e-22  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.0000000146438  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2424  Dynamin family protein  34.12 
 
 
666 aa  100  8e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1095  dynamin  29.23 
 
 
588 aa  98.6  3e-19  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.845511  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1654  dynamin  28 
 
 
686 aa  90.5  7e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0311974  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1510  GTP-binding protein HSR1-related  24.15 
 
 
523 aa  87.4  7e-16  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0438  GTP-binding protein  26.28 
 
 
599 aa  86.3  0.000000000000001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0398  Dynamin family protein  26.44 
 
 
674 aa  85.5  0.000000000000003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2209  GTP-binding protein  29.08 
 
 
615 aa  80.5  0.00000000000007  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2196  dynamin family protein  28.1 
 
 
506 aa  79.3  0.0000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000046764 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1639  dynamin family protein  29.23 
 
 
605 aa  74.7  0.000000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.143429  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3291  small GTP-binding protein domain-containing protein  30.62 
 
 
492 aa  73.6  0.000000000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0933  dynamin family protein  27 
 
 
679 aa  72.8  0.00000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.807319  hitchhiker  0.00750508 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1654  dynamin family protein  29.35 
 
 
603 aa  73.2  0.00000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.964955 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0404  glucosamine fructose-6-phosphate aminotransferase (isomerizing)  29.41 
 
 
610 aa  71.2  0.00000000005  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1096  GTP-binding protein, HSR1-related  28 
 
 
664 aa  70.9  0.00000000006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3839  small GTP-binding protein  29.55 
 
 
481 aa  70.9  0.00000000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.674432 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5314  hypothetical protein  26.46 
 
 
952 aa  69.7  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0436  GTP-binding protein  28.05 
 
 
569 aa  68.9  0.0000000002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1545  GTP-binding protein  28.51 
 
 
569 aa  68.6  0.0000000003  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.712051  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1080  small GTP-binding protein  33.71 
 
 
484 aa  68.6  0.0000000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7004  GTP-binding protein HSR1-related  31.88 
 
 
610 aa  67.8  0.0000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.793634  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1762  Miro domain protein  30.88 
 
 
555 aa  67  0.0000000008  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0499  small GTP-binding protein  33.33 
 
 
475 aa  66.2  0.000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.362987  normal  0.723657 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6053  hypothetical protein  28.06 
 
 
570 aa  65.9  0.000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2392  Dynamin family protein  27.38 
 
 
1249 aa  65.9  0.000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5156  small GTP-binding protein  31.78 
 
 
566 aa  66.2  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.61556 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0337  conserved hypothetical protein, predicted ATP/GTP-binding protein  27.95 
 
 
605 aa  65.1  0.000000003  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1351  heat shock protein DnaJ-like  30 
 
 
741 aa  64.7  0.000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0473185 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0461  GTP-binding protein  27.15 
 
 
569 aa  63.9  0.000000006  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.0612543  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1350  dynamin  28.73 
 
 
693 aa  63.9  0.000000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0228271 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1896  Dynamin family protein  28.16 
 
 
1228 aa  63.9  0.000000007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00444431  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0372  hypothetical protein  26.27 
 
 
587 aa  63.5  0.000000008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5212  small GTP-binding protein  30.72 
 
 
489 aa  63.9  0.000000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000545834 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5313  hypothetical protein  27.84 
 
 
743 aa  63.5  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0403  dynamin family protein  25.63 
 
 
693 aa  63.2  0.00000001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1086  hypothetical protein  30.99 
 
 
551 aa  63.2  0.00000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  decreased coverage  0.00952601  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2342  small GTP-binding protein  29.04 
 
 
448 aa  63.2  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0860  GTP-binding protein  25.53 
 
 
601 aa  62.4  0.00000002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0830  hypothetical protein  22.67 
 
 
712 aa  62.4  0.00000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00896739  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7362  hypothetical protein  28.87 
 
 
564 aa  62.4  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0821059  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0815  GTPase  22.67 
 
 
712 aa  62.8  0.00000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2393  small GTP-binding protein  29.04 
 
 
448 aa  62  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0382  hypothetical protein  37.66 
 
 
652 aa  61.6  0.00000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.874173  normal  0.0118752 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1013  hypothetical protein  25 
 
 
1145 aa  61.2  0.00000005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.445275  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1530  hypothetical protein  24.1 
 
 
1146 aa  61.2  0.00000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.532706  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1501  hypothetical protein  24.1 
 
 
1146 aa  61.2  0.00000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3622  hypothetical protein  34.69 
 
 
654 aa  60.5  0.00000007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.300251  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39100  GTPase of unknown function  30.14 
 
 
617 aa  60.1  0.0000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  decreased coverage  0.0000974304  normal  0.356305 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1387  GTP-binding protein Era  31.55 
 
 
308 aa  59.7  0.0000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.263237  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_8770  predicted protein  26.4 
 
 
390 aa  59.7  0.0000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1354  GTP-binding protein HSR1-related protein  29.05 
 
 
542 aa  59.7  0.0000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0428896  hitchhiker  0.0000949376 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0624  hypothetical protein  28.97 
 
 
602 aa  59.7  0.0000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.318926  normal  0.0782013 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1616  small GTP-binding protein  28.1 
 
 
453 aa  60.1  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00206677 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0336  conserved hypothetical protein, predicted ATP/GTP-binding protein  29.59 
 
 
741 aa  59.3  0.0000002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3806  GTP-binding protein, HSR1-related  30.67 
 
 
527 aa  58.9  0.0000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0425817  normal  0.277341 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0117  tRNA modification GTPase TrmE  30.95 
 
 
455 aa  59.3  0.0000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0273  hypothetical protein  29.61 
 
 
608 aa  58.9  0.0000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2546  hypothetical protein  25.88 
 
 
719 aa  59.3  0.0000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0908682 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1546  GTP-binding protein  26.79 
 
 
728 aa  58.9  0.0000002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1322  small GTP-binding protein  34.46 
 
 
531 aa  58.9  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0460  GTP-binding protein  27.68 
 
 
728 aa  58.5  0.0000003  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.839985  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3240  hypothetical protein  31.74 
 
 
537 aa  58.5  0.0000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.41085  normal  0.440891 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1351  small GTP-binding protein  34.46 
 
 
531 aa  58.9  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000851094 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24690  GTPase of unknown function  28.49 
 
 
539 aa  58.5  0.0000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.6041  normal  0.0378138 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0435  GTP-binding protein  27.68 
 
 
728 aa  58.5  0.0000003  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0928  hypothetical protein  27.63 
 
 
540 aa  58.2  0.0000004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08870  hypothetical protein  29.5 
 
 
566 aa  58.2  0.0000004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0706838  normal  0.0205572 
 
 
-
 
NC_011690  PHATRDRAFT_30394  predicted protein  27.59 
 
 
559 aa  58.2  0.0000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.382636  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3265  putative ABC transporter  30.6 
 
 
532 aa  57.8  0.0000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.169453  normal  0.30236 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0859  GTP-binding protein  23.12 
 
 
692 aa  57.4  0.0000006  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.547864  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2560  AAA ATPase  24.5 
 
 
687 aa  57  0.0000008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002620  TC0076  GTP-binding protein EngA  27.78 
 
 
490 aa  56.6  0.000001  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.0791238  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1630  hypothetical protein  23.38 
 
 
1219 aa  56.6  0.000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00254693  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1083  hypothetical protein  25.59 
 
 
494 aa  56.6  0.000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011684  PHATRDRAFT_14787  predicted protein  28.19 
 
 
204 aa  56.6  0.000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1494  dynamin family protein  23.66 
 
 
1219 aa  56.6  0.000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.248245  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3234  hypothetical protein  35.92 
 
 
675 aa  56.6  0.000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.220852  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3535  GTP-binding protein Era  28.95 
 
 
324 aa  56.6  0.000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1653  GTP-binding protein, HSR1-related  24.24 
 
 
524 aa  56.6  0.000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0754256  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2545  dynamin  26.4 
 
 
390 aa  56.2  0.000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0649757  normal  0.0791445 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2547  dynamin  28.48 
 
 
551 aa  56.2  0.000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.164219 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0437  GTP-binding protein  25.26 
 
 
692 aa  56.6  0.000001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2220  putative ABC transporter  27.92 
 
 
619 aa  55.5  0.000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>