72 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jden_0928 on replicon NC_013174
Organism: Jonesia denitrificans DSM 20603



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013174  Jden_0928  hypothetical protein  100 
 
 		 540 aa  1053    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24740  hypothetical protein  44.51 
 
 		 551 aa  359  6e-98  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.043803  normal  0.105516 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1349  hypothetical protein  51.88 
 
 		 566 aa  307  4.0000000000000004e-82  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000440573 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1086  hypothetical protein  41.51 
 
 		 551 aa  307  4.0000000000000004e-82  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  decreased coverage  0.00952601  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2645  putative transcriptional regulator, TetR family  48.55 
 
 		 526 aa  257  5e-67  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08870  hypothetical protein  42.62 
 
 		 566 aa  238  1e-61  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0706838  normal  0.0205572 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08690  hypothetical protein  35.18 
 
 		 602 aa  201  3.9999999999999996e-50  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24320  hypothetical protein  35.84 
 
 		 584 aa  199  7.999999999999999e-50  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7362  hypothetical protein  31.92 
 
 		 564 aa  199  1.0000000000000001e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0821059  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1520  putative ABC transporter  38.2 
 
 		 576 aa  198  2.0000000000000003e-49  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.703438  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1572  putative ABC transporter  37.01 
 
 		 586 aa  198  2.0000000000000003e-49  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2560  AAA ATPase  35.08 
 
 		 687 aa  198  2.0000000000000003e-49  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2523  putative ABC transporter  36.58 
 
 		 571 aa  198  2.0000000000000003e-49  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1549  putative ABC transporter  37.01 
 
 		 586 aa  198  2.0000000000000003e-49  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1353  putative ABC transporter  38.67 
 
 		 667 aa  197  5.000000000000001e-49  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  hitchhiker  0.00435841  hitchhiker  0.000139423 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0079  putative ABC transporter  39.64 
 
 		 565 aa  197  6e-49  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.459634  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1324  hypothetical protein  32.75 
 
 		 569 aa  193  6e-48  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.577358  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2260  putative ABC transporter  35.08 
 
 		 571 aa  187  3e-46  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000139745 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1366  putative ABC transporter  39.93 
 
 		 572 aa  179  2e-43  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2641  putative ABC transporter  33.64 
 
 		 669 aa  172  2e-41  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.374728  normal  0.779452 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2220  putative ABC transporter  34.63 
 
 		 619 aa  169  1e-40  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8871  putative ABC transporter  39.14 
 
 		 629 aa  169  1e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.872872  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0932  hypothetical protein  35.59 
 
 		 650 aa  169  1e-40  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3266  putative ABC transporter  40.24 
 
 		 571 aa  168  2.9999999999999998e-40  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.025779  normal  0.223838 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1090  hypothetical protein  36.55 
 
 		 737 aa  158  3e-37  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3430  putative ABC transporter  33.24 
 
 		 631 aa  157  4e-37  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.790282  normal  0.301569 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24700  hypothetical protein  38.11 
 
 		 784 aa  154  2.9999999999999998e-36  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.303383  normal  0.0806263 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1736  putative ABC transporter  34.55 
 
 		 556 aa  83.2  0.00000000000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24310  hypothetical protein  38.35 
 
 		 568 aa  77  0.0000000000007  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3738  hypothetical protein  35.33 
 
 		 618 aa  75.9  0.000000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1735  putative ABC transporter  40.29 
 
 		 552 aa  74.3  0.000000000005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.43735  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1394  hypothetical protein  31.55 
 
 		 543 aa  71.6  0.00000000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1354  GTP-binding protein HSR1-related protein  36.18 
 
 		 542 aa  70.5  0.00000000008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0428896  hitchhiker  0.0000949376 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2640  GTP-binding protein HSR1-related protein  38.93 
 
 		 550 aa  69.3  0.0000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.133942  normal  0.721182 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08880  predicted GTPase  38.21 
 
 		 564 aa  66.2  0.000000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.141009  normal  0.0562111 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3429  hypothetical protein  31.98 
 
 		 802 aa  66.2  0.000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.224896 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24690  GTPase of unknown function  32.11 
 
 		 539 aa  65.1  0.000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.6041  normal  0.0378138 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0933  hypothetical protein  31.52 
 
 		 578 aa  64.7  0.000000004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2219  GTPase  28.63 
 
 		 673 aa  62.8  0.00000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1571  putative ABC transporter  29.79 
 
 		 525 aa  63.2  0.00000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1519  putative ABC transporter  29.79 
 
 		 525 aa  63.2  0.00000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1548  putative ABC transporter  29.79 
 
 		 525 aa  63.2  0.00000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1377  dynamin family protein  32.62 
 
 		 585 aa  62  0.00000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.682843  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7361  putative ABC transporter  29.86 
 
 		 547 aa  59.7  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.901699  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6775  putative ABC transporter  34.65 
 
 		 589 aa  60.1  0.0000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.122043  normal  0.131288 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3265  putative ABC transporter  34.92 
 
 		 532 aa  59.3  0.0000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.169453  normal  0.30236 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0080  GTP-binding protein HSR1-related protein  37.61 
 
 		 532 aa  58.9  0.0000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.170633  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0914  Dynamin family protein  27.63 
 
 		 548 aa  58.5  0.0000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.440355 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2522  putative ABC transporter  34.19 
 
 		 539 aa  58.2  0.0000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.504723  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1087  putative ABC transporter  30.99 
 
 		 523 aa  57  0.0000008  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0151577  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1350  putative ABC transporter  30.46 
 
 		 524 aa  57  0.0000008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.43815  hitchhiker  0.000106139 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3997  hypothetical protein  26.7 
 
 		 642 aa  57  0.0000009  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3531  dynamin family protein  32.33 
 
 		 585 aa  55.8  0.000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08700  hypothetical protein  31.13 
 
 		 586 aa  55.8  0.000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2559  putative ABC transporter  29.18 
 
 		 542 aa  56.2  0.000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1367  putative ABC transporter  28.25 
 
 		 555 aa  55.1  0.000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.621246  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1091  putative ABC transporter  30.11 
 
 		 585 aa  53.9  0.000008  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.631509  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1326  hypothetical protein  27.16 
 
 		 568 aa  53.1  0.00001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2259  GTP-binding protein HSR1-related  32.52 
 
 		 537 aa  53.5  0.00001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000117964 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0929  hypothetical protein  30.49 
 
 		 518 aa  53.1  0.00001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1439  Dynamin family protein  28.17 
 
 		 546 aa  53.5  0.00001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.784928  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2106  dynamin  27.62 
 
 		 564 aa  52.8  0.00002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.78205 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2644  ATP-binding membrane protein  30 
 
 		 453 aa  51.6  0.00003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.908609 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0632  Dynamin family protein  26.55 
 
 		 589 aa  51.2  0.00005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24730  predicted GTPase  30.46 
 
 		 517 aa  49.7  0.0001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0664672  normal  0.0671171 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2392  Dynamin family protein  26.58 
 
 		 1249 aa  50.1  0.0001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5212  small GTP-binding protein  25.64 
 
 		 489 aa  49.3  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000545834 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2213  Dynamin family protein  28.65 
 
 		 587 aa  48.1  0.0004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2968  dynamin family protein  28.47 
 
 		 583 aa  46.6  0.001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6880  Dynamin family protein  26.49 
 
 		 1164 aa  46.2  0.001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1013  hypothetical protein  19.66 
 
 		 1145 aa  45.4  0.003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.445275  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5156  small GTP-binding protein  28.21 
 
 		 566 aa  44.3  0.005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.61556 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>