80 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Achl_2260 on replicon NC_011886
Organism: Arthrobacter chlorophenolicus A6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011886  Achl_2260  putative ABC transporter  100 
 
 
571 aa  1095    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000139745 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2523  putative ABC transporter  73.56 
 
 
571 aa  793    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08690  hypothetical protein  56.74 
 
 
602 aa  541  9.999999999999999e-153  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24320  hypothetical protein  54.38 
 
 
584 aa  516  1.0000000000000001e-145  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1353  putative ABC transporter  51.71 
 
 
667 aa  492  9.999999999999999e-139  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  hitchhiker  0.00435841  hitchhiker  0.000139423 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2641  putative ABC transporter  54.08 
 
 
669 aa  472  1.0000000000000001e-131  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.374728  normal  0.779452 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0079  putative ABC transporter  53.42 
 
 
565 aa  464  1e-129  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.459634  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08870  hypothetical protein  48.52 
 
 
566 aa  435  1e-120  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0706838  normal  0.0205572 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1572  putative ABC transporter  48.72 
 
 
586 aa  431  1e-119  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1549  putative ABC transporter  48.72 
 
 
586 aa  431  1e-119  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3266  putative ABC transporter  48.91 
 
 
571 aa  426  1e-118  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.025779  normal  0.223838 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24700  hypothetical protein  49.28 
 
 
784 aa  424  1e-117  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.303383  normal  0.0806263 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1520  putative ABC transporter  48.17 
 
 
576 aa  423  1e-117  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.703438  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1090  hypothetical protein  48.89 
 
 
737 aa  416  9.999999999999999e-116  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8871  putative ABC transporter  47.83 
 
 
629 aa  415  1e-114  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.872872  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0932  hypothetical protein  44.65 
 
 
650 aa  394  1e-108  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1324  hypothetical protein  41.53 
 
 
569 aa  374  1e-102  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.577358  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1366  putative ABC transporter  44.38 
 
 
572 aa  361  2e-98  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7362  hypothetical protein  40.15 
 
 
564 aa  338  1.9999999999999998e-91  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0821059  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2560  AAA ATPase  38.69 
 
 
687 aa  322  9.999999999999999e-87  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3430  putative ABC transporter  36.64 
 
 
631 aa  288  2e-76  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.790282  normal  0.301569 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2220  putative ABC transporter  35.58 
 
 
619 aa  286  7e-76  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1349  hypothetical protein  41.62 
 
 
566 aa  205  2e-51  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000440573 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1086  hypothetical protein  38.94 
 
 
551 aa  196  8.000000000000001e-49  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  decreased coverage  0.00952601  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0928  hypothetical protein  37.72 
 
 
540 aa  191  4e-47  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24740  hypothetical protein  36.61 
 
 
551 aa  188  2e-46  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.043803  normal  0.105516 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2645  putative transcriptional regulator, TetR family  40.74 
 
 
526 aa  172  1e-41  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1736  putative ABC transporter  31.67 
 
 
556 aa  164  6e-39  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8870  putative ABC transporter  36.07 
 
 
590 aa  89.4  2e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0939636  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1354  GTP-binding protein HSR1-related protein  37 
 
 
542 aa  85.5  0.000000000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0428896  hitchhiker  0.0000949376 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3429  hypothetical protein  35.08 
 
 
802 aa  79  0.0000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.224896 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3265  putative ABC transporter  36.84 
 
 
532 aa  76.3  0.000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.169453  normal  0.30236 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0933  hypothetical protein  30.48 
 
 
578 aa  75.9  0.000000000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2640  GTP-binding protein HSR1-related protein  31.71 
 
 
550 aa  74.7  0.000000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.133942  normal  0.721182 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1326  hypothetical protein  30.54 
 
 
568 aa  70.9  0.00000000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2219  GTPase  34.63 
 
 
673 aa  70.5  0.00000000007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08880  predicted GTPase  33.49 
 
 
564 aa  69.7  0.0000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.141009  normal  0.0562111 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3738  hypothetical protein  33.85 
 
 
618 aa  68.6  0.0000000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24310  hypothetical protein  31.48 
 
 
568 aa  68.2  0.0000000004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24690  GTPase of unknown function  32.13 
 
 
539 aa  68.2  0.0000000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.6041  normal  0.0378138 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1091  putative ABC transporter  33.33 
 
 
585 aa  67.8  0.0000000005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.631509  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1519  putative ABC transporter  29.39 
 
 
525 aa  67.8  0.0000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08700  hypothetical protein  31.34 
 
 
586 aa  67  0.000000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1087  putative ABC transporter  31.37 
 
 
523 aa  66.6  0.000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0151577  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1735  putative ABC transporter  28.05 
 
 
552 aa  65.5  0.000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.43735  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1548  putative ABC transporter  28.72 
 
 
525 aa  65.9  0.000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1571  putative ABC transporter  28.72 
 
 
525 aa  65.9  0.000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1367  putative ABC transporter  31.07 
 
 
555 aa  65.5  0.000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.621246  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2259  GTP-binding protein HSR1-related  33 
 
 
537 aa  65.1  0.000000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000117964 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1394  hypothetical protein  30.1 
 
 
543 aa  64.7  0.000000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2522  putative ABC transporter  33.49 
 
 
539 aa  64.7  0.000000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.504723  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3997  hypothetical protein  26.2 
 
 
642 aa  63.2  0.00000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0080  GTP-binding protein HSR1-related protein  32.24 
 
 
532 aa  61.2  0.00000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.170633  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1350  putative ABC transporter  30.92 
 
 
524 aa  60.5  0.00000007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.43815  hitchhiker  0.000106139 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2559  putative ABC transporter  29.84 
 
 
542 aa  60.5  0.00000008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2644  ATP-binding membrane protein  34.2 
 
 
453 aa  60.5  0.00000008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.908609 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2106  dynamin  32.17 
 
 
564 aa  56.6  0.000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.78205 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7361  putative ABC transporter  30.77 
 
 
547 aa  55.8  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.901699  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6775  putative ABC transporter  31.03 
 
 
589 aa  54.3  0.000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.122043  normal  0.131288 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1439  Dynamin family protein  24.86 
 
 
546 aa  52  0.00003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.784928  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24730  predicted GTPase  28.71 
 
 
517 aa  51.6  0.00003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0664672  normal  0.0671171 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1306  dynamin family protein  23.83 
 
 
1219 aa  50.4  0.00008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.604786  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3715  hypothetical protein  24.49 
 
 
1219 aa  50.4  0.00008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1451  GTP1/OBG family GTPase  25 
 
 
1219 aa  50.1  0.0001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.472831  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1701  hypothetical protein  24.21 
 
 
1219 aa  48.9  0.0002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1630  hypothetical protein  23.86 
 
 
1219 aa  48.9  0.0002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00254693  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1741  hypothetical protein  24.21 
 
 
1219 aa  48.1  0.0004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000058782  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1665  hypothetical protein  24.21 
 
 
1219 aa  48.1  0.0005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0914  Dynamin family protein  27.03 
 
 
548 aa  47.8  0.0005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.440355 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1595  hypothetical protein  24.21 
 
 
1219 aa  47.8  0.0005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1451  GTP1/OBG family GTPase  24.21 
 
 
1219 aa  48.1  0.0005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1479  hypothetical protein  24.21 
 
 
1219 aa  47.8  0.0005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3531  dynamin family protein  29.22 
 
 
585 aa  47.4  0.0007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2392  Dynamin family protein  24.31 
 
 
1249 aa  47.4  0.0008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0322  Dynamin family protein  26.7 
 
 
585 aa  47  0.001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0826  ABC transporter related  26.53 
 
 
195 aa  45.1  0.003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0718774  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0929  hypothetical protein  24.63 
 
 
518 aa  44.7  0.004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1377  dynamin family protein  27.61 
 
 
585 aa  44.3  0.006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.682843  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2910  dynamin family protein  24.43 
 
 
605 aa  43.9  0.008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.518789  normal  0.400566 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6880  Dynamin family protein  29.08 
 
 
1164 aa  43.9  0.009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>