87 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hhal_1735 on replicon NC_008789
Organism: Halorhodospira halophila SL1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008789  Hhal_1735  putative ABC transporter  100 
 
 		 552 aa  1051    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.43735  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1519  putative ABC transporter  36.73 
 
 		 525 aa  202  9.999999999999999e-51  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1571  putative ABC transporter  36.73 
 
 		 525 aa  201  1.9999999999999998e-50  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1548  putative ABC transporter  36.73 
 
 		 525 aa  201  1.9999999999999998e-50  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7361  putative ABC transporter  43.77 
 
 		 547 aa  194  4e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.901699  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2559  putative ABC transporter  41.94 
 
 		 542 aa  193  6e-48  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2219  GTPase  36.81 
 
 		 673 aa  190  5.999999999999999e-47  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1354  GTP-binding protein HSR1-related protein  46.74 
 
 		 542 aa  186  9e-46  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0428896  hitchhiker  0.0000949376 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1326  hypothetical protein  36.36 
 
 		 568 aa  182  1e-44  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2640  GTP-binding protein HSR1-related protein  36.05 
 
 		 550 aa  181  2e-44  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.133942  normal  0.721182 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2522  putative ABC transporter  32.98 
 
 		 539 aa  179  8e-44  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.504723  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8870  putative ABC transporter  33.27 
 
 		 590 aa  177  3e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0939636  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3429  hypothetical protein  44.49 
 
 		 802 aa  177  5e-43  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.224896 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24690  GTPase of unknown function  36.46 
 
 		 539 aa  175  1.9999999999999998e-42  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.6041  normal  0.0378138 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08880  predicted GTPase  35.36 
 
 		 564 aa  172  1e-41  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.141009  normal  0.0562111 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0080  GTP-binding protein HSR1-related protein  44.09 
 
 		 532 aa  172  2e-41  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.170633  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2259  GTP-binding protein HSR1-related  42.06 
 
 		 537 aa  171  4e-41  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000117964 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1367  putative ABC transporter  46.28 
 
 		 555 aa  170  5e-41  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.621246  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3265  putative ABC transporter  45.19 
 
 		 532 aa  164  4.0000000000000004e-39  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.169453  normal  0.30236 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6775  putative ABC transporter  33.41 
 
 		 589 aa  159  1e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.122043  normal  0.131288 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1091  putative ABC transporter  41.92 
 
 		 585 aa  157  3e-37  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.631509  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1350  putative ABC transporter  37.83 
 
 		 524 aa  151  3e-35  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.43815  hitchhiker  0.000106139 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1087  putative ABC transporter  42.58 
 
 		 523 aa  144  5e-33  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0151577  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24730  predicted GTPase  39.04 
 
 		 517 aa  141  1.9999999999999998e-32  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0664672  normal  0.0671171 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24310  hypothetical protein  36.39 
 
 		 568 aa  137  5e-31  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08700  hypothetical protein  32.35 
 
 		 586 aa  133  7.999999999999999e-30  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0929  hypothetical protein  36.07 
 
 		 518 aa  132  1.0000000000000001e-29  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0933  hypothetical protein  37.74 
 
 		 578 aa  131  4.0000000000000003e-29  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2644  ATP-binding membrane protein  36.67 
 
 		 453 aa  127  5e-28  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.908609 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3430  putative ABC transporter  34.21 
 
 		 631 aa  94  6e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.790282  normal  0.301569 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7362  hypothetical protein  35.5 
 
 		 564 aa  85.1  0.000000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0821059  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2560  AAA ATPase  33 
 
 		 687 aa  84  0.000000000000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1349  hypothetical protein  35.84 
 
 		 566 aa  82.4  0.00000000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000440573 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2220  putative ABC transporter  31.42 
 
 		 619 aa  81.3  0.00000000000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0928  hypothetical protein  40.29 
 
 		 540 aa  74.3  0.000000000006  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24740  hypothetical protein  38.52 
 
 		 551 aa  70.9  0.00000000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.043803  normal  0.105516 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1324  hypothetical protein  29.86 
 
 		 569 aa  69.7  0.0000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.577358  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1086  hypothetical protein  37.41 
 
 		 551 aa  69.7  0.0000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  decreased coverage  0.00952601  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08870  hypothetical protein  32.18 
 
 		 566 aa  69.3  0.0000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0706838  normal  0.0205572 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24700  hypothetical protein  32.37 
 
 		 784 aa  68.6  0.0000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.303383  normal  0.0806263 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24320  hypothetical protein  33.18 
 
 		 584 aa  67.4  0.0000000006  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2645  putative transcriptional regulator, TetR family  37.78 
 
 		 526 aa  66.6  0.000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2968  dynamin family protein  28.99 
 
 		 583 aa  65.9  0.000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0079  putative ABC transporter  33.33 
 
 		 565 aa  65.5  0.000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.459634  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2260  putative ABC transporter  27.6 
 
 		 571 aa  65.1  0.000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000139745 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1394  hypothetical protein  31.22 
 
 		 543 aa  62.4  0.00000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0932  hypothetical protein  28.89 
 
 		 650 aa  62.8  0.00000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1572  putative ABC transporter  31.37 
 
 		 586 aa  61.6  0.00000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1549  putative ABC transporter  31.37 
 
 		 586 aa  61.6  0.00000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1353  putative ABC transporter  27.75 
 
 		 667 aa  62  0.00000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  hitchhiker  0.00435841  hitchhiker  0.000139423 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1520  putative ABC transporter  31.53 
 
 		 576 aa  61.2  0.00000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.703438  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2523  putative ABC transporter  28.38 
 
 		 571 aa  60.8  0.00000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8871  putative ABC transporter  38.26 
 
 		 629 aa  59.7  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.872872  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1439  Dynamin family protein  28.14 
 
 		 546 aa  58.9  0.0000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.784928  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1377  dynamin family protein  30.77 
 
 		 585 aa  57.4  0.0000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.682843  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3738  hypothetical protein  30.92 
 
 		 618 aa  57  0.000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2641  putative ABC transporter  30.53 
 
 		 669 aa  57  0.000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.374728  normal  0.779452 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0322  Dynamin family protein  31.15 
 
 		 585 aa  54.3  0.000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3531  dynamin family protein  36.36 
 
 		 585 aa  53.5  0.000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2213  Dynamin family protein  26.4 
 
 		 587 aa  53.1  0.00001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1090  hypothetical protein  32.74 
 
 		 737 aa  53.1  0.00001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1366  putative ABC transporter  28.8 
 
 		 572 aa  53.1  0.00001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08690  hypothetical protein  29.47 
 
 		 602 aa  52.8  0.00002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3266  putative ABC transporter  32.37 
 
 		 571 aa  52  0.00003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.025779  normal  0.223838 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0914  Dynamin family protein  28.57 
 
 		 548 aa  51.6  0.00003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.440355 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1896  Dynamin family protein  25.27 
 
 		 1228 aa  51.2  0.00005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00444431  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2106  dynamin  28.03 
 
 		 564 aa  50.8  0.00006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.78205 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2392  Dynamin family protein  26.74 
 
 		 1249 aa  50.4  0.00008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1116  GTP-binding protein Era  26.57 
 
 		 303 aa  49.3  0.0002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6880  Dynamin family protein  24.31 
 
 		 1164 aa  48.5  0.0003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0632  Dynamin family protein  25.43 
 
 		 589 aa  47.8  0.0005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2424  Dynamin family protein  22.61 
 
 		 666 aa  47.8  0.0005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0107  small GTP-binding protein domain-containing protein  32.56 
 
 		 472 aa  47.8  0.0005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.130324  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_15631  GTPase SAR1 and related small G protein  27.81 
 
 		 440 aa  47.4  0.0008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1501  hypothetical protein  23.12 
 
 		 1146 aa  46.2  0.001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1530  hypothetical protein  23.12 
 
 		 1146 aa  46.2  0.001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.532706  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1736  putative ABC transporter  51.16 
 
 		 556 aa  45.4  0.002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1388  GTP-binding protein HSR1-related protein  27.78 
 
 		 291 aa  45.4  0.002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1080  small GTP-binding protein  25.85 
 
 		 484 aa  45.4  0.003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01555  putative GTP-binding protein  24.34 
 
 		 294 aa  45.1  0.003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6878  Dynamin family protein  25.98 
 
 		 620 aa  45.1  0.003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0759  putative GTPase  27.03 
 
 		 291 aa  45.4  0.003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3202  putative GTPase  26.95 
 
 		 294 aa  45.4  0.003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3291  small GTP-binding protein domain-containing protein  27.62 
 
 		 492 aa  45.1  0.004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3997  hypothetical protein  24.43 
 
 		 642 aa  44.7  0.005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5156  small GTP-binding protein  28.73 
 
 		 566 aa  44.7  0.005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.61556 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0646  GTP-binding protein Era  20.54 
 
 		 305 aa  43.9  0.008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.601606  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>