72 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_0079 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013757  Gobs_0079  putative ABC transporter  100 
 
 		 565 aa  1062    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.459634  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8871  putative ABC transporter  57.22 
 
 		 629 aa  509  1e-143  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.872872  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1520  putative ABC transporter  52.14 
 
 		 576 aa  492  9.999999999999999e-139  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.703438  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1549  putative ABC transporter  52.32 
 
 		 586 aa  494  9.999999999999999e-139  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1572  putative ABC transporter  52.32 
 
 		 586 aa  494  9.999999999999999e-139  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3266  putative ABC transporter  55.4 
 
 		 571 aa  490  1e-137  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.025779  normal  0.223838 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2260  putative ABC transporter  53.42 
 
 		 571 aa  487  1e-136  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000139745 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08870  hypothetical protein  53.82 
 
 		 566 aa  483  1e-135  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0706838  normal  0.0205572 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2523  putative ABC transporter  51.2 
 
 		 571 aa  473  1e-132  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2641  putative ABC transporter  55.02 
 
 		 669 aa  451  1e-125  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.374728  normal  0.779452 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1353  putative ABC transporter  51.92 
 
 		 667 aa  445  1e-123  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  hitchhiker  0.00435841  hitchhiker  0.000139423 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24320  hypothetical protein  49.54 
 
 		 584 aa  437  1e-121  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08690  hypothetical protein  48.81 
 
 		 602 aa  422  1e-116  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24700  hypothetical protein  49.91 
 
 		 784 aa  409  1e-113  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.303383  normal  0.0806263 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1324  hypothetical protein  43.72 
 
 		 569 aa  392  1e-107  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.577358  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1366  putative ABC transporter  49.36 
 
 		 572 aa  382  1e-105  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0932  hypothetical protein  43.71 
 
 		 650 aa  379  1e-103  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7362  hypothetical protein  41.43 
 
 		 564 aa  367  1e-100  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0821059  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1090  hypothetical protein  48.19 
 
 		 737 aa  369  1e-100  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2560  AAA ATPase  41.42 
 
 		 687 aa  353  5e-96  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2220  putative ABC transporter  40.11 
 
 		 619 aa  319  7.999999999999999e-86  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3430  putative ABC transporter  38.48 
 
 		 631 aa  311  2e-83  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.790282  normal  0.301569 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1086  hypothetical protein  37.81 
 
 		 551 aa  218  2e-55  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  decreased coverage  0.00952601  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1349  hypothetical protein  45.3 
 
 		 566 aa  216  9.999999999999999e-55  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000440573 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24740  hypothetical protein  41.28 
 
 		 551 aa  216  9.999999999999999e-55  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.043803  normal  0.105516 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0928  hypothetical protein  41.09 
 
 		 540 aa  214  2.9999999999999995e-54  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2645  putative transcriptional regulator, TetR family  43.64 
 
 		 526 aa  197  3e-49  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1736  putative ABC transporter  33.33 
 
 		 556 aa  169  1e-40  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2522  putative ABC transporter  36.81 
 
 		 539 aa  78.6  0.0000000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.504723  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1735  putative ABC transporter  33.33 
 
 		 552 aa  77.4  0.0000000000006  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.43735  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08880  predicted GTPase  34.76 
 
 		 564 aa  76.6  0.000000000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.141009  normal  0.0562111 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24310  hypothetical protein  40.84 
 
 		 568 aa  75.5  0.000000000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1394  hypothetical protein  32.42 
 
 		 543 aa  75.1  0.000000000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1354  GTP-binding protein HSR1-related protein  35.23 
 
 		 542 aa  73.9  0.000000000006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0428896  hitchhiker  0.0000949376 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8870  putative ABC transporter  35.77 
 
 		 590 aa  71.6  0.00000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0939636  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1087  putative ABC transporter  35.56 
 
 		 523 aa  70.5  0.00000000007  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0151577  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0080  GTP-binding protein HSR1-related protein  37.63 
 
 		 532 aa  70.5  0.00000000008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.170633  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6775  putative ABC transporter  32.14 
 
 		 589 aa  68.9  0.0000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.122043  normal  0.131288 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3738  hypothetical protein  36.36 
 
 		 618 aa  68.2  0.0000000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1377  dynamin family protein  28.89 
 
 		 585 aa  65.9  0.000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.682843  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1519  putative ABC transporter  31.22 
 
 		 525 aa  63.9  0.000000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3265  putative ABC transporter  34.44 
 
 		 532 aa  63.5  0.000000008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.169453  normal  0.30236 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2259  GTP-binding protein HSR1-related  33.88 
 
 		 537 aa  63.5  0.00000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000117964 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3429  hypothetical protein  33.51 
 
 		 802 aa  62.4  0.00000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.224896 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1571  putative ABC transporter  30.8 
 
 		 525 aa  62.8  0.00000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1548  putative ABC transporter  30.8 
 
 		 525 aa  62.8  0.00000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2219  GTPase  32.39 
 
 		 673 aa  62  0.00000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1326  hypothetical protein  30.58 
 
 		 568 aa  61.6  0.00000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2640  GTP-binding protein HSR1-related protein  35.05 
 
 		 550 aa  61.2  0.00000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.133942  normal  0.721182 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24690  GTPase of unknown function  37.5 
 
 		 539 aa  60.8  0.00000007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.6041  normal  0.0378138 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2392  Dynamin family protein  25.45 
 
 		 1249 aa  60.5  0.00000008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3997  hypothetical protein  25.95 
 
 		 642 aa  59.7  0.0000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0632  Dynamin family protein  25.44 
 
 		 589 aa  59.3  0.0000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0933  hypothetical protein  32.54 
 
 		 578 aa  59.7  0.0000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3531  dynamin family protein  26.63 
 
 		 585 aa  58.9  0.0000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2559  putative ABC transporter  32.47 
 
 		 542 aa  57.8  0.0000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24730  predicted GTPase  28.72 
 
 		 517 aa  57.4  0.0000007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0664672  normal  0.0671171 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0929  hypothetical protein  29.03 
 
 		 518 aa  57  0.0000009  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1439  Dynamin family protein  26.92 
 
 		 546 aa  55.5  0.000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.784928  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2106  dynamin  32.85 
 
 		 564 aa  56.2  0.000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.78205 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1367  putative ABC transporter  30.51 
 
 		 555 aa  56.2  0.000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.621246  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08700  hypothetical protein  32.38 
 
 		 586 aa  56.2  0.000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0914  Dynamin family protein  29.75 
 
 		 548 aa  55.8  0.000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.440355 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1091  putative ABC transporter  32.21 
 
 		 585 aa  55.1  0.000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.631509  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7361  putative ABC transporter  32.22 
 
 		 547 aa  54.3  0.000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.901699  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2213  Dynamin family protein  28.42 
 
 		 587 aa  53.5  0.00001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1350  putative ABC transporter  29.84 
 
 		 524 aa  52.8  0.00002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.43815  hitchhiker  0.000106139 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2644  ATP-binding membrane protein  30.91 
 
 		 453 aa  51.2  0.00005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.908609 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0322  Dynamin family protein  31.25 
 
 		 585 aa  47.8  0.0006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6880  Dynamin family protein  25.56 
 
 		 1164 aa  47  0.0009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2968  dynamin family protein  25.68 
 
 		 583 aa  46.6  0.001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0264  GTP-binding protein  26.74 
 
 		 383 aa  43.5  0.01  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>