89 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bfae_24320 on replicon NC_013172
Organism: Brachybacterium faecium DSM 4810



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013172  Bfae_24320  hypothetical protein  100 
 
 		 584 aa  1115    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2260  putative ABC transporter  53.94 
 
 		 571 aa  522  1e-147  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000139745 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2523  putative ABC transporter  53.65 
 
 		 571 aa  522  1e-147  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08690  hypothetical protein  52.14 
 
 		 602 aa  475  1e-132  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1353  putative ABC transporter  50.9 
 
 		 667 aa  457  1e-127  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  hitchhiker  0.00435841  hitchhiker  0.000139423 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08870  hypothetical protein  48.46 
 
 		 566 aa  425  1e-118  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0706838  normal  0.0205572 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2641  putative ABC transporter  51.05 
 
 		 669 aa  420  1e-116  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.374728  normal  0.779452 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1090  hypothetical protein  48.52 
 
 		 737 aa  417  9.999999999999999e-116  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0079  putative ABC transporter  49.54 
 
 		 565 aa  409  1e-113  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.459634  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24700  hypothetical protein  46.23 
 
 		 784 aa  384  1e-105  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.303383  normal  0.0806263 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8871  putative ABC transporter  47.45 
 
 		 629 aa  369  1e-100  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.872872  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1572  putative ABC transporter  45.62 
 
 		 586 aa  364  3e-99  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1549  putative ABC transporter  45.62 
 
 		 586 aa  364  3e-99  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1520  putative ABC transporter  45.44 
 
 		 576 aa  362  1e-98  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.703438  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0932  hypothetical protein  39.56 
 
 		 650 aa  346  6e-94  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3266  putative ABC transporter  45.86 
 
 		 571 aa  345  1e-93  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.025779  normal  0.223838 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1366  putative ABC transporter  44.04 
 
 		 572 aa  332  9e-90  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1324  hypothetical protein  38.8 
 
 		 569 aa  318  1e-85  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.577358  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7362  hypothetical protein  38.73 
 
 		 564 aa  296  7e-79  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0821059  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3430  putative ABC transporter  35.01 
 
 		 631 aa  280  7e-74  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.790282  normal  0.301569 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2220  putative ABC transporter  34.47 
 
 		 619 aa  278  2e-73  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2560  AAA ATPase  35.59 
 
 		 687 aa  272  1e-71  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1086  hypothetical protein  34.86 
 
 		 551 aa  204  3e-51  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  decreased coverage  0.00952601  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0928  hypothetical protein  36.23 
 
 		 540 aa  199  1.0000000000000001e-49  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1349  hypothetical protein  36.48 
 
 		 566 aa  191  2e-47  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000440573 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24740  hypothetical protein  38.94 
 
 		 551 aa  191  2.9999999999999997e-47  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.043803  normal  0.105516 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2645  putative transcriptional regulator, TetR family  42.34 
 
 		 526 aa  170  6e-41  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1736  putative ABC transporter  30.88 
 
 		 556 aa  134  3e-30  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3738  hypothetical protein  31.67 
 
 		 618 aa  75.5  0.000000000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08880  predicted GTPase  34.87 
 
 		 564 aa  72  0.00000000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.141009  normal  0.0562111 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1735  putative ABC transporter  33.18 
 
 		 552 aa  67.4  0.0000000008  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.43735  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24310  hypothetical protein  34.29 
 
 		 568 aa  65.5  0.000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3997  hypothetical protein  30.08 
 
 		 642 aa  65.9  0.000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2522  putative ABC transporter  32.11 
 
 		 539 aa  65.9  0.000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.504723  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1354  GTP-binding protein HSR1-related protein  33.17 
 
 		 542 aa  64.7  0.000000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0428896  hitchhiker  0.0000949376 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1394  hypothetical protein  30.72 
 
 		 543 aa  62  0.00000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24690  GTPase of unknown function  32.73 
 
 		 539 aa  61.6  0.00000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.6041  normal  0.0378138 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3429  hypothetical protein  32.34 
 
 		 802 aa  61.6  0.00000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.224896 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1091  putative ABC transporter  33.88 
 
 		 585 aa  61.2  0.00000005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.631509  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0933  hypothetical protein  34.44 
 
 		 578 aa  61.2  0.00000005  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2640  GTP-binding protein HSR1-related protein  34.83 
 
 		 550 aa  61.2  0.00000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.133942  normal  0.721182 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2559  putative ABC transporter  34.93 
 
 		 542 aa  60.8  0.00000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2259  GTP-binding protein HSR1-related  32.16 
 
 		 537 aa  60.1  0.0000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000117964 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0080  GTP-binding protein HSR1-related protein  33.16 
 
 		 532 aa  60.5  0.0000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.170633  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1350  putative ABC transporter  32.11 
 
 		 524 aa  60.1  0.0000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.43815  hitchhiker  0.000106139 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1326  hypothetical protein  30.93 
 
 		 568 aa  58.9  0.0000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7361  putative ABC transporter  32.04 
 
 		 547 aa  58.5  0.0000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.901699  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1519  putative ABC transporter  30.25 
 
 		 525 aa  58.9  0.0000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1571  putative ABC transporter  29.83 
 
 		 525 aa  57.8  0.0000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1548  putative ABC transporter  29.83 
 
 		 525 aa  57.8  0.0000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08700  hypothetical protein  30.18 
 
 		 586 aa  57.8  0.0000005  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2106  dynamin  30.26 
 
 		 564 aa  57.4  0.0000006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.78205 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2392  Dynamin family protein  28.22 
 
 		 1249 aa  57  0.0000008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3531  dynamin family protein  28.44 
 
 		 585 aa  56.2  0.000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8870  putative ABC transporter  33.82 
 
 		 590 aa  56.6  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0939636  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2219  GTPase  30.3 
 
 		 673 aa  55.8  0.000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0322  Dynamin family protein  31.06 
 
 		 585 aa  55.5  0.000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6775  putative ABC transporter  30.69 
 
 		 589 aa  55.1  0.000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.122043  normal  0.131288 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1377  dynamin family protein  27.41 
 
 		 585 aa  54.7  0.000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.682843  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0929  hypothetical protein  31.36 
 
 		 518 aa  53.5  0.00001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24730  predicted GTPase  27.13 
 
 		 517 aa  53.1  0.00001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0664672  normal  0.0671171 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1087  putative ABC transporter  30.09 
 
 		 523 aa  53.1  0.00002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0151577  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3265  putative ABC transporter  32.8 
 
 		 532 aa  52.8  0.00002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.169453  normal  0.30236 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1367  putative ABC transporter  29.13 
 
 		 555 aa  50.4  0.00008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.621246  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0914  Dynamin family protein  27.38 
 
 		 548 aa  50.1  0.0001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.440355 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1501  hypothetical protein  21.27 
 
 		 1146 aa  49.7  0.0001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1530  hypothetical protein  21.27 
 
 		 1146 aa  49.7  0.0001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.532706  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6880  Dynamin family protein  28.87 
 
 		 1164 aa  48.5  0.0003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1630  hypothetical protein  24.86 
 
 		 1219 aa  48.5  0.0003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00254693  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3715  hypothetical protein  23.7 
 
 		 1219 aa  48.1  0.0004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1701  hypothetical protein  24.86 
 
 		 1219 aa  47.8  0.0005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1095  dynamin  26.39 
 
 		 588 aa  48.1  0.0005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.845511  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2968  dynamin family protein  27.27 
 
 		 583 aa  47.8  0.0006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2644  ATP-binding membrane protein  30.37 
 
 		 453 aa  47.8  0.0006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.908609 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0398  Dynamin family protein  25.71 
 
 		 674 aa  47.4  0.0007  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2213  Dynamin family protein  28.57 
 
 		 587 aa  47  0.0009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0499  small GTP-binding protein  26.73 
 
 		 475 aa  47  0.0009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.362987  normal  0.723657 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1665  hypothetical protein  24.86 
 
 		 1219 aa  45.8  0.002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1741  hypothetical protein  24.86 
 
 		 1219 aa  45.8  0.002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000058782  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1896  Dynamin family protein  21.95 
 
 		 1228 aa  46.2  0.002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00444431  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1306  dynamin family protein  24.44 
 
 		 1219 aa  45.8  0.002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.604786  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1273  Dynamin family protein  30.41 
 
 		 407 aa  45.8  0.002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.0000000146438  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1595  hypothetical protein  24.86 
 
 		 1219 aa  46.2  0.002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1451  GTP1/OBG family GTPase  24.86 
 
 		 1219 aa  45.8  0.002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.472831  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1451  GTP1/OBG family GTPase  24.86 
 
 		 1219 aa  45.8  0.002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1479  hypothetical protein  24.86 
 
 		 1219 aa  46.2  0.002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1439  Dynamin family protein  24.56 
 
 		 546 aa  46.2  0.002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.784928  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1494  dynamin family protein  23.53 
 
 		 1219 aa  45.4  0.003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.248245  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5156  small GTP-binding protein  30.66 
 
 		 566 aa  43.9  0.008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.61556 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>