69 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xcel_1091 on replicon NC_013530
Organism: Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013530  Xcel_1091  putative ABC transporter  100 
 
 		 585 aa  1106    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.631509  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2640  GTP-binding protein HSR1-related protein  56.6 
 
 		 550 aa  452  1.0000000000000001e-126  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.133942  normal  0.721182 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1354  GTP-binding protein HSR1-related protein  56.37 
 
 		 542 aa  404  1e-111  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0428896  hitchhiker  0.0000949376 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24690  GTPase of unknown function  51.02 
 
 		 539 aa  378  1e-103  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.6041  normal  0.0378138 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8870  putative ABC transporter  46.36 
 
 		 590 aa  358  1.9999999999999998e-97  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0939636  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2522  putative ABC transporter  44.56 
 
 		 539 aa  346  5e-94  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.504723  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1548  putative ABC transporter  42.48 
 
 		 525 aa  322  9.999999999999999e-87  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1571  putative ABC transporter  42.48 
 
 		 525 aa  322  9.999999999999999e-87  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1519  putative ABC transporter  42.31 
 
 		 525 aa  322  9.999999999999999e-87  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2259  GTP-binding protein HSR1-related  42.99 
 
 		 537 aa  317  5e-85  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000117964 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0080  GTP-binding protein HSR1-related protein  47.14 
 
 		 532 aa  300  7e-80  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.170633  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2559  putative ABC transporter  37.35 
 
 		 542 aa  278  2e-73  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1367  putative ABC transporter  40.93 
 
 		 555 aa  273  4.0000000000000004e-72  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.621246  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7361  putative ABC transporter  37.39 
 
 		 547 aa  270  7e-71  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.901699  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08880  predicted GTPase  40.73 
 
 		 564 aa  268  2e-70  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.141009  normal  0.0562111 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1326  hypothetical protein  38.05 
 
 		 568 aa  267  4e-70  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24310  hypothetical protein  41.57 
 
 		 568 aa  266  5.999999999999999e-70  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3265  putative ABC transporter  43.41 
 
 		 532 aa  266  7e-70  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.169453  normal  0.30236 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08700  hypothetical protein  41.11 
 
 		 586 aa  263  6e-69  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2219  GTPase  40.12 
 
 		 673 aa  262  1e-68  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6775  putative ABC transporter  34.07 
 
 		 589 aa  249  9e-65  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.122043  normal  0.131288 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0933  hypothetical protein  34.67 
 
 		 578 aa  224  3e-57  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3429  hypothetical protein  38.46 
 
 		 802 aa  223  7e-57  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.224896 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24730  predicted GTPase  45.68 
 
 		 517 aa  199  1.0000000000000001e-49  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0664672  normal  0.0671171 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1350  putative ABC transporter  43.58 
 
 		 524 aa  192  1e-47  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.43815  hitchhiker  0.000106139 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2644  ATP-binding membrane protein  45.69 
 
 		 453 aa  192  1e-47  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.908609 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1735  putative ABC transporter  34.45 
 
 		 552 aa  178  2e-43  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.43735  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1087  putative ABC transporter  40.57 
 
 		 523 aa  178  2e-43  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0151577  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0929  hypothetical protein  38.73 
 
 		 518 aa  178  3e-43  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2220  putative ABC transporter  32.27 
 
 		 619 aa  80.9  0.00000000000006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2523  putative ABC transporter  31.75 
 
 		 571 aa  73.6  0.00000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2260  putative ABC transporter  33.91 
 
 		 571 aa  71.2  0.00000000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000139745 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7362  hypothetical protein  30.3 
 
 		 564 aa  69.3  0.0000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0821059  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3430  putative ABC transporter  30.77 
 
 		 631 aa  69.3  0.0000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.790282  normal  0.301569 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1353  putative ABC transporter  34.32 
 
 		 667 aa  68.9  0.0000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  hitchhiker  0.00435841  hitchhiker  0.000139423 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08690  hypothetical protein  29.11 
 
 		 602 aa  66.2  0.000000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8871  putative ABC transporter  32.92 
 
 		 629 aa  65.5  0.000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.872872  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24320  hypothetical protein  32.56 
 
 		 584 aa  64.7  0.000000004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1349  hypothetical protein  31.25 
 
 		 566 aa  64.3  0.000000006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000440573 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3266  putative ABC transporter  34.95 
 
 		 571 aa  63.9  0.000000008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.025779  normal  0.223838 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2560  AAA ATPase  30.42 
 
 		 687 aa  63.2  0.00000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1086  hypothetical protein  31.41 
 
 		 551 aa  60.8  0.00000006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  decreased coverage  0.00952601  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08870  hypothetical protein  29.81 
 
 		 566 aa  60.5  0.00000009  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0706838  normal  0.0205572 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1324  hypothetical protein  28.41 
 
 		 569 aa  58.9  0.0000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.577358  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2392  Dynamin family protein  26.52 
 
 		 1249 aa  58.5  0.0000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3997  hypothetical protein  30 
 
 		 642 aa  58.9  0.0000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2645  putative transcriptional regulator, TetR family  31.25 
 
 		 526 aa  57.8  0.0000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2641  putative ABC transporter  30.64 
 
 		 669 aa  55.8  0.000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.374728  normal  0.779452 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24740  hypothetical protein  30.37 
 
 		 551 aa  55.8  0.000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.043803  normal  0.105516 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11400  selenocysteine-specific elongation factor SelB  29.94 
 
 		 657 aa  55.8  0.000002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0932  hypothetical protein  30.52 
 
 		 650 aa  55.1  0.000004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1549  putative ABC transporter  31.45 
 
 		 586 aa  53.5  0.00001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1572  putative ABC transporter  31.45 
 
 		 586 aa  53.5  0.00001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1520  putative ABC transporter  31.05 
 
 		 576 aa  52.8  0.00002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.703438  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0928  hypothetical protein  30.51 
 
 		 540 aa  50.4  0.00008  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5013  GTP-binding proten HflX  40.4 
 
 		 404 aa  50.4  0.00008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0596854  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24700  hypothetical protein  32.27 
 
 		 784 aa  50.1  0.0001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.303383  normal  0.0806263 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1739  ferrous iron transport protein B  26.05 
 
 		 646 aa  48.9  0.0002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00069018  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1896  Dynamin family protein  22.76 
 
 		 1228 aa  49.3  0.0002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00444431  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0079  putative ABC transporter  31.73 
 
 		 565 aa  48.1  0.0004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.459634  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0914  Dynamin family protein  24.48 
 
 		 548 aa  47.4  0.0007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.440355 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2142  GTP-binding protein HFLX  29.12 
 
 		 444 aa  47.4  0.0008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.501341  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1366  putative ABC transporter  29.3 
 
 		 572 aa  46.6  0.001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1394  hypothetical protein  27.15 
 
 		 543 aa  46.2  0.002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3738  hypothetical protein  25 
 
 		 618 aa  45.4  0.003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1090  hypothetical protein  34.81 
 
 		 737 aa  45.1  0.003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2213  Dynamin family protein  23.28 
 
 		 587 aa  44.3  0.006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1277  small GTP-binding protein domain-containing protein  25.55 
 
 		 405 aa  43.9  0.008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.038791  hitchhiker  0.00000385407 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0146  small GTP-binding protein  27.11 
 
 		 398 aa  43.5  0.01  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0325934  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>