78 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bfae_24310 on replicon NC_013172
Organism: Brachybacterium faecium DSM 4810



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013172  Bfae_24310  hypothetical protein  100 
 
 		 568 aa  1056    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2259  GTP-binding protein HSR1-related  49.7 
 
 		 537 aa  369  1e-101  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000117964 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2522  putative ABC transporter  48.02 
 
 		 539 aa  372  1e-101  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.504723  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08700  hypothetical protein  48.72 
 
 		 586 aa  339  7e-92  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1519  putative ABC transporter  42.6 
 
 		 525 aa  303  7.000000000000001e-81  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1571  putative ABC transporter  42.24 
 
 		 525 aa  298  3e-79  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1548  putative ABC transporter  42.24 
 
 		 525 aa  298  3e-79  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2640  GTP-binding protein HSR1-related protein  46.57 
 
 		 550 aa  291  2e-77  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.133942  normal  0.721182 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1354  GTP-binding protein HSR1-related protein  47.9 
 
 		 542 aa  285  2.0000000000000002e-75  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0428896  hitchhiker  0.0000949376 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1091  putative ABC transporter  44.24 
 
 		 585 aa  280  7e-74  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.631509  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8870  putative ABC transporter  40.04 
 
 		 590 aa  274  3e-72  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0939636  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24690  GTPase of unknown function  41.65 
 
 		 539 aa  271  2e-71  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.6041  normal  0.0378138 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08880  predicted GTPase  38.29 
 
 		 564 aa  262  1e-68  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.141009  normal  0.0562111 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0080  GTP-binding protein HSR1-related protein  41.34 
 
 		 532 aa  241  4e-62  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.170633  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2559  putative ABC transporter  36.03 
 
 		 542 aa  239  9e-62  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1326  hypothetical protein  35.58 
 
 		 568 aa  232  2e-59  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1367  putative ABC transporter  39.17 
 
 		 555 aa  228  2e-58  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.621246  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7361  putative ABC transporter  36.03 
 
 		 547 aa  225  2e-57  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.901699  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0933  hypothetical protein  34.98 
 
 		 578 aa  221  3e-56  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2219  GTPase  35.58 
 
 		 673 aa  219  1e-55  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3429  hypothetical protein  35.15 
 
 		 802 aa  213  5.999999999999999e-54  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.224896 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3265  putative ABC transporter  41.74 
 
 		 532 aa  213  1e-53  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.169453  normal  0.30236 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6775  putative ABC transporter  30.22 
 
 		 589 aa  171  3e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.122043  normal  0.131288 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1350  putative ABC transporter  40.21 
 
 		 524 aa  156  9e-37  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.43815  hitchhiker  0.000106139 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24730  predicted GTPase  42.32 
 
 		 517 aa  153  8e-36  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0664672  normal  0.0671171 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1735  putative ABC transporter  36.99 
 
 		 552 aa  150  7e-35  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.43735  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0929  hypothetical protein  38.37 
 
 		 518 aa  146  8.000000000000001e-34  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1087  putative ABC transporter  38.36 
 
 		 523 aa  144  5e-33  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0151577  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2644  ATP-binding membrane protein  41.15 
 
 		 453 aa  136  9.999999999999999e-31  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.908609 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0928  hypothetical protein  41.35 
 
 		 540 aa  81.6  0.00000000000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2220  putative ABC transporter  34.36 
 
 		 619 aa  81.3  0.00000000000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08870  hypothetical protein  35.75 
 
 		 566 aa  80.9  0.00000000000006  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0706838  normal  0.0205572 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1349  hypothetical protein  35.75 
 
 		 566 aa  80.1  0.0000000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000440573 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3430  putative ABC transporter  34.32 
 
 		 631 aa  76.6  0.000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.790282  normal  0.301569 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0079  putative ABC transporter  40.84 
 
 		 565 aa  73.9  0.000000000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.459634  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2523  putative ABC transporter  32.49 
 
 		 571 aa  73.6  0.000000000008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1086  hypothetical protein  32.65 
 
 		 551 aa  73.6  0.00000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  decreased coverage  0.00952601  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08690  hypothetical protein  32.14 
 
 		 602 aa  70.9  0.00000000006  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24740  hypothetical protein  35.48 
 
 		 551 aa  70.9  0.00000000007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.043803  normal  0.105516 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2641  putative ABC transporter  33.87 
 
 		 669 aa  70.5  0.00000000009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.374728  normal  0.779452 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3738  hypothetical protein  32.18 
 
 		 618 aa  70.1  0.0000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2260  putative ABC transporter  31.88 
 
 		 571 aa  68.9  0.0000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000139745 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2560  AAA ATPase  39.1 
 
 		 687 aa  69.3  0.0000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8871  putative ABC transporter  38.28 
 
 		 629 aa  68.9  0.0000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.872872  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3266  putative ABC transporter  30.04 
 
 		 571 aa  68.2  0.0000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.025779  normal  0.223838 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1394  hypothetical protein  28.64 
 
 		 543 aa  67.4  0.0000000006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1549  putative ABC transporter  40.62 
 
 		 586 aa  67.8  0.0000000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1572  putative ABC transporter  40.62 
 
 		 586 aa  67.8  0.0000000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1520  putative ABC transporter  40.62 
 
 		 576 aa  67.4  0.0000000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.703438  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24320  hypothetical protein  36.11 
 
 		 584 aa  67  0.0000000009  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1324  hypothetical protein  33.33 
 
 		 569 aa  67  0.0000000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.577358  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1353  putative ABC transporter  33.33 
 
 		 667 aa  66.6  0.000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  hitchhiker  0.00435841  hitchhiker  0.000139423 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1366  putative ABC transporter  33.33 
 
 		 572 aa  65.9  0.000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7362  hypothetical protein  33.33 
 
 		 564 aa  65.1  0.000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0821059  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2645  putative transcriptional regulator, TetR family  35.34 
 
 		 526 aa  63.2  0.00000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0932  hypothetical protein  33.51 
 
 		 650 aa  60.8  0.00000006  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24700  hypothetical protein  31.85 
 
 		 784 aa  58.9  0.0000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.303383  normal  0.0806263 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2392  Dynamin family protein  26.97 
 
 		 1249 aa  57  0.0000008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1896  Dynamin family protein  26.29 
 
 		 1228 aa  55.8  0.000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00444431  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3997  hypothetical protein  26.32 
 
 		 642 aa  54.3  0.000006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1736  putative ABC transporter  33.33 
 
 		 556 aa  52.4  0.00002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1090  hypothetical protein  36.3 
 
 		 737 aa  52.4  0.00002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1451  GTP1/OBG family GTPase  23.94 
 
 		 1219 aa  51.6  0.00004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.472831  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1595  hypothetical protein  23.94 
 
 		 1219 aa  51.2  0.00004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1451  GTP1/OBG family GTPase  23.94 
 
 		 1219 aa  51.6  0.00004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1479  hypothetical protein  23.94 
 
 		 1219 aa  51.2  0.00004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1665  hypothetical protein  21.4 
 
 		 1219 aa  51.6  0.00004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1741  hypothetical protein  23.94 
 
 		 1219 aa  51.2  0.00005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000058782  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1494  dynamin family protein  22.49 
 
 		 1219 aa  50.8  0.00006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.248245  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1306  dynamin family protein  20.75 
 
 		 1219 aa  50.1  0.0001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.604786  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0759  putative GTPase  26.7 
 
 		 291 aa  49.7  0.0002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1701  hypothetical protein  23.4 
 
 		 1219 aa  49.3  0.0002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3715  hypothetical protein  22.01 
 
 		 1219 aa  48.9  0.0002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1630  hypothetical protein  22.01 
 
 		 1219 aa  48.1  0.0004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00254693  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0107  small GTP-binding protein domain-containing protein  29.59 
 
 		 472 aa  46.2  0.001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.130324  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2032  ribosome biogenesis GTP-binding protein YsxC  24.76 
 
 		 192 aa  46.2  0.002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.0524569 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3433  GTP-binding protein HSR1-related  23.62 
 
 		 291 aa  45.4  0.003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5156  small GTP-binding protein  26.8 
 
 		 566 aa  43.5  0.009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.61556 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>