84 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_7361 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_7361  putative ABC transporter  100 
 
 		 547 aa  1076    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.901699  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2559  putative ABC transporter  70.04 
 
 		 542 aa  729    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1326  hypothetical protein  51.32 
 
 		 568 aa  462  1e-129  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3429  hypothetical protein  44.4 
 
 		 802 aa  389  1e-106  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.224896 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2219  GTPase  45.56 
 
 		 673 aa  389  1e-106  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1519  putative ABC transporter  42.16 
 
 		 525 aa  328  2.0000000000000001e-88  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1548  putative ABC transporter  41.96 
 
 		 525 aa  327  2.0000000000000001e-88  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1571  putative ABC transporter  41.96 
 
 		 525 aa  327  2.0000000000000001e-88  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8870  putative ABC transporter  37.85 
 
 		 590 aa  291  2e-77  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0939636  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2522  putative ABC transporter  40.35 
 
 		 539 aa  288  2e-76  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.504723  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0080  GTP-binding protein HSR1-related protein  44.47 
 
 		 532 aa  274  3e-72  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.170633  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1367  putative ABC transporter  37.25 
 
 		 555 aa  269  1e-70  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.621246  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2259  GTP-binding protein HSR1-related  38.73 
 
 		 537 aa  261  3e-68  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000117964 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08880  predicted GTPase  37.66 
 
 		 564 aa  258  1e-67  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.141009  normal  0.0562111 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1091  putative ABC transporter  38.93 
 
 		 585 aa  251  2e-65  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.631509  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3265  putative ABC transporter  40.79 
 
 		 532 aa  248  2e-64  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.169453  normal  0.30236 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2640  GTP-binding protein HSR1-related protein  39.35 
 
 		 550 aa  239  9e-62  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.133942  normal  0.721182 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1354  GTP-binding protein HSR1-related protein  41.96 
 
 		 542 aa  233  5e-60  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0428896  hitchhiker  0.0000949376 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24690  GTPase of unknown function  37.42 
 
 		 539 aa  229  1e-58  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.6041  normal  0.0378138 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1350  putative ABC transporter  46.79 
 
 		 524 aa  221  1.9999999999999999e-56  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.43815  hitchhiker  0.000106139 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24730  predicted GTPase  46.95 
 
 		 517 aa  214  1.9999999999999998e-54  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0664672  normal  0.0671171 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6775  putative ABC transporter  32.72 
 
 		 589 aa  213  7e-54  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.122043  normal  0.131288 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2644  ATP-binding membrane protein  43.58 
 
 		 453 aa  201  3e-50  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.908609 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24310  hypothetical protein  36.16 
 
 		 568 aa  196  8.000000000000001e-49  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0929  hypothetical protein  40.92 
 
 		 518 aa  193  5e-48  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1735  putative ABC transporter  43.77 
 
 		 552 aa  193  6e-48  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.43735  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08700  hypothetical protein  33.91 
 
 		 586 aa  191  2e-47  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0933  hypothetical protein  32.47 
 
 		 578 aa  188  3e-46  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1087  putative ABC transporter  39.55 
 
 		 523 aa  181  4e-44  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0151577  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1394  hypothetical protein  29.95 
 
 		 543 aa  70.5  0.00000000008  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1086  hypothetical protein  33.16 
 
 		 551 aa  66.2  0.000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  decreased coverage  0.00952601  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7362  hypothetical protein  37.96 
 
 		 564 aa  62.8  0.00000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0821059  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2220  putative ABC transporter  34.51 
 
 		 619 aa  62  0.00000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2560  AAA ATPase  33.33 
 
 		 687 aa  61.6  0.00000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0928  hypothetical protein  36.09 
 
 		 540 aa  59.7  0.0000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1324  hypothetical protein  33.51 
 
 		 569 aa  59.7  0.0000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.577358  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1349  hypothetical protein  37.12 
 
 		 566 aa  59.7  0.0000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000440573 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3430  putative ABC transporter  35.34 
 
 		 631 aa  59.7  0.0000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.790282  normal  0.301569 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24320  hypothetical protein  34.67 
 
 		 584 aa  57.8  0.0000005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2645  putative transcriptional regulator, TetR family  32.81 
 
 		 526 aa  57  0.0000009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24740  hypothetical protein  31.82 
 
 		 551 aa  56.2  0.000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.043803  normal  0.105516 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2260  putative ABC transporter  30.77 
 
 		 571 aa  55.8  0.000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000139745 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08690  hypothetical protein  31.12 
 
 		 602 aa  55.5  0.000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08870  hypothetical protein  30.27 
 
 		 566 aa  55.8  0.000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0706838  normal  0.0205572 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1353  putative ABC transporter  32.07 
 
 		 667 aa  55.1  0.000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  hitchhiker  0.00435841  hitchhiker  0.000139423 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2523  putative ABC transporter  31.66 
 
 		 571 aa  54.3  0.000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3997  hypothetical protein  30.56 
 
 		 642 aa  51.6  0.00004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1633  GTP-binding proten HflX  29.91 
 
 		 441 aa  50.1  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.192278  normal  0.293033 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2301  small GTP-binding protein domain-containing protein  30.61 
 
 		 382 aa  49.7  0.0001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.772558  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2142  GTP-binding protein HFLX  30.2 
 
 		 444 aa  49.3  0.0002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.501341  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1736  putative ABC transporter  28.21 
 
 		 556 aa  49.3  0.0002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1520  putative ABC transporter  31.75 
 
 		 576 aa  49.3  0.0002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.703438  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0932  hypothetical protein  30.05 
 
 		 650 aa  48.5  0.0003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1572  putative ABC transporter  31.19 
 
 		 586 aa  48.5  0.0003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1549  putative ABC transporter  31.19 
 
 		 586 aa  48.5  0.0003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0759  putative GTPase  26.11 
 
 		 291 aa  48.5  0.0003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6880  Dynamin family protein  26.88 
 
 		 1164 aa  47.4  0.0006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1344  GTP-binding protein Era  23.53 
 
 		 302 aa  47.4  0.0007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000010527  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5013  GTP-binding proten HflX  29.21 
 
 		 404 aa  47.4  0.0007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0596854  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4723  putative GTPase HflX  26.58 
 
 		 426 aa  46.6  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4780  putative GTPase HflX  26.58 
 
 		 426 aa  46.6  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0452958  normal  0.331117 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4630  putative GTPase HflX  26.58 
 
 		 426 aa  46.6  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.048412  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4759  putative GTPase HflX  26.58 
 
 		 426 aa  46.2  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1268  LAO/AO transport system ATPase  31.18 
 
 		 312 aa  46.6  0.001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4640  putative GTPase HflX  26.58 
 
 		 426 aa  46.6  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.208484  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1820  GTP-binding proten HflX  28.91 
 
 		 441 aa  46.2  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0332414  normal  0.106789 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2180  tRNA modification GTPase TrmE  24.44 
 
 		 472 aa  45.8  0.002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1538  GTP-binding protein, HSR1-related  26.58 
 
 		 259 aa  44.7  0.005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0356  putative GTPase HflX  27.9 
 
 		 426 aa  44.7  0.005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.152366  hitchhiker  0.00466267 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1155  protein synthesis factor GTP-binding  25.51 
 
 		 545 aa  44.7  0.005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.552147  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1896  Dynamin family protein  21.63 
 
 		 1228 aa  43.9  0.007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00444431  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0816  ribosome biogenesis GTP-binding protein YsxC  35.59 
 
 		 216 aa  43.9  0.007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.720609  normal  0.865249 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8871  putative ABC transporter  28.51 
 
 		 629 aa  43.9  0.008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.872872  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04040  predicted GTPase  26.45 
 
 		 426 aa  43.5  0.009  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.188583  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0079  putative ABC transporter  32.22 
 
 		 565 aa  43.5  0.009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.459634  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4415  putative GTPase HflX  26.45 
 
 		 426 aa  43.5  0.009  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.446722  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4731  putative GTPase HflX  26.45 
 
 		 426 aa  43.5  0.009  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3840  putative GTPase HflX  26.45 
 
 		 426 aa  43.5  0.009  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.209609  hitchhiker  0.000000230034 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4644  putative GTPase HflX  26.45 
 
 		 426 aa  43.5  0.009  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0602066 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4704  putative GTPase HflX  26.45 
 
 		 426 aa  43.5  0.009  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04002  hypothetical protein  26.45 
 
 		 426 aa  43.5  0.009  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.170688  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5689  putative GTPase HflX  26.45 
 
 		 426 aa  43.5  0.009  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0600434  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1701  hypothetical protein  20.97 
 
 		 1219 aa  43.5  0.01  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3715  hypothetical protein  20.43 
 
 		 1219 aa  43.5  0.01  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>