More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rfer_2301 on replicon NC_007908
Organism: Rhodoferax ferrireducens T118



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007908  Rfer_2301  small GTP-binding protein domain-containing protein  100 
 
 		 382 aa  766    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.772558  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1878  GTP-binding protein, HSR1-related  79.23 
 
 		 383 aa  558  1e-158  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.932644  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2602  GTP-binding protein, HSR1-related  77.38 
 
 		 386 aa  551  1e-156  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0415025  normal  0.601696 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1096  GTP-binding proten HflX  77.4 
 
 		 392 aa  538  9.999999999999999e-153  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1176  small GTP-binding protein  77.66 
 
 		 392 aa  540  9.999999999999999e-153  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.668458  normal  0.446741 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5013  GTP-binding proten HflX  78.37 
 
 		 404 aa  536  1e-151  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0596854  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1430  GTP-binding protein  77.93 
 
 		 390 aa  531  1e-150  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.224081  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0074  GTP-binding protein, HSR1-related  77.03 
 
 		 387 aa  514  1.0000000000000001e-145  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.352568  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2193  GTP-binding proten HflX  75.97 
 
 		 389 aa  515  1.0000000000000001e-145  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1990  putative GTP-binding protein  68.36 
 
 		 414 aa  449  1e-125  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.592796  normal  0.0213321 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2862  GTP-binding proten HflX  68.07 
 
 		 412 aa  439  9.999999999999999e-123  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2183  GTP-binding proten HflX  61.54 
 
 		 387 aa  403  1e-111  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1339  GTP-binding protein HflX  61.54 
 
 		 387 aa  401  1e-111  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.519508  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2221  GTP-binding proten HflX  61.54 
 
 		 387 aa  402  1e-111  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.997598  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2349  GTP-binding protein HflX  61.54 
 
 		 392 aa  403  1e-111  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1469  GTP-binding proten HflX  57.84 
 
 		 396 aa  402  1e-111  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.795442  normal  0.339069 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0068  GTP-binding protein HflX  61.54 
 
 		 387 aa  402  1e-111  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0515568  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2240  GTP-binding protein HflX  61.25 
 
 		 392 aa  402  1e-111  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.224831  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1100  GTP-binding protein HflX  61.54 
 
 		 387 aa  402  1e-111  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1828  GTP-binding protein HflX  61.54 
 
 		 387 aa  402  1e-111  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1830  GTP-binding proten HflX  58.4 
 
 		 395 aa  395  1e-109  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.497778 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5107  small GTP-binding protein  58.4 
 
 		 396 aa  395  1e-109  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.245706  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2535  GTP-binding proten HflX  57.49 
 
 		 404 aa  397  1e-109  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0955087  hitchhiker  0.0000726108 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1600  small GTP-binding protein  57.49 
 
 		 404 aa  397  1e-109  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0793347  normal  0.128476 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1806  small GTP-binding protein  58.4 
 
 		 395 aa  395  1e-109  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1717  GTP-binding proten HflX  56.76 
 
 		 396 aa  394  1e-108  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.658318  normal  0.277641 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1744  small GTP-binding protein  58.4 
 
 		 396 aa  394  1e-108  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1414  GTP-binding proten HflX  59.54 
 
 		 414 aa  394  1e-108  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000434774 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2100  small GTP-binding protein domain-containing protein  61.05 
 
 		 411 aa  373  1e-102  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.621356  normal  0.0850913 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3384  GTP-binding proten HflX  58.08 
 
 		 385 aa  370  1e-101  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2080  small GTP-binding protein domain-containing protein  60.5 
 
 		 414 aa  367  1e-100  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.455149  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1221  hypothetical protein  57.49 
 
 		 417 aa  355  7.999999999999999e-97  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00041238  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2979  GTP-binding protein, HSR1-related  54.8 
 
 		 384 aa  355  8.999999999999999e-97  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.908653  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00650  GTP-binding protein HflX  53.15 
 
 		 429 aa  352  7e-96  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.108619  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1065  GTP-binding proten HflX  57.77 
 
 		 417 aa  351  1e-95  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2631  GTP-binding protein HSR1-related  53.15 
 
 		 429 aa  349  4e-95  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.315157  unclonable  0.00000000000608691 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3024  GTP-binding protein HflX  53.3 
 
 		 435 aa  348  6e-95  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000099061  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1157  GTP-binding proten HflX  56.99 
 
 		 417 aa  348  8e-95  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.961099 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0898  GTP-binding proten HflX  55.78 
 
 		 417 aa  347  2e-94  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.105158  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3979  GTP-binding protein, HSR1-related  53.95 
 
 		 432 aa  345  6e-94  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3237  GTP-binding protein, HSR1-related  52.43 
 
 		 430 aa  345  8e-94  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3918  putative GTPase HflX  52.46 
 
 		 426 aa  344  1e-93  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.240209  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3720  putative GTPase HflX  52.76 
 
 		 426 aa  344  2e-93  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00523075  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0602  GTP-binding protein HflX  55.96 
 
 		 389 aa  343  2.9999999999999997e-93  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.406819 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0536  putative GTPase HflX  52.76 
 
 		 426 aa  343  2.9999999999999997e-93  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.000302275  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4759  putative GTPase HflX  52.73 
 
 		 426 aa  342  5e-93  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0493  putative GTPase HflX  52.33 
 
 		 433 aa  342  5.999999999999999e-93  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0353897  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4723  putative GTPase HflX  52.73 
 
 		 426 aa  342  8e-93  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4640  putative GTPase HflX  52.73 
 
 		 426 aa  342  8e-93  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.208484  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4630  putative GTPase HflX  52.73 
 
 		 426 aa  342  8e-93  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.048412  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4780  putative GTPase HflX  52.73 
 
 		 426 aa  342  8e-93  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0452958  normal  0.331117 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0446  small GTP-binding protein domain-containing protein  54.96 
 
 		 394 aa  342  8e-93  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3204  GTP-binding protein, HSR1-related  51.48 
 
 		 435 aa  342  8e-93  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.266449  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0567  GTP-binding protein, HSR1-related  51.35 
 
 		 432 aa  341  1e-92  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.102684  normal  0.249219 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3539  small GTP-binding protein  52.11 
 
 		 431 aa  340  2e-92  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0887499  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1278  GTP-binding protein, HSR1-related  51.91 
 
 		 439 aa  338  7e-92  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.424036  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5672  GTP-binding proten HflX  50.68 
 
 		 433 aa  338  7e-92  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2589  GTP-binding protein, HSR1-related  52.26 
 
 		 382 aa  338  9e-92  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0427105  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3820  GTP-binding proten HflX  52.19 
 
 		 426 aa  337  9.999999999999999e-92  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0373648  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00154  GTP-binding protein  51.65 
 
 		 428 aa  337  9.999999999999999e-92  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65300  putative GTP-binding protein  50.41 
 
 		 433 aa  338  9.999999999999999e-92  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04040  predicted GTPase  52.19 
 
 		 426 aa  337  1.9999999999999998e-91  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.188583  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0432  putative GTPase HflX  52.35 
 
 		 426 aa  337  1.9999999999999998e-91  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000150209  unclonable  0.0000000363353 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4704  putative GTPase HflX  52.19 
 
 		 426 aa  337  1.9999999999999998e-91  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5689  putative GTPase HflX  52.19 
 
 		 426 aa  337  1.9999999999999998e-91  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0600434  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4644  putative GTPase HflX  52.19 
 
 		 426 aa  337  1.9999999999999998e-91  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0602066 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3840  putative GTPase HflX  52.19 
 
 		 426 aa  337  1.9999999999999998e-91  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.209609  hitchhiker  0.000000230034 
 
 
-
 
NC_012892  B21_04002  hypothetical protein  52.19 
 
 		 426 aa  337  1.9999999999999998e-91  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.170688  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4731  putative GTPase HflX  52.19 
 
 		 426 aa  337  1.9999999999999998e-91  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4415  putative GTPase HflX  52.19 
 
 		 426 aa  337  1.9999999999999998e-91  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.446722  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4893  GTP-binding protein HflX  50.68 
 
 		 433 aa  337  2.9999999999999997e-91  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4945  GTP-binding proten HflX  50.68 
 
 		 433 aa  337  2.9999999999999997e-91  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.017296 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3797  putative GTPase HflX  51.93 
 
 		 428 aa  336  2.9999999999999997e-91  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0756965  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4769  GTP-binding protein, HSR1-related  50.68 
 
 		 433 aa  337  2.9999999999999997e-91  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0698  putative GTPase HflX  51.93 
 
 		 428 aa  336  2.9999999999999997e-91  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2768  GTP-binding protein, HSR1-related  51.1 
 
 		 432 aa  336  3.9999999999999995e-91  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4169  GTP-binding proten HflX  52.97 
 
 		 432 aa  335  7e-91  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00885496  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3652  putative GTPase HflX  51.66 
 
 		 428 aa  335  1e-90  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1472  GTP-binding proten HflX  51.18 
 
 		 436 aa  334  2e-90  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0356  putative GTPase HflX  51.91 
 
 		 426 aa  333  2e-90  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.152366  hitchhiker  0.00466267 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002260  GTP-binding protein HflX  51.1 
 
 		 429 aa  333  4e-90  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3310  GTP-binding protein, HSR1-related  51.69 
 
 		 435 aa  333  4e-90  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2759  putative GTPase HflX  50.83 
 
 		 429 aa  332  9e-90  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.563886  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0798  GTP-binding protein, HSR1-related  52.12 
 
 		 432 aa  330  2e-89  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00968624 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0636  GTP-binding protein, HSR1-related  52.62 
 
 		 433 aa  330  3e-89  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0477069 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00093  putative GTPase HflX  50.28 
 
 		 429 aa  330  4e-89  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2776  putative GTPase HflX  50.68 
 
 		 439 aa  329  5.0000000000000004e-89  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.114582  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1087  small GTP-binding protein domain-containing protein  49.59 
 
 		 436 aa  328  8e-89  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.824642  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0598  GTP-binding protein, HSR1-related  51.98 
 
 		 435 aa  327  2.0000000000000001e-88  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.472321  hitchhiker  0.00000215533 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0497  GTP-binding proten HflX  50 
 
 		 441 aa  327  3e-88  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.135524  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2012  GTP-binding proten HflX  51.45 
 
 		 440 aa  326  4.0000000000000003e-88  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0326  GTP-binding protein HflX  50 
 
 		 428 aa  325  6e-88  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1588  small GTP-binding protein domain-containing protein  52.7 
 
 		 375 aa  325  1e-87  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000278278 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2666  putative GTP-binding protein  50.14 
 
 		 441 aa  323  4e-87  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0604  GTP-binding protein HflX  51.41 
 
 		 435 aa  322  6e-87  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0599  GTP-binding protein, HSR1-related  51.41 
 
 		 435 aa  322  7e-87  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00843062  hitchhiker  0.00021975 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3431  GTP-binding protein, HSR1-related  51.41 
 
 		 435 aa  322  7e-87  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.253406  normal  0.0436905 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3892  GTP-binding proten HflX  51.13 
 
 		 435 aa  322  9.000000000000001e-87  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.030857  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3709  GTP-binding proten HflX  51.13 
 
 		 435 aa  322  9.000000000000001e-87  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.153718  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3766  GTP-binding protein HSR1-related  50.85 
 
 		 435 aa  321  9.999999999999999e-87  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000736905  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>