78 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cfla_1353 on replicon NC_014151
Organism: Cellulomonas flavigena DSM 20109



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014151  Cfla_1353  putative ABC transporter  100 
 
 
667 aa  1243    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  hitchhiker  0.00435841  hitchhiker  0.000139423 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1090  hypothetical protein  61.47 
 
 
737 aa  623  1e-177  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2641  putative ABC transporter  62.22 
 
 
669 aa  615  9.999999999999999e-175  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.374728  normal  0.779452 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24700  hypothetical protein  62.34 
 
 
784 aa  570  1e-161  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.303383  normal  0.0806263 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2260  putative ABC transporter  51.31 
 
 
571 aa  489  1e-137  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000139745 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2523  putative ABC transporter  51.79 
 
 
571 aa  490  1e-137  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08870  hypothetical protein  53.98 
 
 
566 aa  466  9.999999999999999e-131  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0706838  normal  0.0205572 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24320  hypothetical protein  50.81 
 
 
584 aa  451  1e-125  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8871  putative ABC transporter  51.87 
 
 
629 aa  440  9.999999999999999e-123  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.872872  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08690  hypothetical protein  50.64 
 
 
602 aa  439  9.999999999999999e-123  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0079  putative ABC transporter  51.71 
 
 
565 aa  414  1e-114  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.459634  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3266  putative ABC transporter  51.94 
 
 
571 aa  407  1.0000000000000001e-112  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.025779  normal  0.223838 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1549  putative ABC transporter  46.79 
 
 
586 aa  403  1e-111  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1572  putative ABC transporter  46.79 
 
 
586 aa  403  1e-111  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1520  putative ABC transporter  46.84 
 
 
576 aa  405  1e-111  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.703438  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0932  hypothetical protein  41.27 
 
 
650 aa  394  1e-108  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1366  putative ABC transporter  45.67 
 
 
572 aa  359  7e-98  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1324  hypothetical protein  40.54 
 
 
569 aa  349  1e-94  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.577358  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2560  AAA ATPase  39.72 
 
 
687 aa  342  2e-92  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7362  hypothetical protein  39.18 
 
 
564 aa  325  2e-87  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0821059  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2220  putative ABC transporter  35.71 
 
 
619 aa  269  1e-70  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3430  putative ABC transporter  35.39 
 
 
631 aa  262  2e-68  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.790282  normal  0.301569 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1086  hypothetical protein  37.29 
 
 
551 aa  219  1e-55  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  decreased coverage  0.00952601  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1349  hypothetical protein  42.18 
 
 
566 aa  202  1.9999999999999998e-50  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000440573 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24740  hypothetical protein  40.06 
 
 
551 aa  194  3e-48  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.043803  normal  0.105516 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0928  hypothetical protein  40.06 
 
 
540 aa  192  2e-47  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2645  putative transcriptional regulator, TetR family  41.99 
 
 
526 aa  175  1.9999999999999998e-42  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1736  putative ABC transporter  29.43 
 
 
556 aa  139  2e-31  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3738  hypothetical protein  30.62 
 
 
618 aa  79.7  0.0000000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1367  putative ABC transporter  33 
 
 
555 aa  78.2  0.0000000000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.621246  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1354  GTP-binding protein HSR1-related protein  35.78 
 
 
542 aa  77.8  0.0000000000006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0428896  hitchhiker  0.0000949376 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1394  hypothetical protein  30.96 
 
 
543 aa  75.1  0.000000000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08880  predicted GTPase  35.18 
 
 
564 aa  72  0.00000000004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.141009  normal  0.0562111 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24690  GTPase of unknown function  34.02 
 
 
539 aa  69.3  0.0000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.6041  normal  0.0378138 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1326  hypothetical protein  31.11 
 
 
568 aa  68.9  0.0000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2219  GTPase  32.57 
 
 
673 aa  68.6  0.0000000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0080  GTP-binding protein HSR1-related protein  33.65 
 
 
532 aa  68.2  0.0000000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.170633  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8870  putative ABC transporter  33.86 
 
 
590 aa  67.4  0.0000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0939636  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2640  GTP-binding protein HSR1-related protein  33.98 
 
 
550 aa  67  0.000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.133942  normal  0.721182 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1350  putative ABC transporter  30.89 
 
 
524 aa  66.2  0.000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.43815  hitchhiker  0.000106139 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1519  putative ABC transporter  31.51 
 
 
525 aa  65.5  0.000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0933  hypothetical protein  29.77 
 
 
578 aa  65.5  0.000000004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3429  hypothetical protein  31.82 
 
 
802 aa  65.1  0.000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.224896 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1091  putative ABC transporter  34.25 
 
 
585 aa  65.1  0.000000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.631509  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1571  putative ABC transporter  31.05 
 
 
525 aa  64.7  0.000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1548  putative ABC transporter  31.05 
 
 
525 aa  64.7  0.000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3997  hypothetical protein  29.53 
 
 
642 aa  62  0.00000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3265  putative ABC transporter  32.29 
 
 
532 aa  61.6  0.00000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.169453  normal  0.30236 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24310  hypothetical protein  32.87 
 
 
568 aa  60.5  0.00000009  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2522  putative ABC transporter  29.32 
 
 
539 aa  57.4  0.0000009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.504723  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08700  hypothetical protein  38.83 
 
 
586 aa  57  0.000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2644  ATP-binding membrane protein  30.35 
 
 
453 aa  56.6  0.000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.908609 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7361  putative ABC transporter  32.07 
 
 
547 aa  55.8  0.000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.901699  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2392  Dynamin family protein  26.02 
 
 
1249 aa  55.5  0.000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0914  Dynamin family protein  29.55 
 
 
548 aa  55.5  0.000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.440355 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6775  putative ABC transporter  28.57 
 
 
589 aa  55.5  0.000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.122043  normal  0.131288 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2213  Dynamin family protein  26.86 
 
 
587 aa  53.5  0.00001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2106  dynamin  29.86 
 
 
564 aa  52.8  0.00002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.78205 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1735  putative ABC transporter  32.99 
 
 
552 aa  52.4  0.00003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.43735  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2559  putative ABC transporter  29.11 
 
 
542 aa  52  0.00004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1630  hypothetical protein  22.56 
 
 
1219 aa  51.2  0.00005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00254693  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3715  hypothetical protein  22.28 
 
 
1219 aa  50.8  0.00008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1306  dynamin family protein  24.04 
 
 
1219 aa  50.4  0.00009  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.604786  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1701  hypothetical protein  22.28 
 
 
1219 aa  50.1  0.0001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1665  hypothetical protein  22.05 
 
 
1219 aa  50.1  0.0001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1741  hypothetical protein  22.05 
 
 
1219 aa  50.1  0.0001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000058782  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1451  GTP1/OBG family GTPase  22.05 
 
 
1219 aa  50.1  0.0001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.472831  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1439  Dynamin family protein  26.16 
 
 
546 aa  49.7  0.0002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.784928  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1479  hypothetical protein  22.05 
 
 
1219 aa  49.7  0.0002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1451  GTP1/OBG family GTPase  22.05 
 
 
1219 aa  50.1  0.0002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1595  hypothetical protein  22.05 
 
 
1219 aa  49.7  0.0002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1377  dynamin family protein  25.59 
 
 
585 aa  48.5  0.0004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.682843  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3531  dynamin family protein  25.36 
 
 
585 aa  47.8  0.0007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1494  dynamin family protein  22.91 
 
 
1219 aa  46.2  0.002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.248245  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24730  predicted GTPase  26.29 
 
 
517 aa  46.2  0.002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0664672  normal  0.0671171 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2259  GTP-binding protein HSR1-related  26.96 
 
 
537 aa  45.1  0.004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000117964 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0929  hypothetical protein  26.77 
 
 
518 aa  45.4  0.004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_10650  conserved hypothetical protein  22.95 
 
 
493 aa  43.9  0.009  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.0000000966328  hitchhiker  0.000000000000310071 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>