78 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jden_0932 on replicon NC_013174
Organism: Jonesia denitrificans DSM 20603



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013174  Jden_0932  hypothetical protein  100 
 
 		 650 aa  1288    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24700  hypothetical protein  46.46 
 
 		 784 aa  406  1.0000000000000001e-112  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.303383  normal  0.0806263 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2260  putative ABC transporter  44.65 
 
 		 571 aa  402  9.999999999999999e-111  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000139745 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1353  putative ABC transporter  41.06 
 
 		 667 aa  390  1e-107  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  hitchhiker  0.00435841  hitchhiker  0.000139423 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2641  putative ABC transporter  43.71 
 
 		 669 aa  382  1e-104  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.374728  normal  0.779452 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2523  putative ABC transporter  42.7 
 
 		 571 aa  380  1e-104  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08690  hypothetical protein  42.2 
 
 		 602 aa  376  1e-103  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3266  putative ABC transporter  43.06 
 
 		 571 aa  370  1e-101  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.025779  normal  0.223838 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1572  putative ABC transporter  42.27 
 
 		 586 aa  366  1e-100  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8871  putative ABC transporter  44.53 
 
 		 629 aa  367  1e-100  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.872872  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1549  putative ABC transporter  42.27 
 
 		 586 aa  366  1e-100  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1520  putative ABC transporter  42.09 
 
 		 576 aa  365  2e-99  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.703438  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1090  hypothetical protein  40.15 
 
 		 737 aa  358  1.9999999999999998e-97  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0079  putative ABC transporter  44.38 
 
 		 565 aa  350  5e-95  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.459634  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24320  hypothetical protein  39.93 
 
 		 584 aa  344  2.9999999999999997e-93  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08870  hypothetical protein  41.2 
 
 		 566 aa  343  4e-93  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0706838  normal  0.0205572 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1324  hypothetical protein  34.5 
 
 		 569 aa  296  5e-79  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.577358  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2560  AAA ATPase  34.61 
 
 		 687 aa  276  8e-73  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7362  hypothetical protein  34.66 
 
 		 564 aa  268  2e-70  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0821059  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3430  putative ABC transporter  32.82 
 
 		 631 aa  268  2.9999999999999995e-70  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.790282  normal  0.301569 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2220  putative ABC transporter  32.77 
 
 		 619 aa  255  2.0000000000000002e-66  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1366  putative ABC transporter  35.99 
 
 		 572 aa  249  8e-65  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1086  hypothetical protein  39.71 
 
 		 551 aa  203  7e-51  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  decreased coverage  0.00952601  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1349  hypothetical protein  36.3 
 
 		 566 aa  186  1.0000000000000001e-45  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000440573 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24740  hypothetical protein  35.95 
 
 		 551 aa  179  2e-43  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.043803  normal  0.105516 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0928  hypothetical protein  38.93 
 
 		 540 aa  170  6e-41  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2645  putative transcriptional regulator, TetR family  33.92 
 
 		 526 aa  160  1e-37  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1736  putative ABC transporter  29.5 
 
 		 556 aa  155  2.9999999999999998e-36  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08880  predicted GTPase  32.95 
 
 		 564 aa  67.4  0.0000000009  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.141009  normal  0.0562111 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3738  hypothetical protein  25.89 
 
 		 618 aa  63.9  0.000000008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1354  GTP-binding protein HSR1-related protein  32.81 
 
 		 542 aa  62.8  0.00000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0428896  hitchhiker  0.0000949376 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1735  putative ABC transporter  28.89 
 
 		 552 aa  63.2  0.00000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.43735  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2640  GTP-binding protein HSR1-related protein  30.66 
 
 		 550 aa  61.6  0.00000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.133942  normal  0.721182 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3997  hypothetical protein  27.27 
 
 		 642 aa  60.8  0.00000008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2259  GTP-binding protein HSR1-related  32.04 
 
 		 537 aa  60.5  0.00000009  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000117964 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3429  hypothetical protein  28.57 
 
 		 802 aa  57.8  0.0000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.224896 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24310  hypothetical protein  32.46 
 
 		 568 aa  57.8  0.0000007  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1394  hypothetical protein  28.88 
 
 		 543 aa  57.8  0.0000007  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6775  putative ABC transporter  30.85 
 
 		 589 aa  57  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.122043  normal  0.131288 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0933  hypothetical protein  30.52 
 
 		 578 aa  56.6  0.000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1091  putative ABC transporter  30.73 
 
 		 585 aa  57  0.000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.631509  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2522  putative ABC transporter  30.17 
 
 		 539 aa  56.2  0.000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.504723  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1326  hypothetical protein  28.5 
 
 		 568 aa  55.1  0.000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08700  hypothetical protein  29.41 
 
 		 586 aa  53.5  0.00001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2106  dynamin  30.12 
 
 		 564 aa  53.1  0.00001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.78205 
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_44250  predicted protein  24.92 
 
 		 632 aa  53.5  0.00001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.755773  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3531  dynamin family protein  28 
 
 		 585 aa  53.5  0.00001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3265  putative ABC transporter  30.48 
 
 		 532 aa  52.8  0.00002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.169453  normal  0.30236 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1377  dynamin family protein  27.6 
 
 		 585 aa  52.8  0.00002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.682843  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0929  hypothetical protein  26.4 
 
 		 518 aa  51.2  0.00005  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1350  putative ABC transporter  28.16 
 
 		 524 aa  51.2  0.00006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.43815  hitchhiker  0.000106139 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0080  GTP-binding protein HSR1-related protein  32.63 
 
 		 532 aa  51.2  0.00006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.170633  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1439  Dynamin family protein  25.97 
 
 		 546 aa  50.8  0.00008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.784928  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0914  Dynamin family protein  26.67 
 
 		 548 aa  50.4  0.0001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.440355 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24690  GTPase of unknown function  31.07 
 
 		 539 aa  49.3  0.0002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.6041  normal  0.0378138 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7361  putative ABC transporter  30.05 
 
 		 547 aa  49.3  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.901699  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2392  Dynamin family protein  25.86 
 
 		 1249 aa  49.3  0.0002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1367  putative ABC transporter  28.19 
 
 		 555 aa  48.9  0.0003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.621246  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2559  putative ABC transporter  28.64 
 
 		 542 aa  48.5  0.0004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24730  predicted GTPase  25.15 
 
 		 517 aa  48.1  0.0005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0664672  normal  0.0671171 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2219  GTPase  26.97 
 
 		 673 aa  47.8  0.0006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1519  putative ABC transporter  29.76 
 
 		 525 aa  47  0.001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1306  dynamin family protein  21.11 
 
 		 1219 aa  45.8  0.002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.604786  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1548  putative ABC transporter  29.17 
 
 		 525 aa  46.2  0.002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1571  putative ABC transporter  29.17 
 
 		 525 aa  46.2  0.002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8870  putative ABC transporter  29.07 
 
 		 590 aa  46.6  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0939636  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0632  Dynamin family protein  24.07 
 
 		 589 aa  45.4  0.003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2644  ATP-binding membrane protein  24.92 
 
 		 453 aa  45.8  0.003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.908609 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1896  Dynamin family protein  22.54 
 
 		 1228 aa  45.4  0.003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00444431  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1013  hypothetical protein  20.87 
 
 		 1145 aa  45.4  0.004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.445275  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1087  putative ABC transporter  26.35 
 
 		 523 aa  44.7  0.005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0151577  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1494  dynamin family protein  21.74 
 
 		 1219 aa  44.7  0.006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.248245  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1665  hypothetical protein  21.2 
 
 		 1219 aa  44.7  0.006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1595  hypothetical protein  21.2 
 
 		 1219 aa  44.7  0.006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1451  GTP1/OBG family GTPase  21.2 
 
 		 1219 aa  44.7  0.006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.472831  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1451  GTP1/OBG family GTPase  21.2 
 
 		 1219 aa  44.7  0.006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1479  hypothetical protein  21.2 
 
 		 1219 aa  44.7  0.006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1741  hypothetical protein  21.2 
 
 		 1219 aa  44.3  0.007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000058782  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>