74 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mkms_1572 on replicon NC_008705
Organism: Mycobacterium sp. KMS



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009077  Mjls_1520  putative ABC transporter  98.6 
 
 		 576 aa  1097    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.703438  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1572  putative ABC transporter  100 
 
 		 586 aa  1148    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1549  putative ABC transporter  100 
 
 		 586 aa  1148    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8871  putative ABC transporter  53.9 
 
 		 629 aa  500  1e-140  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.872872  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0079  putative ABC transporter  53.05 
 
 		 565 aa  488  1e-136  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.459634  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08870  hypothetical protein  49.37 
 
 		 566 aa  466  9.999999999999999e-131  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0706838  normal  0.0205572 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3266  putative ABC transporter  51.5 
 
 		 571 aa  462  1e-129  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.025779  normal  0.223838 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2523  putative ABC transporter  49.25 
 
 		 571 aa  453  1.0000000000000001e-126  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2260  putative ABC transporter  48.81 
 
 		 571 aa  443  1e-123  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000139745 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2641  putative ABC transporter  50.98 
 
 		 669 aa  442  1e-123  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.374728  normal  0.779452 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1353  putative ABC transporter  47.45 
 
 		 667 aa  416  9.999999999999999e-116  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  hitchhiker  0.00435841  hitchhiker  0.000139423 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08690  hypothetical protein  47.04 
 
 		 602 aa  409  1e-113  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24700  hypothetical protein  47.78 
 
 		 784 aa  397  1e-109  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.303383  normal  0.0806263 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0932  hypothetical protein  42.27 
 
 		 650 aa  381  1e-104  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1324  hypothetical protein  41.21 
 
 		 569 aa  379  1e-103  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.577358  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1090  hypothetical protein  46.32 
 
 		 737 aa  374  1e-102  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24320  hypothetical protein  45.62 
 
 		 584 aa  374  1e-102  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1366  putative ABC transporter  44.38 
 
 		 572 aa  361  2e-98  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7362  hypothetical protein  40 
 
 		 564 aa  342  1e-92  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0821059  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2560  AAA ATPase  39.31 
 
 		 687 aa  337  2.9999999999999997e-91  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3430  putative ABC transporter  38.31 
 
 		 631 aa  307  3e-82  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.790282  normal  0.301569 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2220  putative ABC transporter  36.77 
 
 		 619 aa  303  4.0000000000000003e-81  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1349  hypothetical protein  43.3 
 
 		 566 aa  233  9e-60  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000440573 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1086  hypothetical protein  35.04 
 
 		 551 aa  219  1e-55  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  decreased coverage  0.00952601  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0928  hypothetical protein  39.87 
 
 		 540 aa  204  4e-51  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24740  hypothetical protein  39.64 
 
 		 551 aa  203  8e-51  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.043803  normal  0.105516 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2645  putative transcriptional regulator, TetR family  37.84 
 
 		 526 aa  192  2e-47  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1736  putative ABC transporter  33.02 
 
 		 556 aa  172  2e-41  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1394  hypothetical protein  37.5 
 
 		 543 aa  80.5  0.00000000000008  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3265  putative ABC transporter  34.59 
 
 		 532 aa  75.5  0.000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.169453  normal  0.30236 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1735  putative ABC transporter  31.37 
 
 		 552 aa  72.8  0.00000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.43735  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6775  putative ABC transporter  29.49 
 
 		 589 aa  71.2  0.00000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.122043  normal  0.131288 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08880  predicted GTPase  34.29 
 
 		 564 aa  70.1  0.0000000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.141009  normal  0.0562111 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24310  hypothetical protein  39.06 
 
 		 568 aa  67.8  0.0000000006  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3738  hypothetical protein  33.97 
 
 		 618 aa  65.9  0.000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1354  GTP-binding protein HSR1-related protein  37.98 
 
 		 542 aa  65.5  0.000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0428896  hitchhiker  0.0000949376 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2522  putative ABC transporter  31.11 
 
 		 539 aa  63.9  0.000000007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.504723  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0080  GTP-binding protein HSR1-related protein  33.63 
 
 		 532 aa  63.2  0.00000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.170633  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24690  GTPase of unknown function  29.59 
 
 		 539 aa  63.2  0.00000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.6041  normal  0.0378138 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2259  GTP-binding protein HSR1-related  32.95 
 
 		 537 aa  63.2  0.00000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000117964 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2219  GTPase  34.35 
 
 		 673 aa  62.8  0.00000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0914  Dynamin family protein  29.61 
 
 		 548 aa  62.4  0.00000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.440355 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0933  hypothetical protein  32.77 
 
 		 578 aa  62.4  0.00000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1571  putative ABC transporter  25.94 
 
 		 525 aa  61.2  0.00000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1548  putative ABC transporter  25.94 
 
 		 525 aa  61.2  0.00000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1519  putative ABC transporter  25.94 
 
 		 525 aa  60.5  0.00000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24730  predicted GTPase  35.88 
 
 		 517 aa  59.7  0.0000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0664672  normal  0.0671171 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2968  dynamin family protein  28.48 
 
 		 583 aa  59.3  0.0000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1087  putative ABC transporter  30.61 
 
 		 523 aa  59.3  0.0000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0151577  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3997  hypothetical protein  26.27 
 
 		 642 aa  59.3  0.0000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1091  putative ABC transporter  31.1 
 
 		 585 aa  59.3  0.0000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.631509  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2640  GTP-binding protein HSR1-related protein  32.62 
 
 		 550 aa  59.3  0.0000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.133942  normal  0.721182 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1326  hypothetical protein  28.95 
 
 		 568 aa  58.5  0.0000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0632  Dynamin family protein  21.38 
 
 		 589 aa  58.5  0.0000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7361  putative ABC transporter  31.19 
 
 		 547 aa  58.5  0.0000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.901699  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2106  dynamin  30.52 
 
 		 564 aa  58.2  0.0000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.78205 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3429  hypothetical protein  38.46 
 
 		 802 aa  57.4  0.0000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.224896 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2213  Dynamin family protein  30 
 
 		 587 aa  57  0.000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2559  putative ABC transporter  29.91 
 
 		 542 aa  55.8  0.000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08700  hypothetical protein  31.31 
 
 		 586 aa  55.8  0.000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1350  putative ABC transporter  31.52 
 
 		 524 aa  55.5  0.000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.43815  hitchhiker  0.000106139 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1367  putative ABC transporter  29 
 
 		 555 aa  55.5  0.000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.621246  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2644  ATP-binding membrane protein  31.41 
 
 		 453 aa  54.3  0.000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.908609 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1439  Dynamin family protein  25.66 
 
 		 546 aa  53.9  0.000008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.784928  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8870  putative ABC transporter  28.85 
 
 		 590 aa  53.5  0.000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0939636  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1377  dynamin family protein  23.73 
 
 		 585 aa  52  0.00003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.682843  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6880  Dynamin family protein  28.05 
 
 		 1164 aa  51.2  0.00005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0322  Dynamin family protein  28.1 
 
 		 585 aa  49.7  0.0001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0929  hypothetical protein  31.58 
 
 		 518 aa  50.4  0.0001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3531  dynamin family protein  24.29 
 
 		 585 aa  49.7  0.0002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5212  small GTP-binding protein  26.63 
 
 		 489 aa  48.1  0.0005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000545834 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1234  GTP-binding protein EngA  25.45 
 
 		 444 aa  45.4  0.003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2392  Dynamin family protein  25.16 
 
 		 1249 aa  43.9  0.009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_44250  predicted protein  23.45 
 
 		 632 aa  43.5  0.01  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.755773  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>