More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_1377 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009523  RoseRS_3531  dynamin family protein  87.16 
 
 		 585 aa  1008    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1377  dynamin family protein  100 
 
 		 585 aa  1160    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.682843  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2968  dynamin family protein  46.53 
 
 		 583 aa  538  1e-151  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0632  Dynamin family protein  44.67 
 
 		 589 aa  513  1e-144  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2213  Dynamin family protein  46.55 
 
 		 587 aa  514  1e-144  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0322  Dynamin family protein  39.42 
 
 		 585 aa  369  1e-100  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2106  dynamin  39.31 
 
 		 564 aa  333  6e-90  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.78205 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0914  Dynamin family protein  34.11 
 
 		 548 aa  288  2e-76  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.440355 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1439  Dynamin family protein  34.45 
 
 		 546 aa  268  2.9999999999999995e-70  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.784928  normal  1 
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_44250  predicted protein  40.73 
 
 		 632 aa  203  6e-51  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.755773  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6880  Dynamin family protein  39.34 
 
 		 1164 aa  125  2e-27  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6878  Dynamin family protein  34.78 
 
 		 620 aa  120  6e-26  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2910  dynamin family protein  30.89 
 
 		 605 aa  112  2.0000000000000002e-23  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.518789  normal  0.400566 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1510  GTP-binding protein HSR1-related  24.86 
 
 		 523 aa  105  2e-21  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2259  Dynamin family protein  25.99 
 
 		 444 aa  100  8e-20  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000551632  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1193  hypothetical protein  29.34 
 
 		 614 aa  93.6  8e-18  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.108086  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1273  Dynamin family protein  26.41 
 
 		 407 aa  92.8  2e-17  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.0000000146438  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2994  dynamin family protein  26.8 
 
 		 614 aa  90.9  6e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.214598  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3036  dynamin family protein  26.8 
 
 		 614 aa  90.9  6e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0241135  normal  0.688737 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1095  dynamin  25.41 
 
 		 588 aa  90.1  1e-16  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.845511  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2196  dynamin family protein  30.61 
 
 		 506 aa  83.2  0.00000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000046764 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0624  hypothetical protein  27.78 
 
 		 602 aa  81.3  0.00000000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.318926  normal  0.0782013 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1350  dynamin  22.83 
 
 		 693 aa  77.4  0.0000000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0228271 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0273  hypothetical protein  27.84 
 
 		 608 aa  76.3  0.000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0398  Dynamin family protein  23.41 
 
 		 674 aa  76.3  0.000000000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2209  GTP-binding protein  24.89 
 
 		 615 aa  74.3  0.000000000005  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0404  glucosamine fructose-6-phosphate aminotransferase (isomerizing)  24.09 
 
 		 610 aa  73.6  0.00000000001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0438  GTP-binding protein  22.35 
 
 		 599 aa  70.9  0.00000000006  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1896  Dynamin family protein  30.14 
 
 		 1228 aa  70.5  0.00000000008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00444431  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1639  dynamin family protein  27.6 
 
 		 605 aa  68.6  0.0000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.143429  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1654  dynamin  28.84 
 
 		 686 aa  68.2  0.0000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0311974  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2424  Dynamin family protein  23.08 
 
 		 666 aa  67.8  0.0000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1654  dynamin family protein  26.55 
 
 		 603 aa  67.4  0.0000000007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.964955 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7362  hypothetical protein  26.33 
 
 		 564 aa  67  0.0000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0821059  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1630  hypothetical protein  26.79 
 
 		 1219 aa  66.6  0.000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00254693  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0434  hypothetical protein  27.27 
 
 		 619 aa  65.9  0.000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.827508  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1741  hypothetical protein  26.34 
 
 		 1219 aa  65.1  0.000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000058782  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0556  GTP-binding protein HSR1-related  27.81 
 
 		 602 aa  65.1  0.000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0329351  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0447  hypothetical protein  27.27 
 
 		 619 aa  65.5  0.000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.276019  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0457  hypothetical protein  27.27 
 
 		 619 aa  65.5  0.000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.374169  normal  0.488282 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39100  GTPase of unknown function  28.92 
 
 		 617 aa  65.5  0.000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  decreased coverage  0.0000974304  normal  0.356305 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0933  dynamin family protein  25.12 
 
 		 679 aa  65.1  0.000000004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.807319  hitchhiker  0.00750508 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3715  hypothetical protein  26.82 
 
 		 1219 aa  64.7  0.000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1665  hypothetical protein  27.6 
 
 		 1219 aa  64.7  0.000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1479  hypothetical protein  27.6 
 
 		 1219 aa  64.3  0.000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1451  GTP1/OBG family GTPase  27.6 
 
 		 1219 aa  64.3  0.000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1451  GTP1/OBG family GTPase  27.6 
 
 		 1219 aa  64.7  0.000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.472831  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1595  hypothetical protein  27.6 
 
 		 1219 aa  64.3  0.000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1701  hypothetical protein  26.34 
 
 		 1219 aa  64.3  0.000000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0860  GTP-binding protein  22.19 
 
 		 601 aa  64.3  0.000000006  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1494  dynamin family protein  27.6 
 
 		 1219 aa  64.3  0.000000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.248245  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7004  GTP-binding protein HSR1-related  25.09 
 
 		 610 aa  63.9  0.000000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.793634  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1306  dynamin family protein  26.46 
 
 		 1219 aa  63.2  0.00000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.604786  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0859  GTP-binding protein  24.21 
 
 		 692 aa  62.4  0.00000002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.547864  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0928  hypothetical protein  32.62 
 
 		 540 aa  62.4  0.00000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10347  isoniazid inductible gene protein iniA  25.83 
 
 		 640 aa  62  0.00000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.997288 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1096  GTP-binding protein, HSR1-related  24.87 
 
 		 664 aa  62  0.00000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3729  hypothetical protein  27.95 
 
 		 626 aa  62  0.00000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.731679  normal  0.057897 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0403  dynamin family protein  23.83 
 
 		 693 aa  59.7  0.0000001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_8770  predicted protein  28.16 
 
 		 390 aa  59.3  0.0000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3084  hypothetical protein  25.96 
 
 		 627 aa  59.3  0.0000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3622  hypothetical protein  27.88 
 
 		 654 aa  58.9  0.0000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.300251  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2751  GTP-binding protein, HSR1-related  32.37 
 
 		 549 aa  58.5  0.0000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.859645  normal  0.205011 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08870  hypothetical protein  30.1 
 
 		 566 aa  58.2  0.0000004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0706838  normal  0.0205572 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2560  AAA ATPase  26.8 
 
 		 687 aa  58.2  0.0000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1735  putative ABC transporter  30.77 
 
 		 552 aa  58.2  0.0000004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.43735  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0336  conserved hypothetical protein, predicted ATP/GTP-binding protein  28.7 
 
 		 741 aa  57.4  0.0000007  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24320  hypothetical protein  27.31 
 
 		 584 aa  57  0.000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0813  hypothetical protein  23.64 
 
 		 516 aa  56.6  0.000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2377  hypothetical protein  29.69 
 
 		 659 aa  57  0.000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.0503347 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2756  hypothetical protein  29.69 
 
 		 659 aa  57  0.000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0436  GTP-binding protein  23.7 
 
 		 569 aa  56.6  0.000001  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0828  hypothetical protein  22.62 
 
 		 516 aa  56.2  0.000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000529126  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2033  GTP-binding protein, HSR1-related  25.85 
 
 		 569 aa  55.8  0.000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00291841 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1915  tRNA modification GTPase TrmE  36.43 
 
 		 457 aa  56.2  0.000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.410866  normal  0.314403 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3302  GTP-binding protein EngA  29.13 
 
 		 474 aa  55.1  0.000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.316901  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1501  hypothetical protein  30.43 
 
 		 1146 aa  55.5  0.000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1530  hypothetical protein  30.43 
 
 		 1146 aa  55.5  0.000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.532706  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0787  dynamin family protein  33.7 
 
 		 655 aa  55.1  0.000003  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.0394271  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2546  hypothetical protein  25.42 
 
 		 719 aa  55.1  0.000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0908682 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0372  hypothetical protein  25.12 
 
 		 587 aa  55.1  0.000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3234  hypothetical protein  32.73 
 
 		 675 aa  55.1  0.000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.220852  normal  1 
 
 
-
 
NC_011690  PHATRDRAFT_30394  predicted protein  27.59 
 
 		 559 aa  54.7  0.000005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.382636  n/a   
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5314  hypothetical protein  23.23 
 
 		 952 aa  54.7  0.000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2220  putative ABC transporter  26.29 
 
 		 619 aa  54.3  0.000006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0382  hypothetical protein  29.31 
 
 		 652 aa  54.3  0.000006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.874173  normal  0.0118752 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0079  putative ABC transporter  28.89 
 
 		 565 aa  54.3  0.000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.459634  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0437  GTP-binding protein  22.58 
 
 		 692 aa  54.3  0.000006  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1545  GTP-binding protein  22.29 
 
 		 569 aa  54.3  0.000007  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.712051  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0886  tRNA modification GTPase TrmE  29.41 
 
 		 478 aa  53.9  0.000008  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00940326 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24740  hypothetical protein  29.58 
 
 		 551 aa  53.9  0.000008  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.043803  normal  0.105516 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2392  Dynamin family protein  33.33 
 
 		 1249 aa  53.1  0.00001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1086  hypothetical protein  28.78 
 
 		 551 aa  53.5  0.00001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  decreased coverage  0.00952601  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36820  hypothetical protein  25.4 
 
 		 624 aa  53.5  0.00001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.19264 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1013  hypothetical protein  26.5 
 
 		 1145 aa  52.8  0.00002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.445275  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0657  tRNA modification GTPase TrmE  30.68 
 
 		 450 aa  52.8  0.00002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0700  hypothetical protein  30.52 
 
 		 652 aa  52.8  0.00002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.471001  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0080  GTP-binding protein Era  28.78 
 
 		 301 aa  52.8  0.00002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.0000412844  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3535  GTP-binding protein Era  23.84 
 
 		 324 aa  52.8  0.00002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0774  hypothetical protein  25.99 
 
 		 529 aa  52.8  0.00002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0344155  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>