69 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpe_A3234 on replicon NC_008825
Organism: Methylibium petroleiphilum PM1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010524  Lcho_3493  hypothetical protein  66.21 
 
 		 709 aa  826    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000901673 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3234  hypothetical protein  100 
 
 		 675 aa  1350    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.220852  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1298  hypothetical protein  51.75 
 
 		 659 aa  619  1e-176  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.594857  normal  0.225568 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0829  hypothetical protein  49.36 
 
 		 660 aa  605  9.999999999999999e-173  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0612198  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0900  hypothetical protein  49.2 
 
 		 660 aa  603  1.0000000000000001e-171  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.347456  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0904  hypothetical protein  51.43 
 
 		 658 aa  603  1.0000000000000001e-171  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5428  hypothetical protein  48.58 
 
 		 672 aa  590  1e-167  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.832093 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1655  hypothetical protein  48.59 
 
 		 659 aa  576  1.0000000000000001e-163  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.92413  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3605  hypothetical protein  46.35 
 
 		 653 aa  569  1e-161  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.169107  normal  0.037636 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4340  hypothetical protein  47.03 
 
 		 655 aa  563  1.0000000000000001e-159  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0246276  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0282  hypothetical protein  42.42 
 
 		 648 aa  464  1e-129  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0400  hypothetical protein  42.6 
 
 		 662 aa  457  1e-127  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0733804  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0255  hypothetical protein  42.76 
 
 		 648 aa  452  1e-125  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.142183  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0347  hypothetical protein  39.66 
 
 		 651 aa  451  1e-125  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.512067  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0294  hypothetical protein  40.8 
 
 		 672 aa  442  1e-123  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3725  hypothetical protein  40.32 
 
 		 649 aa  433  1e-120  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.24696 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3622  hypothetical protein  41.13 
 
 		 654 aa  412  1e-113  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.300251  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0382  hypothetical protein  39.05 
 
 		 652 aa  409  1e-113  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.874173  normal  0.0118752 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0700  hypothetical protein  37.42 
 
 		 652 aa  406  1.0000000000000001e-112  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.471001  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2415  hypothetical protein  34.85 
 
 		 648 aa  349  9e-95  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0829723  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0490  hypothetical protein  35.14 
 
 		 655 aa  285  2.0000000000000002e-75  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05110  hypothetical protein  35.08 
 
 		 655 aa  283  1e-74  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0533  GTPase (dynamin-related)  32.59 
 
 		 654 aa  276  9e-73  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4154  GTPase (dynamin-related)-like protein  33.58 
 
 		 660 aa  276  1.0000000000000001e-72  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.67903 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2377  hypothetical protein  33.23 
 
 		 659 aa  270  7e-71  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.0503347 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2756  hypothetical protein  33.23 
 
 		 659 aa  270  7e-71  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1193  hypothetical protein  28.3 
 
 		 614 aa  87.4  8e-16  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.108086  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2196  dynamin family protein  30.16 
 
 		 506 aa  76.6  0.000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000046764 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2994  dynamin family protein  30.89 
 
 		 614 aa  75.1  0.000000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.214598  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3036  dynamin family protein  30.89 
 
 		 614 aa  75.1  0.000000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0241135  normal  0.688737 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1350  dynamin  26.98 
 
 		 693 aa  74.7  0.000000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0228271 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2910  dynamin family protein  23.66 
 
 		 605 aa  70.5  0.0000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.518789  normal  0.400566 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0787  dynamin family protein  26.38 
 
 		 655 aa  62  0.00000003  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.0394271  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2424  Dynamin family protein  24.51 
 
 		 666 aa  60.5  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3531  dynamin family protein  33.94 
 
 		 585 aa  58.5  0.0000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0914  Dynamin family protein  35.92 
 
 		 548 aa  56.6  0.000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.440355 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1377  dynamin family protein  32.73 
 
 		 585 aa  55.1  0.000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.682843  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2546  hypothetical protein  23.43 
 
 		 719 aa  53.9  0.000009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0908682 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1095  dynamin  26.7 
 
 		 588 aa  53.5  0.00001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.845511  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2259  Dynamin family protein  26.75 
 
 		 444 aa  53.9  0.00001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000551632  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6878  Dynamin family protein  25.82 
 
 		 620 aa  53.9  0.00001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1273  Dynamin family protein  29.17 
 
 		 407 aa  53.5  0.00001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.0000000146438  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0969  Dynamin family protein  26.54 
 
 		 648 aa  53.1  0.00002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2968  dynamin family protein  33.33 
 
 		 583 aa  50.8  0.00008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2213  Dynamin family protein  35.68 
 
 		 587 aa  48.9  0.0003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0322  Dynamin family protein  34.59 
 
 		 585 aa  48.9  0.0003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2545  dynamin  21.88 
 
 		 390 aa  48.1  0.0005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0649757  normal  0.0791445 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3460  hypothetical protein  32 
 
 		 659 aa  48.1  0.0006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0398  Dynamin family protein  28.06 
 
 		 674 aa  47.4  0.0008  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1439  Dynamin family protein  40.43 
 
 		 546 aa  46.6  0.001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.784928  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4145  hypothetical protein  25.94 
 
 		 690 aa  45.8  0.002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.487831 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1639  dynamin family protein  26.15 
 
 		 605 aa  46.2  0.002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.143429  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0624  hypothetical protein  28.48 
 
 		 602 aa  46.2  0.002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.318926  normal  0.0782013 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1654  dynamin  26.35 
 
 		 686 aa  45.4  0.003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0311974  normal  1 
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_44250  predicted protein  30.88 
 
 		 632 aa  45.4  0.003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.755773  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3805  hypothetical protein  23.98 
 
 		 927 aa  45.1  0.004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.206657  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4018  hypothetical protein  23.47 
 
 		 814 aa  45.1  0.004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.505763 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1701  hypothetical protein  23.83 
 
 		 1219 aa  45.1  0.004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3777  hypothetical protein  23.98 
 
 		 927 aa  44.7  0.005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00148359 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3518  TPR repeat-containing protein  23.98 
 
 		 927 aa  45.1  0.005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0273  hypothetical protein  27.27 
 
 		 608 aa  44.7  0.006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3727  hypothetical protein  30 
 
 		 764 aa  44.3  0.007  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3239  hypothetical protein  27.32 
 
 		 669 aa  44.3  0.007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.983308  normal  0.678486 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1451  GTP1/OBG family GTPase  24 
 
 		 1219 aa  44.3  0.008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.472831  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1479  hypothetical protein  24 
 
 		 1219 aa  43.9  0.009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1665  hypothetical protein  24 
 
 		 1219 aa  43.9  0.009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1595  hypothetical protein  24 
 
 		 1219 aa  43.9  0.009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1451  GTP1/OBG family GTPase  24 
 
 		 1219 aa  43.9  0.009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2106  dynamin  28.89 
 
 		 564 aa  43.9  0.01  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.78205 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>