57 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lcho_3493 on replicon NC_010524
Organism: Leptothrix cholodnii SP-6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010524  Lcho_3493  hypothetical protein  100 
 
 		 709 aa  1414    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000901673 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3234  hypothetical protein  66.26 
 
 		 675 aa  826    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.220852  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0829  hypothetical protein  47.05 
 
 		 660 aa  576  1.0000000000000001e-163  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0612198  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0900  hypothetical protein  46.89 
 
 		 660 aa  573  1.0000000000000001e-162  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.347456  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0904  hypothetical protein  49.44 
 
 		 658 aa  566  1e-160  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1298  hypothetical protein  48.17 
 
 		 659 aa  568  1e-160  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.594857  normal  0.225568 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5428  hypothetical protein  46.09 
 
 		 672 aa  553  1e-156  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.832093 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3605  hypothetical protein  45.15 
 
 		 653 aa  548  1e-155  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.169107  normal  0.037636 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4340  hypothetical protein  47.36 
 
 		 655 aa  543  1e-153  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0246276  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1655  hypothetical protein  46.73 
 
 		 659 aa  529  1e-149  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.92413  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0294  hypothetical protein  39.58 
 
 		 672 aa  430  1e-119  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0400  hypothetical protein  39.8 
 
 		 662 aa  426  1e-118  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0733804  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0282  hypothetical protein  39.9 
 
 		 648 aa  428  1e-118  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0255  hypothetical protein  39.9 
 
 		 648 aa  421  1e-116  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.142183  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0347  hypothetical protein  38.52 
 
 		 651 aa  418  9.999999999999999e-116  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.512067  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3725  hypothetical protein  39.94 
 
 		 649 aa  415  1e-114  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.24696 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0700  hypothetical protein  38.02 
 
 		 652 aa  402  1e-111  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.471001  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0382  hypothetical protein  37.99 
 
 		 652 aa  396  1e-109  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.874173  normal  0.0118752 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3622  hypothetical protein  40 
 
 		 654 aa  392  1e-107  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.300251  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2415  hypothetical protein  36.63 
 
 		 648 aa  338  1.9999999999999998e-91  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0829723  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0490  hypothetical protein  33.85 
 
 		 655 aa  275  2.0000000000000002e-72  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05110  hypothetical protein  35.24 
 
 		 655 aa  273  8.000000000000001e-72  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4154  GTPase (dynamin-related)-like protein  33.76 
 
 		 660 aa  273  1e-71  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.67903 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0533  GTPase (dynamin-related)  40.16 
 
 		 654 aa  270  7e-71  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2377  hypothetical protein  30.54 
 
 		 659 aa  268  2.9999999999999995e-70  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.0503347 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2756  hypothetical protein  30.54 
 
 		 659 aa  268  2.9999999999999995e-70  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3036  dynamin family protein  28.22 
 
 		 614 aa  75.9  0.000000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0241135  normal  0.688737 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2994  dynamin family protein  28.22 
 
 		 614 aa  75.9  0.000000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.214598  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1193  hypothetical protein  25.57 
 
 		 614 aa  69.3  0.0000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.108086  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2196  dynamin family protein  30.25 
 
 		 506 aa  66.6  0.000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000046764 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1273  Dynamin family protein  27.11 
 
 		 407 aa  62.8  0.00000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.0000000146438  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1095  dynamin  23.49 
 
 		 588 aa  62.8  0.00000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.845511  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1350  dynamin  27.21 
 
 		 693 aa  62.8  0.00000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0228271 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2968  dynamin family protein  30.77 
 
 		 583 aa  62.4  0.00000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6878  Dynamin family protein  27.48 
 
 		 620 aa  59.7  0.0000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2910  dynamin family protein  27.07 
 
 		 605 aa  54.7  0.000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.518789  normal  0.400566 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2424  Dynamin family protein  25.79 
 
 		 666 aa  53.5  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0787  dynamin family protein  23.17 
 
 		 655 aa  53.9  0.00001  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.0394271  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2259  Dynamin family protein  25 
 
 		 444 aa  52.8  0.00002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000551632  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0914  Dynamin family protein  34.4 
 
 		 548 aa  52  0.00003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.440355 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3531  dynamin family protein  32.68 
 
 		 585 aa  52.4  0.00003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1654  dynamin  24.85 
 
 		 686 aa  51.2  0.00006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0311974  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2213  Dynamin family protein  35.71 
 
 		 587 aa  49.7  0.0002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1439  Dynamin family protein  37.12 
 
 		 546 aa  49.7  0.0002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.784928  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1377  dynamin family protein  30.07 
 
 		 585 aa  47.8  0.0008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.682843  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0322  Dynamin family protein  31.25 
 
 		 585 aa  47  0.001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0398  Dynamin family protein  26.77 
 
 		 674 aa  47.4  0.001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1351  heat shock protein DnaJ-like  28.26 
 
 		 741 aa  47.4  0.001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0473185 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3715  hypothetical protein  21.79 
 
 		 1219 aa  46.2  0.002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2209  GTP-binding protein  22.95 
 
 		 615 aa  46.2  0.002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10347  isoniazid inductible gene protein iniA  43.33 
 
 		 640 aa  46.2  0.002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.997288 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1639  dynamin family protein  25.38 
 
 		 605 aa  45.1  0.005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.143429  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0624  hypothetical protein  39.06 
 
 		 602 aa  45.1  0.005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.318926  normal  0.0782013 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2545  dynamin  21.14 
 
 		 390 aa  45.1  0.005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0649757  normal  0.0791445 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1701  hypothetical protein  21.4 
 
 		 1219 aa  44.3  0.007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1654  dynamin family protein  24.37 
 
 		 603 aa  44.3  0.009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.964955 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2392  Dynamin family protein  22.93 
 
 		 1249 aa  43.9  0.01  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>