52 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_4340 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012791  Vapar_4340  hypothetical protein  100 
 
 		 655 aa  1321    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0246276  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0829  hypothetical protein  59.09 
 
 		 660 aa  777    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0612198  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5428  hypothetical protein  55.64 
 
 		 672 aa  716    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.832093 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0900  hypothetical protein  58.93 
 
 		 660 aa  775    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.347456  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0904  hypothetical protein  62.06 
 
 		 658 aa  788    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3605  hypothetical protein  58.6 
 
 		 653 aa  766    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.169107  normal  0.037636 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1655  hypothetical protein  59.07 
 
 		 659 aa  768    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.92413  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1298  hypothetical protein  62.28 
 
 		 659 aa  799    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.594857  normal  0.225568 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3234  hypothetical protein  47.03 
 
 		 675 aa  548  1e-154  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.220852  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3493  hypothetical protein  47.36 
 
 		 709 aa  528  1e-148  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000901673 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0400  hypothetical protein  38 
 
 		 662 aa  452  1.0000000000000001e-126  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0733804  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3622  hypothetical protein  40.74 
 
 		 654 aa  450  1e-125  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.300251  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0282  hypothetical protein  38.15 
 
 		 648 aa  451  1e-125  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0347  hypothetical protein  38.36 
 
 		 651 aa  446  1.0000000000000001e-124  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.512067  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0255  hypothetical protein  38.15 
 
 		 648 aa  443  1e-123  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.142183  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3725  hypothetical protein  39.51 
 
 		 649 aa  445  1e-123  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.24696 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0294  hypothetical protein  38.62 
 
 		 672 aa  434  1e-120  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0382  hypothetical protein  38.88 
 
 		 652 aa  428  1e-118  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.874173  normal  0.0118752 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0700  hypothetical protein  37.66 
 
 		 652 aa  424  1e-117  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.471001  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2415  hypothetical protein  33.44 
 
 		 648 aa  330  7e-89  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0829723  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4154  GTPase (dynamin-related)-like protein  31.43 
 
 		 660 aa  300  7e-80  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.67903 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05110  hypothetical protein  34.13 
 
 		 655 aa  295  2e-78  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0533  GTPase (dynamin-related)  43.26 
 
 		 654 aa  295  2e-78  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0490  hypothetical protein  33.96 
 
 		 655 aa  292  2e-77  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2377  hypothetical protein  29.24 
 
 		 659 aa  257  6e-67  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.0503347 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2756  hypothetical protein  29.24 
 
 		 659 aa  257  6e-67  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2994  dynamin family protein  26.45 
 
 		 614 aa  75.5  0.000000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.214598  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3036  dynamin family protein  26.45 
 
 		 614 aa  75.5  0.000000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0241135  normal  0.688737 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1193  hypothetical protein  26.18 
 
 		 614 aa  72.4  0.00000000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.108086  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2196  dynamin family protein  28.41 
 
 		 506 aa  70.5  0.00000000008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000046764 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1095  dynamin  23.61 
 
 		 588 aa  68.6  0.0000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.845511  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2259  Dynamin family protein  22.4 
 
 		 444 aa  63.2  0.00000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000551632  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2910  dynamin family protein  25.71 
 
 		 605 aa  60.1  0.0000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.518789  normal  0.400566 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2424  Dynamin family protein  23.13 
 
 		 666 aa  58.9  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1350  dynamin  24.07 
 
 		 693 aa  58.2  0.0000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0228271 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2209  GTP-binding protein  22.32 
 
 		 615 aa  55.5  0.000003  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0787  dynamin family protein  23.89 
 
 		 655 aa  53.9  0.000009  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.0394271  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2546  hypothetical protein  22.14 
 
 		 719 aa  51.6  0.00004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0908682 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1654  dynamin  27.39 
 
 		 686 aa  51.6  0.00004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0311974  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0859  GTP-binding protein  29.46 
 
 		 692 aa  50.4  0.0001  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.547864  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4018  hypothetical protein  24.82 
 
 		 814 aa  50.4  0.0001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.505763 
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_44250  predicted protein  31.58 
 
 		 632 aa  49.3  0.0002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.755773  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0624  hypothetical protein  28.04 
 
 		 602 aa  49.3  0.0002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.318926  normal  0.0782013 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6878  Dynamin family protein  26.64 
 
 		 620 aa  48.9  0.0003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1273  Dynamin family protein  24.71 
 
 		 407 aa  48.5  0.0004  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.0000000146438  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0914  Dynamin family protein  28.27 
 
 		 548 aa  48.1  0.0005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.440355 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2971  hypothetical protein  24 
 
 		 788 aa  47  0.001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.816575  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36820  hypothetical protein  25.33 
 
 		 624 aa  47.4  0.001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.19264 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2545  dynamin  21.63 
 
 		 390 aa  46.6  0.002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0649757  normal  0.0791445 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2968  dynamin family protein  34.48 
 
 		 583 aa  45.4  0.003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1377  dynamin family protein  29.48 
 
 		 585 aa  45.4  0.003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.682843  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0251  hypothetical protein  36.14 
 
 		 819 aa  45.8  0.003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0811563  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>