90 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHAB381_0859 on replicon NC_009714
Organism: Campylobacter hominis ATCC BAA-381



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009714  CHAB381_0859  GTP-binding protein  100 
 
 
692 aa  1368    Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.547864  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0437  GTP-binding protein  38.74 
 
 
692 aa  452  1.0000000000000001e-126  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0403  dynamin family protein  34.59 
 
 
693 aa  289  1e-76  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0336  conserved hypothetical protein, predicted ATP/GTP-binding protein  32.33 
 
 
741 aa  247  4e-64  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0460  GTP-binding protein  28.84 
 
 
728 aa  224  3e-57  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.839985  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0435  GTP-binding protein  29.37 
 
 
728 aa  223  8e-57  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1546  GTP-binding protein  28.84 
 
 
728 aa  221  3e-56  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0397  Dynamin family protein  30.16 
 
 
789 aa  191  5e-47  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0111735  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6878  Dynamin family protein  28.1 
 
 
620 aa  94.4  6e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0787  dynamin family protein  26.51 
 
 
655 aa  89  3e-16  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.0394271  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2994  dynamin family protein  23.25 
 
 
614 aa  70.9  0.00000000008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.214598  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3036  dynamin family protein  23.25 
 
 
614 aa  70.9  0.00000000008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0241135  normal  0.688737 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1896  Dynamin family protein  24.52 
 
 
1228 aa  69.7  0.0000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00444431  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2213  Dynamin family protein  23.81 
 
 
587 aa  67.4  0.0000000009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5314  hypothetical protein  26.33 
 
 
952 aa  67  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0860  GTP-binding protein  28.71 
 
 
601 aa  66.2  0.000000002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2910  dynamin family protein  22.27 
 
 
605 aa  65.9  0.000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.518789  normal  0.400566 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0322  Dynamin family protein  25.76 
 
 
585 aa  65.5  0.000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1095  dynamin  24.91 
 
 
588 aa  64.3  0.000000007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.845511  normal 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1545  GTP-binding protein  30.89 
 
 
569 aa  63.9  0.000000009  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.712051  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2259  Dynamin family protein  25.6 
 
 
444 aa  63.9  0.00000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000551632  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2392  Dynamin family protein  23.78 
 
 
1249 aa  63.5  0.00000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3531  dynamin family protein  24.21 
 
 
585 aa  63.5  0.00000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1377  dynamin family protein  24.21 
 
 
585 aa  63.2  0.00000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.682843  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2424  Dynamin family protein  28.43 
 
 
666 aa  62.4  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1193  hypothetical protein  24.34 
 
 
614 aa  62.4  0.00000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.108086  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1096  GTP-binding protein, HSR1-related  25.5 
 
 
664 aa  61.2  0.00000006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0337  conserved hypothetical protein, predicted ATP/GTP-binding protein  29.02 
 
 
605 aa  60.8  0.00000009  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0404  glucosamine fructose-6-phosphate aminotransferase (isomerizing)  28.5 
 
 
610 aa  60.1  0.0000001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0436  GTP-binding protein  30.73 
 
 
569 aa  60.5  0.0000001  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2968  dynamin family protein  25.57 
 
 
583 aa  59.3  0.0000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2209  GTP-binding protein  26.67 
 
 
615 aa  59.7  0.0000002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1439  Dynamin family protein  24.88 
 
 
546 aa  59.7  0.0000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.784928  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2425  GTP-binding protein HSR1-related  30.83 
 
 
533 aa  60.1  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5313  hypothetical protein  29.53 
 
 
743 aa  59.7  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0556  GTP-binding protein HSR1-related  23.74 
 
 
602 aa  59.3  0.0000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0329351  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0461  GTP-binding protein  30.21 
 
 
569 aa  59.7  0.0000002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.0612543  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0438  GTP-binding protein  25.65 
 
 
599 aa  59.3  0.0000002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0398  Dynamin family protein  24.37 
 
 
674 aa  58.9  0.0000003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1306  dynamin family protein  27.48 
 
 
1219 aa  58.9  0.0000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.604786  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2106  dynamin  23.71 
 
 
564 aa  58.5  0.0000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.78205 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6880  Dynamin family protein  25 
 
 
1164 aa  58.2  0.0000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0815  GTPase  24.86 
 
 
712 aa  57.8  0.0000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0830  hypothetical protein  24.86 
 
 
712 aa  57.4  0.0000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00896739  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0914  Dynamin family protein  23.12 
 
 
548 aa  57.4  0.0000009  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.440355 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1350  dynamin  24.88 
 
 
693 aa  57.4  0.0000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0228271 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1273  Dynamin family protein  20.42 
 
 
407 aa  57  0.000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.0000000146438  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0933  dynamin family protein  26 
 
 
679 aa  57  0.000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.807319  hitchhiker  0.00750508 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0632  Dynamin family protein  23.2 
 
 
589 aa  55.5  0.000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1494  dynamin family protein  25.49 
 
 
1219 aa  54.7  0.000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.248245  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0624  hypothetical protein  21.97 
 
 
602 aa  54.3  0.000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.318926  normal  0.0782013 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1451  GTP1/OBG family GTPase  25.73 
 
 
1219 aa  53.9  0.000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.472831  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1653  GTP-binding protein, HSR1-related  29.94 
 
 
524 aa  53.1  0.00001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0754256  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1451  GTP1/OBG family GTPase  25.11 
 
 
1219 aa  53.1  0.00002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1595  hypothetical protein  25.11 
 
 
1219 aa  52.8  0.00002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6054  hypothetical protein  38.46 
 
 
747 aa  53.1  0.00002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1665  hypothetical protein  25.11 
 
 
1219 aa  52.8  0.00002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1479  hypothetical protein  25.11 
 
 
1219 aa  52.8  0.00002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1741  hypothetical protein  25.11 
 
 
1219 aa  53.1  0.00002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000058782  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1701  hypothetical protein  25.11 
 
 
1219 aa  52  0.00003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36820  hypothetical protein  21.55 
 
 
624 aa  52.4  0.00003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.19264 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3715  hypothetical protein  25.71 
 
 
1219 aa  52.4  0.00003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0273  hypothetical protein  22.09 
 
 
608 aa  51.6  0.00005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1406  hypothetical protein  27.62 
 
 
914 aa  51.6  0.00005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1630  hypothetical protein  23.96 
 
 
1219 aa  51.2  0.00007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00254693  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4340  hypothetical protein  29.46 
 
 
655 aa  50.4  0.0001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0246276  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1298  hypothetical protein  21.67 
 
 
659 aa  50.1  0.0001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.594857  normal  0.225568 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0933  hypothetical protein  19.7 
 
 
578 aa  49.7  0.0002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0372  hypothetical protein  35.37 
 
 
587 aa  49.7  0.0002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1351  heat shock protein DnaJ-like  23.21 
 
 
741 aa  48.9  0.0003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0473185 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0904  hypothetical protein  19.42 
 
 
658 aa  48.9  0.0003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05110  hypothetical protein  26.85 
 
 
655 aa  48.5  0.0004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0490  hypothetical protein  26.85 
 
 
655 aa  48.5  0.0005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6053  hypothetical protein  44 
 
 
570 aa  48.5  0.0005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1501  hypothetical protein  24.68 
 
 
1146 aa  48.1  0.0006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1530  hypothetical protein  24.68 
 
 
1146 aa  48.1  0.0006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.532706  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0813  hypothetical protein  22.47 
 
 
516 aa  47.8  0.0007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0373  hypothetical protein  27.36 
 
 
737 aa  47.4  0.0008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_44250  predicted protein  24.19 
 
 
632 aa  47.4  0.0009  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.755773  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1510  GTP-binding protein HSR1-related  23.83 
 
 
523 aa  46.6  0.002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0969  Dynamin family protein  22.82 
 
 
648 aa  45.8  0.003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0828  hypothetical protein  21.26 
 
 
516 aa  45.8  0.003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000529126  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2547  dynamin  25.54 
 
 
551 aa  45.8  0.003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.164219 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0829  hypothetical protein  24.65 
 
 
660 aa  45.4  0.003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0612198  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0900  hypothetical protein  24.65 
 
 
660 aa  45.4  0.004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.347456  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0434  hypothetical protein  23.15 
 
 
619 aa  44.7  0.005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.827508  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1655  hypothetical protein  26.67 
 
 
659 aa  44.3  0.008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.92413  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0457  hypothetical protein  23.15 
 
 
619 aa  44.3  0.009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.374169  normal  0.488282 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0447  hypothetical protein  23.15 
 
 
619 aa  44.3  0.009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.276019  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4154  GTPase (dynamin-related)-like protein  29.22 
 
 
660 aa  44.3  0.009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.67903 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>