85 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mkms_0457 on replicon NC_008705
Organism: Mycobacterium sp. KMS



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008705  Mkms_0457  hypothetical protein  100 
 
 
619 aa  1254    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.374169  normal  0.488282 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10347  isoniazid inductible gene protein iniA  67.04 
 
 
640 aa  816    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.997288 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0273  hypothetical protein  82.52 
 
 
608 aa  1027    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0624  hypothetical protein  86.53 
 
 
602 aa  1055    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.318926  normal  0.0782013 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0434  hypothetical protein  99.84 
 
 
619 aa  1252    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.827508  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0447  hypothetical protein  100 
 
 
619 aa  1254    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.276019  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3084  hypothetical protein  43.34 
 
 
627 aa  462  1e-129  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0556  GTP-binding protein HSR1-related  35.54 
 
 
602 aa  339  8e-92  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0329351  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1639  dynamin family protein  36.68 
 
 
605 aa  332  2e-89  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.143429  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1654  dynamin family protein  36.74 
 
 
603 aa  322  9.999999999999999e-87  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.964955 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36820  hypothetical protein  34.43 
 
 
624 aa  316  7e-85  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.19264 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3807  dynamin family protein  29.07 
 
 
645 aa  179  2e-43  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0702524  normal  0.282695 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1654  dynamin  25.38 
 
 
686 aa  123  9.999999999999999e-27  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0311974  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2424  Dynamin family protein  26.18 
 
 
666 aa  100  1e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3729  hypothetical protein  29.47 
 
 
626 aa  84.7  0.000000000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.731679  normal  0.057897 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6878  Dynamin family protein  28.62 
 
 
620 aa  82.4  0.00000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1377  dynamin family protein  27.27 
 
 
585 aa  76.3  0.000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.682843  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5964  hypothetical protein  30.77 
 
 
641 aa  73.9  0.000000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0285067  normal  0.193033 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1095  dynamin  27.17 
 
 
588 aa  72.8  0.00000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.845511  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3531  dynamin family protein  24.76 
 
 
585 aa  70.5  0.00000000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2994  dynamin family protein  27.92 
 
 
614 aa  70.5  0.00000000009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.214598  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3036  dynamin family protein  27.92 
 
 
614 aa  70.5  0.00000000009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0241135  normal  0.688737 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39100  GTPase of unknown function  27.38 
 
 
617 aa  70.1  0.0000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  decreased coverage  0.0000974304  normal  0.356305 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7004  GTP-binding protein HSR1-related  28.47 
 
 
610 aa  69.7  0.0000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.793634  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0933  dynamin family protein  28.38 
 
 
679 aa  65.9  0.000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.807319  hitchhiker  0.00750508 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1193  hypothetical protein  27.48 
 
 
614 aa  64.7  0.000000005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.108086  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2968  dynamin family protein  28.4 
 
 
583 aa  62.4  0.00000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2425  GTP-binding protein HSR1-related  28.88 
 
 
533 aa  62  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2545  dynamin  26.04 
 
 
390 aa  60.8  0.00000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0649757  normal  0.0791445 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2546  hypothetical protein  23.92 
 
 
719 aa  59.7  0.0000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0908682 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2259  Dynamin family protein  26.2 
 
 
444 aa  59.7  0.0000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000551632  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2106  dynamin  27.49 
 
 
564 aa  56.2  0.000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.78205 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0859  GTP-binding protein  23.15 
 
 
692 aa  57  0.000001  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.547864  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2196  dynamin family protein  22.54 
 
 
506 aa  56.2  0.000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000046764 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1273  Dynamin family protein  27.78 
 
 
407 aa  56.2  0.000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.0000000146438  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1653  GTP-binding protein, HSR1-related  29.23 
 
 
524 aa  55.5  0.000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0754256  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0914  Dynamin family protein  28.48 
 
 
548 aa  55.5  0.000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.440355 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0632  Dynamin family protein  23.44 
 
 
589 aa  55.1  0.000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0403  dynamin family protein  23.81 
 
 
693 aa  54.7  0.000005  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3083  putative GTPase of unknown function  29.63 
 
 
496 aa  53.9  0.000009  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5963  hypothetical protein  29.02 
 
 
610 aa  53.9  0.000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0107791  normal  0.0849156 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0815  GTPase  25.54 
 
 
712 aa  53.5  0.00001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2910  dynamin family protein  23.47 
 
 
605 aa  53.9  0.00001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.518789  normal  0.400566 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0830  hypothetical protein  25.54 
 
 
712 aa  53.1  0.00002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00896739  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0437  GTP-binding protein  23.73 
 
 
692 aa  52.4  0.00002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3727  hypothetical protein  39.34 
 
 
503 aa  51.6  0.00004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0286482 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1439  Dynamin family protein  26.58 
 
 
546 aa  51.2  0.00005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.784928  normal 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0860  GTP-binding protein  29.41 
 
 
601 aa  51.6  0.00005  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0700  hypothetical protein  25.53 
 
 
652 aa  51.2  0.00006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.471001  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1350  dynamin  22.98 
 
 
693 aa  50.8  0.00007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0228271 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6053  hypothetical protein  31.58 
 
 
570 aa  50.8  0.00007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0435  GTP-binding protein  21.19 
 
 
728 aa  50.8  0.00008  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0460  GTP-binding protein  21.19 
 
 
728 aa  50.8  0.00008  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.839985  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10348  isoniazid inductible gene protein iniC  27.09 
 
 
493 aa  50.1  0.0001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1149  hypothetical protein  29.93 
 
 
602 aa  49.3  0.0002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.141307  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2392  Dynamin family protein  27.01 
 
 
1249 aa  49.3  0.0002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0438  GTP-binding protein  24.14 
 
 
599 aa  49.3  0.0002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1494  dynamin family protein  24.23 
 
 
1219 aa  49.3  0.0002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.248245  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1741  hypothetical protein  24.23 
 
 
1219 aa  48.1  0.0004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000058782  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1665  hypothetical protein  24.23 
 
 
1219 aa  48.5  0.0004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1595  hypothetical protein  24.23 
 
 
1219 aa  48.1  0.0004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1451  GTP1/OBG family GTPase  24.23 
 
 
1219 aa  48.5  0.0004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.472831  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1546  GTP-binding protein  20.45 
 
 
728 aa  48.1  0.0004  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1479  hypothetical protein  24.23 
 
 
1219 aa  48.1  0.0004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1451  GTP1/OBG family GTPase  24.23 
 
 
1219 aa  48.5  0.0004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1896  Dynamin family protein  24.68 
 
 
1228 aa  47.8  0.0005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00444431  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3725  hypothetical protein  41.79 
 
 
649 aa  48.1  0.0005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.24696 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2213  Dynamin family protein  26.67 
 
 
587 aa  48.1  0.0005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1306  dynamin family protein  22.68 
 
 
1219 aa  47.8  0.0005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.604786  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6880  Dynamin family protein  26.28 
 
 
1164 aa  47.8  0.0006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1351  heat shock protein DnaJ-like  29.41 
 
 
741 aa  47.8  0.0007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0473185 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1653  GTP-binding protein, HSR1-related  33.72 
 
 
501 aa  47.4  0.0009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.481236  normal  0.975567 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3715  hypothetical protein  23.71 
 
 
1219 aa  46.6  0.001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1630  hypothetical protein  23.71 
 
 
1219 aa  47  0.001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00254693  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2209  GTP-binding protein  26.62 
 
 
615 aa  46.6  0.001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3806  GTP-binding protein, HSR1-related  35.25 
 
 
527 aa  45.8  0.002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0425817  normal  0.277341 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1701  hypothetical protein  23.71 
 
 
1219 aa  45.8  0.002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2547  dynamin  23.37 
 
 
551 aa  45.8  0.002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.164219 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1638  GTP-binding protein HSR1-related  34.88 
 
 
501 aa  45.8  0.002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.178731  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0398  Dynamin family protein  28.08 
 
 
674 aa  45.4  0.003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0397  Dynamin family protein  24.77 
 
 
789 aa  45.4  0.003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0111735  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0533  GTPase (dynamin-related)  23.65 
 
 
654 aa  45.8  0.003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0813  hypothetical protein  25.13 
 
 
516 aa  45.1  0.004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0900  hypothetical protein  37.5 
 
 
660 aa  43.9  0.009  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.347456  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0829  hypothetical protein  37.5 
 
 
660 aa  43.9  0.009  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0612198  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>