35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPA7_6054 on replicon NC_009656
Organism: Pseudomonas aeruginosa PA7



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009656  PSPA7_6054  hypothetical protein  100 
 
 		 747 aa  1538    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0373  hypothetical protein  36.87 
 
 		 737 aa  432  1e-119  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0397  Dynamin family protein  26.44 
 
 		 789 aa  72  0.00000000004  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0111735  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1530  hypothetical protein  24.08 
 
 		 1146 aa  71.6  0.00000000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.532706  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1501  hypothetical protein  24.08 
 
 		 1146 aa  71.6  0.00000000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0787  dynamin family protein  33.72 
 
 		 655 aa  70.9  0.00000000007  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.0394271  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1013  hypothetical protein  24.15 
 
 		 1145 aa  67.8  0.0000000007  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.445275  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0336  conserved hypothetical protein, predicted ATP/GTP-binding protein  22.66 
 
 		 741 aa  64.3  0.000000007  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0460  GTP-binding protein  24.23 
 
 		 728 aa  61.2  0.00000006  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.839985  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0435  GTP-binding protein  25.77 
 
 		 728 aa  60.5  0.0000001  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1546  GTP-binding protein  25.77 
 
 		 728 aa  60.1  0.0000002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3727  hypothetical protein  26.87 
 
 		 764 aa  57  0.000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3460  hypothetical protein  26.87 
 
 		 659 aa  57  0.000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3239  hypothetical protein  25.91 
 
 		 669 aa  57  0.000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.983308  normal  0.678486 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0403  dynamin family protein  27.42 
 
 		 693 aa  57.4  0.000001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4145  hypothetical protein  24.71 
 
 		 690 aa  56.6  0.000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.487831 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3241  hypothetical protein  27.99 
 
 		 701 aa  55.5  0.000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.424081  normal  0.24585 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2209  GTP-binding protein  34.38 
 
 		 615 aa  54.7  0.000007  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0859  GTP-binding protein  38.46 
 
 		 692 aa  53.1  0.00002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.547864  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0398  Dynamin family protein  36.25 
 
 		 674 aa  50.1  0.0001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3036  dynamin family protein  37.68 
 
 		 614 aa  50.1  0.0001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0241135  normal  0.688737 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2994  dynamin family protein  37.68 
 
 		 614 aa  50.1  0.0001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.214598  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1439  Dynamin family protein  39.39 
 
 		 546 aa  50.1  0.0002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.784928  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1406  hypothetical protein  23.14 
 
 		 914 aa  48.5  0.0004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0438  GTP-binding protein  32.93 
 
 		 599 aa  48.5  0.0004  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1096  GTP-binding protein, HSR1-related  41.38 
 
 		 664 aa  48.1  0.0006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0933  dynamin family protein  44.83 
 
 		 679 aa  47.8  0.0007  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.807319  hitchhiker  0.00750508 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1095  dynamin  37.5 
 
 		 588 aa  45.8  0.003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.845511  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1896  Dynamin family protein  33.78 
 
 		 1228 aa  45.8  0.003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00444431  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0437  GTP-binding protein  25.62 
 
 		 692 aa  45.8  0.003  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1545  GTP-binding protein  36.51 
 
 		 569 aa  45.4  0.004  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.712051  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0436  GTP-binding protein  36.67 
 
 		 569 aa  45.4  0.004  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6878  Dynamin family protein  28.57 
 
 		 620 aa  45.1  0.005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2392  Dynamin family protein  37.66 
 
 		 1249 aa  44.7  0.007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2910  dynamin family protein  37.04 
 
 		 605 aa  44.3  0.009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.518789  normal  0.400566 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>