57 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smal_0372 on replicon NC_011071
Organism: Stenotrophomonas maltophilia R551-3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011071  Smal_0372  hypothetical protein  100 
 
 		 587 aa  1176    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6053  hypothetical protein  36.02 
 
 		 570 aa  335  2e-90  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6880  Dynamin family protein  31.28 
 
 		 1164 aa  72  0.00000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2213  Dynamin family protein  25.26 
 
 		 587 aa  67.8  0.0000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0632  Dynamin family protein  25.53 
 
 		 589 aa  66.2  0.000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0933  dynamin family protein  27.57 
 
 		 679 aa  65.9  0.000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.807319  hitchhiker  0.00750508 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3036  dynamin family protein  27.51 
 
 		 614 aa  66.2  0.000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0241135  normal  0.688737 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2994  dynamin family protein  27.51 
 
 		 614 aa  66.2  0.000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.214598  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0914  Dynamin family protein  26.27 
 
 		 548 aa  63.5  0.000000009  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.440355 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1273  Dynamin family protein  27.97 
 
 		 407 aa  63.9  0.000000009  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.0000000146438  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6878  Dynamin family protein  26.34 
 
 		 620 aa  63.9  0.000000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0404  glucosamine fructose-6-phosphate aminotransferase (isomerizing)  30.77 
 
 		 610 aa  61.6  0.00000003  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1096  GTP-binding protein, HSR1-related  30.48 
 
 		 664 aa  61.6  0.00000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0322  Dynamin family protein  29.32 
 
 		 585 aa  60.8  0.00000007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2968  dynamin family protein  27.6 
 
 		 583 aa  60.5  0.00000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1439  Dynamin family protein  26.07 
 
 		 546 aa  60.1  0.0000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.784928  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0374  hypothetical protein  27 
 
 		 621 aa  58.9  0.0000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1545  GTP-binding protein  35.24 
 
 		 569 aa  57.8  0.0000006  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.712051  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2106  dynamin  27.05 
 
 		 564 aa  56.6  0.000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.78205 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2259  Dynamin family protein  25.64 
 
 		 444 aa  56.2  0.000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000551632  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0436  GTP-binding protein  34.95 
 
 		 569 aa  55.8  0.000002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0337  conserved hypothetical protein, predicted ATP/GTP-binding protein  32.04 
 
 		 605 aa  55.8  0.000002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2910  dynamin family protein  28.7 
 
 		 605 aa  55.5  0.000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.518789  normal  0.400566 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0438  GTP-binding protein  27.08 
 
 		 599 aa  55.5  0.000003  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1095  dynamin  23.2 
 
 		 588 aa  55.5  0.000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.845511  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1377  dynamin family protein  25.12 
 
 		 585 aa  55.5  0.000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.682843  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0860  GTP-binding protein  40.3 
 
 		 601 aa  54.3  0.000006  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2209  GTP-binding protein  26.32 
 
 		 615 aa  54.3  0.000006  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2546  hypothetical protein  28.17 
 
 		 719 aa  52.8  0.00002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0908682 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0398  Dynamin family protein  24.46 
 
 		 674 aa  52.8  0.00002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1193  hypothetical protein  26.02 
 
 		 614 aa  51.6  0.00004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.108086  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0859  GTP-binding protein  35.37 
 
 		 692 aa  49.7  0.0001  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.547864  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6055  hypothetical protein  22.57 
 
 		 696 aa  48.9  0.0002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3083  putative GTPase of unknown function  26.5 
 
 		 496 aa  48.9  0.0002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1225  hypothetical protein  35.06 
 
 		 793 aa  49.7  0.0002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.640343  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3531  dynamin family protein  24.38 
 
 		 585 aa  49.3  0.0002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2545  dynamin  30.77 
 
 		 390 aa  49.3  0.0002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0649757  normal  0.0791445 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0461  GTP-binding protein  33.01 
 
 		 569 aa  48.5  0.0004  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.0612543  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1639  dynamin family protein  31.2 
 
 		 605 aa  48.1  0.0004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.143429  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0830  hypothetical protein  24.81 
 
 		 712 aa  47.4  0.0007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00896739  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0815  GTPase  24.81 
 
 		 712 aa  47.4  0.0007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0397  Dynamin family protein  27.42 
 
 		 789 aa  47.4  0.0008  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0111735  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1653  GTP-binding protein, HSR1-related  25.6 
 
 		 524 aa  47  0.0009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0754256  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0435  GTP-binding protein  24.43 
 
 		 728 aa  46.6  0.001  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1733  hypothetical protein  29.46 
 
 		 976 aa  47  0.001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0787  dynamin family protein  39.29 
 
 		 655 aa  45.8  0.002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.0394271  n/a   
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_44250  predicted protein  27.15 
 
 		 632 aa  46.2  0.002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.755773  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1546  GTP-binding protein  24.05 
 
 		 728 aa  45.8  0.002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1654  dynamin family protein  26.29 
 
 		 603 aa  45.4  0.003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.964955 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0460  GTP-binding protein  24.02 
 
 		 728 aa  45.4  0.003  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.839985  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1741  hypothetical protein  26.4 
 
 		 1219 aa  43.9  0.008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000058782  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1451  GTP1/OBG family GTPase  26.4 
 
 		 1219 aa  43.9  0.008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.472831  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1595  hypothetical protein  26.4 
 
 		 1219 aa  43.5  0.01  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1451  GTP1/OBG family GTPase  26.4 
 
 		 1219 aa  43.5  0.01  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1501  hypothetical protein  27.43 
 
 		 1146 aa  43.5  0.01  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1479  hypothetical protein  26.4 
 
 		 1219 aa  43.5  0.01  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1530  hypothetical protein  27.43 
 
 		 1146 aa  43.5  0.01  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.532706  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>