64 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnap_0904 on replicon NC_008781
Organism: Polaromonas naphthalenivorans CJ2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011992  Dtpsy_0829  hypothetical protein  64.45 
 
 		 660 aa  842    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0612198  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5428  hypothetical protein  60.53 
 
 		 672 aa  773    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.832093 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4340  hypothetical protein  62.06 
 
 		 655 aa  808    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0246276  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0900  hypothetical protein  64.3 
 
 		 660 aa  840    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.347456  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0904  hypothetical protein  100 
 
 		 658 aa  1320    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3605  hypothetical protein  64.09 
 
 		 653 aa  823    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.169107  normal  0.037636 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1298  hypothetical protein  78.15 
 
 		 659 aa  1028    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.594857  normal  0.225568 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1655  hypothetical protein  69.51 
 
 		 659 aa  876    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.92413  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3234  hypothetical protein  51.43 
 
 		 675 aa  603  1.0000000000000001e-171  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.220852  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3493  hypothetical protein  49.44 
 
 		 709 aa  566  1e-160  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000901673 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3725  hypothetical protein  42.11 
 
 		 649 aa  505  1e-141  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.24696 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0294  hypothetical protein  41.77 
 
 		 672 aa  486  1e-136  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0347  hypothetical protein  41.46 
 
 		 651 aa  480  1e-134  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.512067  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0400  hypothetical protein  39.41 
 
 		 662 aa  476  1e-133  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0733804  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0282  hypothetical protein  40.19 
 
 		 648 aa  476  1e-133  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0255  hypothetical protein  40.19 
 
 		 648 aa  466  9.999999999999999e-131  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.142183  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3622  hypothetical protein  40.49 
 
 		 654 aa  462  1e-129  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.300251  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0700  hypothetical protein  38.92 
 
 		 652 aa  452  1e-125  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.471001  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0382  hypothetical protein  39.67 
 
 		 652 aa  441  9.999999999999999e-123  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.874173  normal  0.0118752 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2415  hypothetical protein  35.59 
 
 		 648 aa  355  1e-96  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0829723  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0490  hypothetical protein  44.36 
 
 		 655 aa  316  9e-85  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05110  hypothetical protein  44.36 
 
 		 655 aa  315  9.999999999999999e-85  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4154  GTPase (dynamin-related)-like protein  43.08 
 
 		 660 aa  316  9.999999999999999e-85  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.67903 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0533  GTPase (dynamin-related)  42.28 
 
 		 654 aa  297  4e-79  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2756  hypothetical protein  30.51 
 
 		 659 aa  275  3e-72  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2377  hypothetical protein  30.51 
 
 		 659 aa  275  3e-72  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.0503347 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1193  hypothetical protein  26.42 
 
 		 614 aa  80.5  0.00000000000008  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.108086  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3036  dynamin family protein  29.56 
 
 		 614 aa  79  0.0000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0241135  normal  0.688737 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2994  dynamin family protein  29.56 
 
 		 614 aa  79  0.0000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.214598  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2910  dynamin family protein  24.85 
 
 		 605 aa  72.4  0.00000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.518789  normal  0.400566 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2196  dynamin family protein  26.32 
 
 		 506 aa  65.1  0.000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000046764 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1095  dynamin  27.67 
 
 		 588 aa  58.9  0.0000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.845511  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2259  Dynamin family protein  25 
 
 		 444 aa  58.2  0.0000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000551632  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6878  Dynamin family protein  32.52 
 
 		 620 aa  54.7  0.000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2968  dynamin family protein  33.55 
 
 		 583 aa  54.3  0.000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0914  Dynamin family protein  29.84 
 
 		 548 aa  54.7  0.000006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.440355 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2209  GTP-binding protein  22.48 
 
 		 615 aa  54.3  0.000008  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0322  Dynamin family protein  31.9 
 
 		 585 aa  53.9  0.000009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2392  Dynamin family protein  24.09 
 
 		 1249 aa  53.5  0.00001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36820  hypothetical protein  25.65 
 
 		 624 aa  53.5  0.00001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.19264 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3531  dynamin family protein  32.35 
 
 		 585 aa  51.2  0.00006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2424  Dynamin family protein  29.55 
 
 		 666 aa  50.8  0.00007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0787  dynamin family protein  23.51 
 
 		 655 aa  50.8  0.00009  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.0394271  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0624  hypothetical protein  28.57 
 
 		 602 aa  50.4  0.0001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.318926  normal  0.0782013 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1654  dynamin  26.14 
 
 		 686 aa  50.4  0.0001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0311974  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0251  hypothetical protein  33.07 
 
 		 819 aa  49.3  0.0002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0811563  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1350  dynamin  25 
 
 		 693 aa  49.7  0.0002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0228271 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1896  Dynamin family protein  23.68 
 
 		 1228 aa  48.9  0.0003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00444431  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0859  GTP-binding protein  19.8 
 
 		 692 aa  48.9  0.0003  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.547864  n/a   
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_44250  predicted protein  33.33 
 
 		 632 aa  47  0.001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.755773  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1377  dynamin family protein  32.12 
 
 		 585 aa  45.8  0.003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.682843  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1595  hypothetical protein  23.78 
 
 		 1219 aa  45.1  0.004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1479  hypothetical protein  23.78 
 
 		 1219 aa  45.1  0.004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0437  GTP-binding protein  30.11 
 
 		 692 aa  44.7  0.006  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2106  dynamin  29.63 
 
 		 564 aa  44.7  0.006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.78205 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1701  hypothetical protein  23.5 
 
 		 1219 aa  44.7  0.006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4018  hypothetical protein  33.72 
 
 		 814 aa  44.3  0.007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.505763 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1665  hypothetical protein  23.5 
 
 		 1219 aa  44.3  0.008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3715  hypothetical protein  23.71 
 
 		 1219 aa  44.3  0.008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1451  GTP1/OBG family GTPase  23.5 
 
 		 1219 aa  44.3  0.008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.472831  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1451  GTP1/OBG family GTPase  23.5 
 
 		 1219 aa  44.3  0.008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1439  Dynamin family protein  31.93 
 
 		 546 aa  43.9  0.008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.784928  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1741  hypothetical protein  23.43 
 
 		 1219 aa  43.9  0.009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000058782  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0556  GTP-binding protein HSR1-related  31.61 
 
 		 602 aa  43.9  0.009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0329351  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>