185 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_2910 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008554  Sfum_2910  dynamin family protein  100 
 
 		 605 aa  1225    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.518789  normal  0.400566 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2994  dynamin family protein  36.38 
 
 		 614 aa  358  9.999999999999999e-98  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.214598  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3036  dynamin family protein  36.38 
 
 		 614 aa  358  9.999999999999999e-98  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0241135  normal  0.688737 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1193  hypothetical protein  32.72 
 
 		 614 aa  270  5.9999999999999995e-71  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.108086  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2196  dynamin family protein  29.26 
 
 		 506 aa  263  8e-69  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000046764 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2259  Dynamin family protein  33.96 
 
 		 444 aa  259  1e-67  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000551632  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1095  dynamin  28.23 
 
 		 588 aa  215  1.9999999999999998e-54  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.845511  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1273  Dynamin family protein  28.17 
 
 		 407 aa  164  4.0000000000000004e-39  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.0000000146438  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6878  Dynamin family protein  31.76 
 
 		 620 aa  143  9.999999999999999e-33  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3531  dynamin family protein  33.47 
 
 		 585 aa  127  5e-28  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2424  Dynamin family protein  25.6 
 
 		 666 aa  124  5e-27  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1439  Dynamin family protein  29.37 
 
 		 546 aa  122  1.9999999999999998e-26  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.784928  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0914  Dynamin family protein  30.56 
 
 		 548 aa  120  6e-26  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.440355 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5314  hypothetical protein  26.7 
 
 		 952 aa  120  9e-26  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2213  Dynamin family protein  33.33 
 
 		 587 aa  116  8.999999999999998e-25  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6880  Dynamin family protein  32.2 
 
 		 1164 aa  112  2.0000000000000002e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1377  dynamin family protein  30.89 
 
 		 585 aa  112  3e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.682843  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2968  dynamin family protein  32.35 
 
 		 583 aa  107  6e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1350  dynamin  34.07 
 
 		 693 aa  107  8e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0228271 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0322  Dynamin family protein  31.54 
 
 		 585 aa  105  2e-21  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1654  dynamin  28.25 
 
 		 686 aa  104  4e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0311974  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0398  Dynamin family protein  26.81 
 
 		 674 aa  102  2e-20  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3084  hypothetical protein  25.66 
 
 		 627 aa  101  3e-20  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0933  dynamin family protein  25.93 
 
 		 679 aa  97.8  5e-19  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.807319  hitchhiker  0.00750508 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2209  GTP-binding protein  28.06 
 
 		 615 aa  96.3  2e-18  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0830  hypothetical protein  30.04 
 
 		 712 aa  94  7e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00896739  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0815  GTPase  30.04 
 
 		 712 aa  94  7e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0632  Dynamin family protein  33.52 
 
 		 589 aa  92.8  2e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2106  dynamin  28.01 
 
 		 564 aa  90.5  7e-17  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.78205 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0404  glucosamine fructose-6-phosphate aminotransferase (isomerizing)  32.39 
 
 		 610 aa  90.5  8e-17  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2546  hypothetical protein  26.02 
 
 		 719 aa  90.1  1e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0908682 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0397  Dynamin family protein  23.98 
 
 		 789 aa  89.4  2e-16  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0111735  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0438  GTP-binding protein  25.75 
 
 		 599 aa  89.4  2e-16  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_44250  predicted protein  27.4 
 
 		 632 aa  89  2e-16  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.755773  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0403  dynamin family protein  24.81 
 
 		 693 aa  89  2e-16  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1639  dynamin family protein  31.33 
 
 		 605 aa  88.6  3e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.143429  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1654  dynamin family protein  31.1 
 
 		 603 aa  87.4  7e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.964955 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1096  GTP-binding protein, HSR1-related  25.15 
 
 		 664 aa  85.1  0.000000000000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2547  dynamin  25.82 
 
 		 551 aa  85.1  0.000000000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.164219 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5964  hypothetical protein  25.2 
 
 		 641 aa  80.9  0.00000000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0285067  normal  0.193033 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2545  dynamin  25.75 
 
 		 390 aa  80.9  0.00000000000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0649757  normal  0.0791445 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0382  hypothetical protein  24.92 
 
 		 652 aa  79  0.0000000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.874173  normal  0.0118752 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0787  dynamin family protein  24 
 
 		 655 aa  79.3  0.0000000000002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.0394271  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0860  GTP-binding protein  28.46 
 
 		 601 aa  79.3  0.0000000000002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1306  dynamin family protein  24.24 
 
 		 1219 aa  78.6  0.0000000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.604786  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1494  dynamin family protein  24.77 
 
 		 1219 aa  78.2  0.0000000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.248245  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2392  Dynamin family protein  26.52 
 
 		 1249 aa  77.8  0.0000000000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05110  hypothetical protein  25 
 
 		 655 aa  77  0.0000000000009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0490  hypothetical protein  25.3 
 
 		 655 aa  77  0.0000000000009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0700  hypothetical protein  23.58 
 
 		 652 aa  76.6  0.000000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.471001  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1351  heat shock protein DnaJ-like  24.92 
 
 		 741 aa  75.5  0.000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0473185 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4154  GTPase (dynamin-related)-like protein  25.37 
 
 		 660 aa  75.1  0.000000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.67903 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1896  Dynamin family protein  29.65 
 
 		 1228 aa  75.1  0.000000000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00444431  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39100  GTPase of unknown function  29.02 
 
 		 617 aa  74.3  0.000000000006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  decreased coverage  0.0000974304  normal  0.356305 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0337  conserved hypothetical protein, predicted ATP/GTP-binding protein  23.41 
 
 		 605 aa  74.3  0.000000000006  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0969  Dynamin family protein  27.54 
 
 		 648 aa  73.2  0.00000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3725  hypothetical protein  27.3 
 
 		 649 aa  72.4  0.00000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.24696 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0904  hypothetical protein  24.85 
 
 		 658 aa  72.4  0.00000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0336  conserved hypothetical protein, predicted ATP/GTP-binding protein  22.26 
 
 		 741 aa  71.6  0.00000000003  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0556  GTP-binding protein HSR1-related  27.78 
 
 		 602 aa  71.6  0.00000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0329351  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1298  hypothetical protein  26.91 
 
 		 659 aa  71.6  0.00000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.594857  normal  0.225568 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1655  hypothetical protein  26.65 
 
 		 659 aa  71.2  0.00000000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.92413  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3622  hypothetical protein  24.26 
 
 		 654 aa  70.9  0.00000000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.300251  n/a   
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5313  hypothetical protein  28.99 
 
 		 743 aa  70.9  0.00000000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1451  GTP1/OBG family GTPase  29.03 
 
 		 1219 aa  70.9  0.00000000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1451  GTP1/OBG family GTPase  29.03 
 
 		 1219 aa  70.9  0.00000000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.472831  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0347  hypothetical protein  25.82 
 
 		 651 aa  70.9  0.00000000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.512067  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3605  hypothetical protein  26.28 
 
 		 653 aa  70.9  0.00000000007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.169107  normal  0.037636 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1665  hypothetical protein  29.03 
 
 		 1219 aa  70.5  0.00000000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3234  hypothetical protein  23.66 
 
 		 675 aa  70.5  0.00000000008  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.220852  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5428  hypothetical protein  26.63 
 
 		 672 aa  70.5  0.00000000009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.832093 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1545  GTP-binding protein  31.71 
 
 		 569 aa  70.1  0.0000000001  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.712051  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1741  hypothetical protein  27.96 
 
 		 1219 aa  70.1  0.0000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000058782  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1701  hypothetical protein  27.96 
 
 		 1219 aa  69.7  0.0000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1630  hypothetical protein  27.96 
 
 		 1219 aa  69.3  0.0000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00254693  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3715  hypothetical protein  27.96 
 
 		 1219 aa  69.7  0.0000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0900  hypothetical protein  24.85 
 
 		 660 aa  68.6  0.0000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.347456  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0829  hypothetical protein  24.85 
 
 		 660 aa  68.6  0.0000000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0612198  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1479  hypothetical protein  28.49 
 
 		 1219 aa  68.2  0.0000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1595  hypothetical protein  28.49 
 
 		 1219 aa  68.2  0.0000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0436  GTP-binding protein  26.94 
 
 		 569 aa  68.6  0.0000000004  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0533  GTPase (dynamin-related)  23.88 
 
 		 654 aa  67  0.0000000009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0461  GTP-binding protein  25.89 
 
 		 569 aa  67  0.000000001  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.0612543  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7004  GTP-binding protein HSR1-related  29.31 
 
 		 610 aa  66.6  0.000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.793634  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36820  hypothetical protein  25.48 
 
 		 624 aa  65.9  0.000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.19264 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0859  GTP-binding protein  22.27 
 
 		 692 aa  65.9  0.000000002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.547864  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0294  hypothetical protein  23.82 
 
 		 672 aa  65.5  0.000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1501  hypothetical protein  24.34 
 
 		 1146 aa  64.3  0.000000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1530  hypothetical protein  24.34 
 
 		 1146 aa  64.3  0.000000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.532706  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2958  GTPase  24.31 
 
 		 768 aa  63.9  0.000000007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  unclonable  0.000000016463  unclonable  0.0000121851 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1510  GTP-binding protein HSR1-related  21.56 
 
 		 523 aa  63.9  0.000000008  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1013  hypothetical protein  22.89 
 
 		 1145 aa  63.5  0.000000009  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.445275  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0624  hypothetical protein  23.24 
 
 		 602 aa  62.4  0.00000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.318926  normal  0.0782013 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0625  isoniazid inductible gene protein IniC  27.31 
 
 		 496 aa  62.8  0.00000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0105414  normal  0.124728 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3729  hypothetical protein  27.88 
 
 		 626 aa  61.2  0.00000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.731679  normal  0.057897 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10348  isoniazid inductible gene protein iniC  26.85 
 
 		 493 aa  61.2  0.00000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0437  GTP-binding protein  24.08 
 
 		 692 aa  61.2  0.00000006  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0435  GTP-binding protein  22.49 
 
 		 728 aa  60.8  0.00000007  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3727  hypothetical protein  31.58 
 
 		 503 aa  60.5  0.00000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0286482 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1546  GTP-binding protein  22.15 
 
 		 728 aa  60.1  0.0000001  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>