64 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_3729 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013947  Snas_3729  hypothetical protein  100 
 
 		 626 aa  1269    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.731679  normal  0.057897 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7004  GTP-binding protein HSR1-related  37.52 
 
 		 610 aa  353  8e-96  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.793634  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39100  GTPase of unknown function  35.29 
 
 		 617 aa  326  1e-87  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  decreased coverage  0.0000974304  normal  0.356305 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1149  hypothetical protein  32.07 
 
 		 602 aa  137  7.000000000000001e-31  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.141307  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5964  hypothetical protein  36.74 
 
 		 641 aa  125  2e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0285067  normal  0.193033 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1654  dynamin family protein  37.91 
 
 		 603 aa  119  9.999999999999999e-26  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.964955 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1639  dynamin family protein  39.3 
 
 		 605 aa  118  3e-25  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.143429  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3084  hypothetical protein  31.36 
 
 		 627 aa  112  2.0000000000000002e-23  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0624  hypothetical protein  32.4 
 
 		 602 aa  103  1e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.318926  normal  0.0782013 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0273  hypothetical protein  31.18 
 
 		 608 aa  94  7e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1654  dynamin  30.62 
 
 		 686 aa  88.2  4e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0311974  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2994  dynamin family protein  29.91 
 
 		 614 aa  84.3  0.000000000000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.214598  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3036  dynamin family protein  29.91 
 
 		 614 aa  84.3  0.000000000000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0241135  normal  0.688737 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10347  isoniazid inductible gene protein iniA  26.7 
 
 		 640 aa  80.9  0.00000000000007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.997288 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1193  hypothetical protein  31.43 
 
 		 614 aa  77.4  0.0000000000007  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.108086  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2424  Dynamin family protein  28.83 
 
 		 666 aa  76.3  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0457  hypothetical protein  29.51 
 
 		 619 aa  74.7  0.000000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.374169  normal  0.488282 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0434  hypothetical protein  29.47 
 
 		 619 aa  74.7  0.000000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.827508  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0447  hypothetical protein  29.51 
 
 		 619 aa  74.7  0.000000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.276019  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0556  GTP-binding protein HSR1-related  32.57 
 
 		 602 aa  69.7  0.0000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0329351  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2259  Dynamin family protein  24.13 
 
 		 444 aa  68.6  0.0000000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000551632  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36820  hypothetical protein  25.16 
 
 		 624 aa  67.8  0.0000000006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.19264 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1273  Dynamin family protein  31.58 
 
 		 407 aa  61.6  0.00000004  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.0000000146438  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1377  dynamin family protein  27.95 
 
 		 585 aa  61.6  0.00000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.682843  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1095  dynamin  28.42 
 
 		 588 aa  61.2  0.00000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.845511  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2910  dynamin family protein  28.02 
 
 		 605 aa  61.6  0.00000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.518789  normal  0.400566 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0787  dynamin family protein  21.66 
 
 		 655 aa  60.1  0.0000001  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.0394271  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2106  dynamin  28.48 
 
 		 564 aa  59.7  0.0000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.78205 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5963  hypothetical protein  31.68 
 
 		 610 aa  59.3  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0107791  normal  0.0849156 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6878  Dynamin family protein  26.85 
 
 		 620 aa  59.3  0.0000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10212  hypothetical protein  19.45 
 
 		 492 aa  55.5  0.000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.506116  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3807  dynamin family protein  30.17 
 
 		 645 aa  53.9  0.000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0702524  normal  0.282695 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3531  dynamin family protein  25.96 
 
 		 585 aa  53.5  0.00001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1653  GTP-binding protein, HSR1-related  31.75 
 
 		 501 aa  52  0.00003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.481236  normal  0.975567 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2968  dynamin family protein  25.25 
 
 		 583 aa  51.6  0.00004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2213  Dynamin family protein  24.02 
 
 		 587 aa  51.2  0.00005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2196  dynamin family protein  24.13 
 
 		 506 aa  51.2  0.00006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000046764 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0914  Dynamin family protein  27.72 
 
 		 548 aa  50.8  0.00008  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.440355 
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_44250  predicted protein  25.25 
 
 		 632 aa  50.1  0.0001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.755773  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1638  GTP-binding protein HSR1-related  31.75 
 
 		 501 aa  50.4  0.0001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.178731  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3083  putative GTPase of unknown function  30.22 
 
 		 496 aa  50.1  0.0001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3806  GTP-binding protein, HSR1-related  37.27 
 
 		 527 aa  50.1  0.0001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0425817  normal  0.277341 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1350  dynamin  24.86 
 
 		 693 aa  49.7  0.0002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0228271 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2392  Dynamin family protein  42.42 
 
 		 1249 aa  49.3  0.0002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0632  Dynamin family protein  25 
 
 		 589 aa  49.7  0.0002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0336  conserved hypothetical protein, predicted ATP/GTP-binding protein  20.57 
 
 		 741 aa  48.1  0.0005  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1896  Dynamin family protein  40.38 
 
 		 1228 aa  48.1  0.0005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00444431  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39120  GTPase of unknown function  28.83 
 
 		 536 aa  47  0.001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.480255 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0164  hypothetical protein  22.78 
 
 		 497 aa  47  0.001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.319056 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1701  hypothetical protein  38.46 
 
 		 1219 aa  45.4  0.003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1665  hypothetical protein  38.46 
 
 		 1219 aa  45.4  0.003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3715  hypothetical protein  38.46 
 
 		 1219 aa  45.4  0.003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1630  hypothetical protein  38.46 
 
 		 1219 aa  45.4  0.003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00254693  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1741  hypothetical protein  38.46 
 
 		 1219 aa  45.4  0.003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000058782  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1306  dynamin family protein  39.58 
 
 		 1219 aa  45.4  0.003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.604786  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1595  hypothetical protein  38.46 
 
 		 1219 aa  45.4  0.003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1451  GTP1/OBG family GTPase  38.46 
 
 		 1219 aa  45.4  0.003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.472831  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1451  GTP1/OBG family GTPase  38.46 
 
 		 1219 aa  45.4  0.003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1479  hypothetical protein  38.46 
 
 		 1219 aa  45.4  0.003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1494  dynamin family protein  38.46 
 
 		 1219 aa  45.1  0.004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.248245  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1510  GTP-binding protein HSR1-related  24.86 
 
 		 523 aa  45.1  0.005  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1439  Dynamin family protein  25.26 
 
 		 546 aa  44.7  0.005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.784928  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0322  Dynamin family protein  25.15 
 
 		 585 aa  44.3  0.006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7006  hypothetical protein  29.37 
 
 		 497 aa  43.5  0.01  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.707702  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>