87 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_7004 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_7004  GTP-binding protein HSR1-related  100 
 
 		 610 aa  1183    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.793634  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39100  GTPase of unknown function  64.74 
 
 		 617 aa  733    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  decreased coverage  0.0000974304  normal  0.356305 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3729  hypothetical protein  37.81 
 
 		 626 aa  353  2.9999999999999997e-96  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.731679  normal  0.057897 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1149  hypothetical protein  28.16 
 
 		 602 aa  138  3.0000000000000003e-31  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.141307  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3084  hypothetical protein  27.22 
 
 		 627 aa  112  2.0000000000000002e-23  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1654  dynamin family protein  35.25 
 
 		 603 aa  112  2.0000000000000002e-23  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.964955 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1639  dynamin family protein  37.23 
 
 		 605 aa  109  2e-22  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.143429  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2424  Dynamin family protein  24.71 
 
 		 666 aa  106  1e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1654  dynamin  27.93 
 
 		 686 aa  101  5e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0311974  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5964  hypothetical protein  31.69 
 
 		 641 aa  99.8  1e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0285067  normal  0.193033 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0624  hypothetical protein  26.13 
 
 		 602 aa  86.7  0.000000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.318926  normal  0.0782013 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0556  GTP-binding protein HSR1-related  31.62 
 
 		 602 aa  86.7  0.000000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0329351  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1095  dynamin  27.82 
 
 		 588 aa  86.3  0.000000000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.845511  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2259  Dynamin family protein  21.05 
 
 		 444 aa  84.3  0.000000000000006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000551632  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10212  hypothetical protein  28.06 
 
 		 492 aa  84  0.000000000000007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.506116  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0273  hypothetical protein  36.07 
 
 		 608 aa  82.8  0.00000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36820  hypothetical protein  25.04 
 
 		 624 aa  78.2  0.0000000000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.19264 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3036  dynamin family protein  30.11 
 
 		 614 aa  75.5  0.000000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0241135  normal  0.688737 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2994  dynamin family protein  30.11 
 
 		 614 aa  75.5  0.000000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.214598  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1193  hypothetical protein  32.75 
 
 		 614 aa  75.1  0.000000000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.108086  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0914  Dynamin family protein  31.64 
 
 		 548 aa  75.1  0.000000000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.440355 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4477  hypothetical protein  26.57 
 
 		 529 aa  74.3  0.000000000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.645142  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6878  Dynamin family protein  33.97 
 
 		 620 aa  71.2  0.00000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2910  dynamin family protein  29.31 
 
 		 605 aa  71.2  0.00000000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.518789  normal  0.400566 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0322  Dynamin family protein  26.82 
 
 		 585 aa  69.3  0.0000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0457  hypothetical protein  28.46 
 
 		 619 aa  67.4  0.0000000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.374169  normal  0.488282 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0447  hypothetical protein  28.46 
 
 		 619 aa  67.4  0.0000000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.276019  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0434  hypothetical protein  28.46 
 
 		 619 aa  67  0.000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.827508  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0632  Dynamin family protein  26.96 
 
 		 589 aa  65.9  0.000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2968  dynamin family protein  28.97 
 
 		 583 aa  65.1  0.000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1377  dynamin family protein  27.15 
 
 		 585 aa  64.7  0.000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.682843  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10347  isoniazid inductible gene protein iniA  30.86 
 
 		 640 aa  64.7  0.000000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.997288 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1439  Dynamin family protein  30.81 
 
 		 546 aa  64.7  0.000000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.784928  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3531  dynamin family protein  31.22 
 
 		 585 aa  64.7  0.000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1350  dynamin  29.83 
 
 		 693 aa  64.3  0.000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0228271 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1273  Dynamin family protein  30.77 
 
 		 407 aa  64.3  0.000000007  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.0000000146438  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6880  Dynamin family protein  30.64 
 
 		 1164 aa  62.4  0.00000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0830  hypothetical protein  27.69 
 
 		 712 aa  60.5  0.00000009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00896739  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2196  dynamin family protein  27.63 
 
 		 506 aa  60.5  0.00000009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000046764 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0815  GTPase  28.02 
 
 		 712 aa  60.5  0.00000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_44250  predicted protein  27.1 
 
 		 632 aa  59.7  0.0000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.755773  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2213  Dynamin family protein  28.86 
 
 		 587 aa  58.5  0.0000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2106  dynamin  30.86 
 
 		 564 aa  57.8  0.0000006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.78205 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0200  hypothetical protein  25.93 
 
 		 419 aa  57.4  0.0000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0436  GTP-binding protein  27.94 
 
 		 569 aa  56.2  0.000002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0370  hypothetical protein  33.58 
 
 		 346 aa  55.8  0.000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0382536  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1545  GTP-binding protein  26.52 
 
 		 569 aa  54.3  0.000007  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.712051  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0164  hypothetical protein  26.57 
 
 		 497 aa  53.9  0.000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.319056 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2209  GTP-binding protein  24.24 
 
 		 615 aa  53.1  0.00001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0461  GTP-binding protein  29.86 
 
 		 569 aa  53.1  0.00001  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.0612543  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0337  conserved hypothetical protein, predicted ATP/GTP-binding protein  29.2 
 
 		 605 aa  52.8  0.00002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6055  hypothetical protein  26.74 
 
 		 696 aa  52.4  0.00003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0184  hypothetical protein  26.67 
 
 		 497 aa  52  0.00003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.502613  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1733  hypothetical protein  32.11 
 
 		 976 aa  52  0.00003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0175  hypothetical protein  26.67 
 
 		 497 aa  52  0.00003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0933  dynamin family protein  29.41 
 
 		 679 aa  51.2  0.00005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.807319  hitchhiker  0.00750508 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1653  GTP-binding protein, HSR1-related  26.05 
 
 		 524 aa  50.8  0.00007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0754256  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2425  GTP-binding protein HSR1-related  30.2 
 
 		 533 aa  50.4  0.00008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0398  Dynamin family protein  25.68 
 
 		 674 aa  50.8  0.00008  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1451  GTP1/OBG family GTPase  30.11 
 
 		 1219 aa  48.5  0.0003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.472831  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1701  hypothetical protein  31.65 
 
 		 1219 aa  48.5  0.0004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1665  hypothetical protein  31.65 
 
 		 1219 aa  48.5  0.0004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1479  hypothetical protein  31.65 
 
 		 1219 aa  48.5  0.0004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1451  GTP1/OBG family GTPase  31.65 
 
 		 1219 aa  48.5  0.0004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1595  hypothetical protein  31.65 
 
 		 1219 aa  48.5  0.0004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1741  hypothetical protein  31.65 
 
 		 1219 aa  48.5  0.0004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000058782  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1630  hypothetical protein  31.65 
 
 		 1219 aa  48.5  0.0004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00254693  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3715  hypothetical protein  31.65 
 
 		 1219 aa  48.5  0.0004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0787  dynamin family protein  21.7 
 
 		 655 aa  48.1  0.0005  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.0394271  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3493  hypothetical protein  30.29 
 
 		 709 aa  47.8  0.0006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000901673 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2392  Dynamin family protein  27.57 
 
 		 1249 aa  47.8  0.0006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0403  dynamin family protein  22.07 
 
 		 693 aa  47.4  0.0008  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1351  heat shock protein DnaJ-like  26.59 
 
 		 741 aa  47.4  0.0009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0473185 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1494  dynamin family protein  30.38 
 
 		 1219 aa  47  0.001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.248245  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1896  Dynamin family protein  35.44 
 
 		 1228 aa  46.6  0.001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00444431  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1306  dynamin family protein  30.38 
 
 		 1219 aa  47  0.001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.604786  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3805  hypothetical protein  26.44 
 
 		 927 aa  46.2  0.002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.206657  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3865  hypothetical protein  26.44 
 
 		 927 aa  46.2  0.002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1433  hypothetical protein  26.44 
 
 		 927 aa  45.8  0.002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.219985 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2664  GTP-binding protein, HSR1-like  21.58 
 
 		 581 aa  46.2  0.002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.760188 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3777  hypothetical protein  26.44 
 
 		 927 aa  45.4  0.003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00148359 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3609  hypothetical protein  26.44 
 
 		 927 aa  45.4  0.003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3518  TPR repeat-containing protein  27.01 
 
 		 927 aa  45.8  0.003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3896  hypothetical protein  26.44 
 
 		 927 aa  45.4  0.003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3506  TPR repeat-containing protein  26.44 
 
 		 927 aa  45.1  0.004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0255227  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2415  hypothetical protein  28.84 
 
 		 648 aa  44.7  0.005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0829723  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3807  dynamin family protein  31.5 
 
 		 645 aa  44.3  0.007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0702524  normal  0.282695 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>