20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPA7_6055 on replicon NC_009656
Organism: Pseudomonas aeruginosa PA7



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009656  PSPA7_6055  hypothetical protein  100 
 
 
696 aa  1418    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0374  hypothetical protein  34.37 
 
 
621 aa  310  5.9999999999999995e-83  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0398  Dynamin family protein  26.58 
 
 
674 aa  63.9  0.00000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1095  dynamin  22.75 
 
 
588 aa  59.3  0.0000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.845511  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6878  Dynamin family protein  26.99 
 
 
620 aa  57  0.000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0860  GTP-binding protein  25.48 
 
 
601 aa  55.1  0.000004  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6880  Dynamin family protein  30.77 
 
 
1164 aa  52.8  0.00002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0436  GTP-binding protein  25.2 
 
 
569 aa  52.8  0.00002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2209  GTP-binding protein  26.06 
 
 
615 aa  51.6  0.00005  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0438  GTP-binding protein  26.06 
 
 
599 aa  50.4  0.0001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1545  GTP-binding protein  25.4 
 
 
569 aa  50.4  0.0001  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.712051  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2259  Dynamin family protein  22.73 
 
 
444 aa  50.1  0.0001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000551632  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0372  hypothetical protein  22.57 
 
 
587 aa  48.9  0.0003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0337  conserved hypothetical protein, predicted ATP/GTP-binding protein  24.35 
 
 
605 aa  48.5  0.0004  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0461  GTP-binding protein  24.34 
 
 
569 aa  48.1  0.0006  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.0612543  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0933  dynamin family protein  23.59 
 
 
679 aa  47  0.001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.807319  hitchhiker  0.00750508 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0896  hypothetical protein  29.46 
 
 
502 aa  47  0.001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.128039  normal  0.710649 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2910  dynamin family protein  25.41 
 
 
605 aa  47  0.001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.518789  normal  0.400566 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1193  hypothetical protein  23.83 
 
 
614 aa  46.6  0.002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.108086  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0914  Dynamin family protein  22.71 
 
 
548 aa  44.3  0.007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.440355 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>