59 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbd_2415 on replicon NC_007404
Organism: Thiobacillus denitrificans ATCC 25259



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007404  Tbd_2415  hypothetical protein  100 
 
 		 648 aa  1312    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0829723  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3725  hypothetical protein  39.35 
 
 		 649 aa  446  1.0000000000000001e-124  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.24696 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0700  hypothetical protein  38.24 
 
 		 652 aa  422  1e-116  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.471001  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0400  hypothetical protein  36.64 
 
 		 662 aa  404  1e-111  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0733804  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3622  hypothetical protein  39.35 
 
 		 654 aa  400  9.999999999999999e-111  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.300251  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0347  hypothetical protein  36.54 
 
 		 651 aa  397  1e-109  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.512067  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0382  hypothetical protein  38.76 
 
 		 652 aa  397  1e-109  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.874173  normal  0.0118752 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0282  hypothetical protein  36.35 
 
 		 648 aa  394  1e-108  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0255  hypothetical protein  36.35 
 
 		 648 aa  386  1e-106  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.142183  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0294  hypothetical protein  35.65 
 
 		 672 aa  382  1e-105  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4154  GTPase (dynamin-related)-like protein  37.52 
 
 		 660 aa  381  1e-104  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.67903 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1298  hypothetical protein  37.19 
 
 		 659 aa  371  1e-101  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.594857  normal  0.225568 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0490  hypothetical protein  38.54 
 
 		 655 aa  370  1e-101  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05110  hypothetical protein  38.54 
 
 		 655 aa  368  1e-100  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1655  hypothetical protein  36.64 
 
 		 659 aa  362  1e-98  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.92413  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0900  hypothetical protein  35.52 
 
 		 660 aa  360  4e-98  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.347456  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3605  hypothetical protein  35.35 
 
 		 653 aa  360  6e-98  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.169107  normal  0.037636 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0829  hypothetical protein  35.94 
 
 		 660 aa  359  8e-98  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0612198  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5428  hypothetical protein  35.9 
 
 		 672 aa  348  1e-94  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.832093 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0904  hypothetical protein  35.59 
 
 		 658 aa  347  3e-94  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3234  hypothetical protein  34.85 
 
 		 675 aa  343  5e-93  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.220852  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3493  hypothetical protein  35.94 
 
 		 709 aa  331  3e-89  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000901673 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4340  hypothetical protein  33.44 
 
 		 655 aa  329  8e-89  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0246276  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0533  GTPase (dynamin-related)  34.88 
 
 		 654 aa  326  9e-88  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2756  hypothetical protein  34.52 
 
 		 659 aa  310  5.9999999999999995e-83  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2377  hypothetical protein  34.52 
 
 		 659 aa  310  5.9999999999999995e-83  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.0503347 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0787  dynamin family protein  24.38 
 
 		 655 aa  65.1  0.000000004  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.0394271  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2196  dynamin family protein  24.42 
 
 		 506 aa  62.4  0.00000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000046764 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1193  hypothetical protein  25.45 
 
 		 614 aa  61.2  0.00000005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.108086  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2259  Dynamin family protein  22.11 
 
 		 444 aa  60.5  0.0000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000551632  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1350  dynamin  23.36 
 
 		 693 aa  58.9  0.0000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0228271 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3036  dynamin family protein  23.87 
 
 		 614 aa  58.9  0.0000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0241135  normal  0.688737 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2994  dynamin family protein  23.87 
 
 		 614 aa  58.9  0.0000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.214598  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2424  Dynamin family protein  25.08 
 
 		 666 aa  57.4  0.0000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2910  dynamin family protein  24.67 
 
 		 605 aa  57  0.000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.518789  normal  0.400566 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1273  Dynamin family protein  28.04 
 
 		 407 aa  55.8  0.000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.0000000146438  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2968  dynamin family protein  35.21 
 
 		 583 aa  54.7  0.000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0914  Dynamin family protein  28.8 
 
 		 548 aa  51.6  0.00005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.440355 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1654  dynamin  25 
 
 		 686 aa  50.1  0.0001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0311974  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10347  isoniazid inductible gene protein iniA  26.59 
 
 		 640 aa  49.7  0.0002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.997288 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1701  hypothetical protein  23.32 
 
 		 1219 aa  49.3  0.0002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6878  Dynamin family protein  31.2 
 
 		 620 aa  49.3  0.0002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1095  dynamin  21.52 
 
 		 588 aa  48.5  0.0004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.845511  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1741  hypothetical protein  23.32 
 
 		 1219 aa  47.8  0.0006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000058782  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1595  hypothetical protein  23.32 
 
 		 1219 aa  47.8  0.0007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1479  hypothetical protein  23.32 
 
 		 1219 aa  47.8  0.0007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1451  GTP1/OBG family GTPase  23.32 
 
 		 1219 aa  47.8  0.0007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1451  GTP1/OBG family GTPase  23.32 
 
 		 1219 aa  47.8  0.0007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.472831  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3715  hypothetical protein  22.92 
 
 		 1219 aa  47.4  0.0008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1665  hypothetical protein  23.32 
 
 		 1219 aa  47.4  0.0008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2213  Dynamin family protein  33.13 
 
 		 587 aa  47.4  0.0008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2392  Dynamin family protein  23.96 
 
 		 1249 aa  47.4  0.001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2546  hypothetical protein  22.22 
 
 		 719 aa  47.4  0.001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0908682 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1639  dynamin family protein  25.57 
 
 		 605 aa  45.8  0.002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.143429  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2209  GTP-binding protein  26.19 
 
 		 615 aa  45.4  0.003  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1630  hypothetical protein  22.53 
 
 		 1219 aa  45.1  0.004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00254693  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1377  dynamin family protein  35.43 
 
 		 585 aa  45.1  0.004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.682843  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0251  hypothetical protein  27.27 
 
 		 819 aa  45.4  0.004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0811563  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3531  dynamin family protein  35.43 
 
 		 585 aa  44.3  0.007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>