65 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmz1t_3622 on replicon NC_011662
Organism: Thauera sp. MZ1T



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011662  Tmz1t_3622  hypothetical protein  100 
 
 
654 aa  1313    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.300251  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3725  hypothetical protein  58.91 
 
 
649 aa  761    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.24696 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0700  hypothetical protein  53.62 
 
 
652 aa  684    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.471001  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0382  hypothetical protein  49.92 
 
 
652 aa  621  1e-176  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.874173  normal  0.0118752 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0400  hypothetical protein  46.61 
 
 
662 aa  573  1.0000000000000001e-162  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0733804  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0347  hypothetical protein  47.69 
 
 
651 aa  574  1.0000000000000001e-162  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.512067  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0282  hypothetical protein  46.08 
 
 
648 aa  567  1e-160  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0294  hypothetical protein  46.95 
 
 
672 aa  567  1e-160  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0255  hypothetical protein  46.24 
 
 
648 aa  558  1e-158  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.142183  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0900  hypothetical protein  40.71 
 
 
660 aa  476  1e-133  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.347456  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0829  hypothetical protein  40.71 
 
 
660 aa  475  1e-132  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0612198  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1298  hypothetical protein  40.84 
 
 
659 aa  455  1.0000000000000001e-126  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.594857  normal  0.225568 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5428  hypothetical protein  40.06 
 
 
672 aa  455  1.0000000000000001e-126  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.832093 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0904  hypothetical protein  40.49 
 
 
658 aa  452  1.0000000000000001e-126  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3605  hypothetical protein  40.6 
 
 
653 aa  453  1.0000000000000001e-126  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.169107  normal  0.037636 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4340  hypothetical protein  41.01 
 
 
655 aa  450  1e-125  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0246276  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1655  hypothetical protein  40.89 
 
 
659 aa  446  1.0000000000000001e-124  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.92413  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3234  hypothetical protein  41.13 
 
 
675 aa  403  1e-111  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.220852  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2415  hypothetical protein  39.35 
 
 
648 aa  400  9.999999999999999e-111  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0829723  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3493  hypothetical protein  40 
 
 
709 aa  382  1e-104  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000901673 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4154  GTPase (dynamin-related)-like protein  34.93 
 
 
660 aa  366  1e-100  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.67903 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0490  hypothetical protein  35.93 
 
 
655 aa  357  5e-97  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05110  hypothetical protein  35.93 
 
 
655 aa  356  5.999999999999999e-97  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0533  GTPase (dynamin-related)  33.11 
 
 
654 aa  334  4e-90  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2756  hypothetical protein  32.21 
 
 
659 aa  318  2e-85  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2377  hypothetical protein  32.21 
 
 
659 aa  318  2e-85  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.0503347 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2196  dynamin family protein  28.12 
 
 
506 aa  79.3  0.0000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000046764 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1193  hypothetical protein  28.16 
 
 
614 aa  74.7  0.000000000006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.108086  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2910  dynamin family protein  24.26 
 
 
605 aa  70.9  0.00000000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.518789  normal  0.400566 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1350  dynamin  24.11 
 
 
693 aa  69.7  0.0000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0228271 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1095  dynamin  23.88 
 
 
588 aa  65.9  0.000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.845511  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2994  dynamin family protein  28.43 
 
 
614 aa  66.2  0.000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.214598  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3036  dynamin family protein  28.43 
 
 
614 aa  66.2  0.000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0241135  normal  0.688737 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1273  Dynamin family protein  26.71 
 
 
407 aa  62.4  0.00000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.0000000146438  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2968  dynamin family protein  30.17 
 
 
583 aa  62  0.00000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0914  Dynamin family protein  34.69 
 
 
548 aa  60.5  0.00000009  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.440355 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2546  hypothetical protein  22.75 
 
 
719 aa  59.3  0.0000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0908682 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3531  dynamin family protein  32.66 
 
 
585 aa  58.9  0.0000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1377  dynamin family protein  27.88 
 
 
585 aa  58.9  0.0000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.682843  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2259  Dynamin family protein  19.89 
 
 
444 aa  54.7  0.000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000551632  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6878  Dynamin family protein  23.79 
 
 
620 aa  53.9  0.000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2424  Dynamin family protein  28.48 
 
 
666 aa  53.1  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36820  hypothetical protein  26.3 
 
 
624 aa  53.1  0.00002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.19264 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2545  dynamin  22.71 
 
 
390 aa  52.8  0.00002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0649757  normal  0.0791445 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0624  hypothetical protein  26.76 
 
 
602 aa  52  0.00003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.318926  normal  0.0782013 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0815  GTPase  24.31 
 
 
712 aa  52  0.00003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0787  dynamin family protein  23.27 
 
 
655 aa  52  0.00004  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.0394271  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0830  hypothetical protein  24.31 
 
 
712 aa  52  0.00004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00896739  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0397  Dynamin family protein  20.12 
 
 
789 aa  50.8  0.00007  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0111735  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0632  Dynamin family protein  29.14 
 
 
589 aa  49.7  0.0002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_44250  predicted protein  34.04 
 
 
632 aa  49.3  0.0003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.755773  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1654  dynamin  22.75 
 
 
686 aa  49.3  0.0003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0311974  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0273  hypothetical protein  28.93 
 
 
608 aa  48.1  0.0005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6880  Dynamin family protein  35.98 
 
 
1164 aa  47.8  0.0007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2213  Dynamin family protein  34.38 
 
 
587 aa  47.4  0.001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10347  isoniazid inductible gene protein iniA  28.98 
 
 
640 aa  46.6  0.001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.997288 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1654  dynamin family protein  25.54 
 
 
603 aa  46.2  0.002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.964955 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4018  hypothetical protein  25 
 
 
814 aa  45.4  0.003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.505763 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2106  dynamin  27.99 
 
 
564 aa  45.4  0.003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.78205 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1896  Dynamin family protein  23.56 
 
 
1228 aa  44.7  0.005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00444431  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2392  Dynamin family protein  24.34 
 
 
1249 aa  44.7  0.005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0251  hypothetical protein  31 
 
 
819 aa  45.1  0.005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0811563  normal 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5314  hypothetical protein  20.43 
 
 
952 aa  44.7  0.006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1439  Dynamin family protein  36.84 
 
 
546 aa  44.3  0.008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.784928  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0434  hypothetical protein  35.8 
 
 
619 aa  43.9  0.01  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.827508  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>