31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tery_4018 on replicon NC_008312
Organism: Trichodesmium erythraeum IMS101



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011726  PCC8801_4205  hypothetical protein  64.55 
 
 		 809 aa  1043    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0251  hypothetical protein  70.25 
 
 		 819 aa  1120    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0811563  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4244  GTPase (dynamin-related)-like protein  64.55 
 
 		 809 aa  1043    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  unclonable  0.000109098  hitchhiker  0.00000166794 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4018  hypothetical protein  100 
 
 		 814 aa  1665    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.505763 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0969  Dynamin family protein  28.3 
 
 		 648 aa  60.8  0.00000009  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0533  GTPase (dynamin-related)  26.52 
 
 		 654 aa  56.2  0.000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1225  hypothetical protein  22.18 
 
 		 793 aa  52  0.00004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.640343  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3605  hypothetical protein  26.76 
 
 		 653 aa  52.4  0.00004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.169107  normal  0.037636 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0347  hypothetical protein  23.03 
 
 		 651 aa  52.4  0.00004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.512067  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0490  hypothetical protein  26.22 
 
 		 655 aa  51.2  0.00007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05110  hypothetical protein  25.8 
 
 		 655 aa  50.4  0.0001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0397  Dynamin family protein  25.89 
 
 		 789 aa  50.8  0.0001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0111735  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0282  hypothetical protein  22.74 
 
 		 648 aa  50.8  0.0001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4340  hypothetical protein  24.82 
 
 		 655 aa  50.8  0.0001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0246276  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0255  hypothetical protein  22.74 
 
 		 648 aa  50.1  0.0002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.142183  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5428  hypothetical protein  24.45 
 
 		 672 aa  49.7  0.0002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.832093 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1494  dynamin family protein  25.74 
 
 		 1219 aa  49.3  0.0003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.248245  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4154  GTPase (dynamin-related)-like protein  23.96 
 
 		 660 aa  48.9  0.0004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.67903 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0400  hypothetical protein  23.6 
 
 		 662 aa  48.1  0.0006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0733804  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2392  Dynamin family protein  23.13 
 
 		 1249 aa  48.1  0.0007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0829  hypothetical protein  25.81 
 
 		 660 aa  47.8  0.0009  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0612198  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0900  hypothetical protein  25.81 
 
 		 660 aa  47.8  0.0009  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.347456  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1655  hypothetical protein  24.34 
 
 		 659 aa  47  0.001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.92413  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1530  hypothetical protein  25.37 
 
 		 1146 aa  46.2  0.002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.532706  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1501  hypothetical protein  25.37 
 
 		 1146 aa  46.2  0.002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0336  conserved hypothetical protein, predicted ATP/GTP-binding protein  24.75 
 
 		 741 aa  46.6  0.002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2547  dynamin  33.78 
 
 		 551 aa  46.6  0.002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.164219 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3622  hypothetical protein  25 
 
 		 654 aa  45.4  0.004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.300251  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3234  hypothetical protein  23.47 
 
 		 675 aa  45.1  0.005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.220852  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1298  hypothetical protein  33.72 
 
 		 659 aa  45.1  0.006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.594857  normal  0.225568 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0904  hypothetical protein  33.72 
 
 		 658 aa  44.3  0.009  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>