76 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daro_3725 on replicon NC_007298
Organism: Dechloromonas aromatica RCB



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011662  Tmz1t_3622  hypothetical protein  58.91 
 
 		 654 aa  761    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.300251  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3725  hypothetical protein  100 
 
 		 649 aa  1334    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.24696 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0382  hypothetical protein  52.46 
 
 		 652 aa  657    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.874173  normal  0.0118752 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0700  hypothetical protein  56.87 
 
 		 652 aa  701    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.471001  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0282  hypothetical protein  47.55 
 
 		 648 aa  599  1e-170  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0400  hypothetical protein  47.24 
 
 		 662 aa  597  1e-169  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0733804  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0347  hypothetical protein  47.57 
 
 		 651 aa  591  1e-167  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.512067  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0255  hypothetical protein  47.39 
 
 		 648 aa  586  1e-166  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.142183  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0294  hypothetical protein  47.64 
 
 		 672 aa  572  1.0000000000000001e-162  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1298  hypothetical protein  43.7 
 
 		 659 aa  499  1e-140  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.594857  normal  0.225568 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0904  hypothetical protein  42.11 
 
 		 658 aa  494  9.999999999999999e-139  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0900  hypothetical protein  42.35 
 
 		 660 aa  492  1e-137  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.347456  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0829  hypothetical protein  42.35 
 
 		 660 aa  491  1e-137  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0612198  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5428  hypothetical protein  39.66 
 
 		 672 aa  471  1.0000000000000001e-131  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.832093 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1655  hypothetical protein  42.43 
 
 		 659 aa  466  9.999999999999999e-131  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.92413  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3605  hypothetical protein  39.77 
 
 		 653 aa  451  1e-125  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.169107  normal  0.037636 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2415  hypothetical protein  39.35 
 
 		 648 aa  446  1.0000000000000001e-124  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0829723  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4340  hypothetical protein  40.23 
 
 		 655 aa  445  1e-123  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0246276  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3234  hypothetical protein  40.32 
 
 		 675 aa  422  1e-117  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.220852  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3493  hypothetical protein  39.94 
 
 		 709 aa  402  9.999999999999999e-111  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000901673 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4154  GTPase (dynamin-related)-like protein  35.52 
 
 		 660 aa  355  2e-96  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.67903 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0533  GTPase (dynamin-related)  33.28 
 
 		 654 aa  339  9.999999999999999e-92  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0490  hypothetical protein  34.27 
 
 		 655 aa  338  9.999999999999999e-92  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05110  hypothetical protein  34.27 
 
 		 655 aa  338  1.9999999999999998e-91  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2377  hypothetical protein  31.79 
 
 		 659 aa  313  6.999999999999999e-84  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.0503347 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2756  hypothetical protein  31.79 
 
 		 659 aa  313  6.999999999999999e-84  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1193  hypothetical protein  25.95 
 
 		 614 aa  82.4  0.00000000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.108086  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2994  dynamin family protein  23.87 
 
 		 614 aa  72.8  0.00000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.214598  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3036  dynamin family protein  23.87 
 
 		 614 aa  72.8  0.00000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0241135  normal  0.688737 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2910  dynamin family protein  27.3 
 
 		 605 aa  72.4  0.00000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.518789  normal  0.400566 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1350  dynamin  25.72 
 
 		 693 aa  70.1  0.0000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0228271 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2259  Dynamin family protein  20.41 
 
 		 444 aa  67.8  0.0000000006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000551632  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2196  dynamin family protein  26.18 
 
 		 506 aa  66.2  0.000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000046764 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1095  dynamin  24.48 
 
 		 588 aa  64.3  0.000000007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.845511  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2546  hypothetical protein  25 
 
 		 719 aa  60.5  0.0000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0908682 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0624  hypothetical protein  27.51 
 
 		 602 aa  58.2  0.0000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.318926  normal  0.0782013 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2968  dynamin family protein  35.95 
 
 		 583 aa  56.2  0.000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0397  Dynamin family protein  20.63 
 
 		 789 aa  55.1  0.000004  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0111735  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0815  GTPase  25.99 
 
 		 712 aa  54.7  0.000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6878  Dynamin family protein  32 
 
 		 620 aa  54.7  0.000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0830  hypothetical protein  25.99 
 
 		 712 aa  54.7  0.000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00896739  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2392  Dynamin family protein  25.86 
 
 		 1249 aa  53.5  0.00001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0787  dynamin family protein  24.8 
 
 		 655 aa  53.9  0.00001  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.0394271  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0914  Dynamin family protein  31.12 
 
 		 548 aa  52.8  0.00002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.440355 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2424  Dynamin family protein  24.54 
 
 		 666 aa  52  0.00003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1273  Dynamin family protein  31.01 
 
 		 407 aa  51.2  0.00006  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.0000000146438  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3531  dynamin family protein  33.8 
 
 		 585 aa  50.8  0.00008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1654  dynamin  25.38 
 
 		 686 aa  50.4  0.00009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0311974  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2545  dynamin  22.34 
 
 		 390 aa  50.8  0.00009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0649757  normal  0.0791445 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1654  dynamin family protein  24.26 
 
 		 603 aa  50.4  0.0001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.964955 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1896  Dynamin family protein  23.77 
 
 		 1228 aa  49.3  0.0002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00444431  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1639  dynamin family protein  24.87 
 
 		 605 aa  48.9  0.0003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.143429  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10347  isoniazid inductible gene protein iniA  36.84 
 
 		 640 aa  48.9  0.0003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.997288 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3715  hypothetical protein  23.85 
 
 		 1219 aa  48.5  0.0004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0434  hypothetical protein  41.79 
 
 		 619 aa  48.1  0.0004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.827508  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0457  hypothetical protein  41.79 
 
 		 619 aa  48.1  0.0005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.374169  normal  0.488282 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0447  hypothetical protein  41.79 
 
 		 619 aa  48.1  0.0005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.276019  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0273  hypothetical protein  41.79 
 
 		 608 aa  48.1  0.0005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0251  hypothetical protein  29.29 
 
 		 819 aa  48.1  0.0005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0811563  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1377  dynamin family protein  30.87 
 
 		 585 aa  47.8  0.0007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.682843  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1451  GTP1/OBG family GTPase  25.31 
 
 		 1219 aa  46.6  0.001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1741  hypothetical protein  25.31 
 
 		 1219 aa  47  0.001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000058782  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1630  hypothetical protein  22.65 
 
 		 1219 aa  47  0.001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00254693  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1665  hypothetical protein  25.31 
 
 		 1219 aa  46.6  0.001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1701  hypothetical protein  25.31 
 
 		 1219 aa  47  0.001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_44250  predicted protein  31.13 
 
 		 632 aa  45.8  0.002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.755773  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1595  hypothetical protein  25.31 
 
 		 1219 aa  46.6  0.002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1451  GTP1/OBG family GTPase  25.31 
 
 		 1219 aa  46.6  0.002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.472831  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1479  hypothetical protein  25.31 
 
 		 1219 aa  46.6  0.002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0556  GTP-binding protein HSR1-related  29.11 
 
 		 602 aa  45.8  0.003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0329351  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3460  hypothetical protein  23.35 
 
 		 659 aa  45.4  0.003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1439  Dynamin family protein  35.92 
 
 		 546 aa  45.8  0.003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.784928  normal  1 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5314  hypothetical protein  22.4 
 
 		 952 aa  44.7  0.005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2213  Dynamin family protein  32.09 
 
 		 587 aa  44.7  0.005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0733  GTP-binding protein EngA  27.59 
 
 		 500 aa  43.9  0.009  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3239  hypothetical protein  21.67 
 
 		 669 aa  43.9  0.01  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.983308  normal  0.678486 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>