174 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_6878 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013440  Hoch_6878  Dynamin family protein  100 
 
 
620 aa  1250    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1193  hypothetical protein  32.67 
 
 
614 aa  152  1e-35  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.108086  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2259  Dynamin family protein  27.41 
 
 
444 aa  150  5e-35  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000551632  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2994  dynamin family protein  28.24 
 
 
614 aa  150  1.0000000000000001e-34  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.214598  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3036  dynamin family protein  28.24 
 
 
614 aa  150  1.0000000000000001e-34  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0241135  normal  0.688737 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2910  dynamin family protein  31.76 
 
 
605 aa  143  9e-33  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.518789  normal  0.400566 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3531  dynamin family protein  28.35 
 
 
585 aa  134  6e-30  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0914  Dynamin family protein  33.45 
 
 
548 aa  131  4.0000000000000003e-29  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.440355 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1095  dynamin  27.82 
 
 
588 aa  131  4.0000000000000003e-29  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.845511  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2213  Dynamin family protein  35.39 
 
 
587 aa  129  1.0000000000000001e-28  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2968  dynamin family protein  35.83 
 
 
583 aa  127  4.0000000000000003e-28  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6880  Dynamin family protein  38.6 
 
 
1164 aa  127  5e-28  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0322  Dynamin family protein  30.28 
 
 
585 aa  125  2e-27  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1377  dynamin family protein  34.73 
 
 
585 aa  120  7.999999999999999e-26  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.682843  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2106  dynamin  37.77 
 
 
564 aa  119  1.9999999999999998e-25  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.78205 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1439  Dynamin family protein  30.53 
 
 
546 aa  112  2.0000000000000002e-23  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.784928  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0632  Dynamin family protein  33.17 
 
 
589 aa  110  7.000000000000001e-23  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2424  Dynamin family protein  31.43 
 
 
666 aa  107  6e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_44250  predicted protein  32.69 
 
 
632 aa  105  2e-21  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.755773  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1350  dynamin  26.4 
 
 
693 aa  102  1e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0228271 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0787  dynamin family protein  26.85 
 
 
655 aa  100  7e-20  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.0394271  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0933  dynamin family protein  32.28 
 
 
679 aa  100  1e-19  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.807319  hitchhiker  0.00750508 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5314  hypothetical protein  27.43 
 
 
952 aa  98.6  3e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0398  Dynamin family protein  28.92 
 
 
674 aa  97.8  5e-19  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0556  GTP-binding protein HSR1-related  34.39 
 
 
602 aa  95.9  2e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0329351  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0438  GTP-binding protein  31.8 
 
 
599 aa  95.5  3e-18  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0437  GTP-binding protein  24.01 
 
 
692 aa  94.7  4e-18  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2209  GTP-binding protein  28.75 
 
 
615 aa  94.7  4e-18  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0859  GTP-binding protein  28.1 
 
 
692 aa  94.7  5e-18  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.547864  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1351  heat shock protein DnaJ-like  33.87 
 
 
741 aa  93.6  9e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0473185 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1306  dynamin family protein  26.54 
 
 
1219 aa  91.3  5e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.604786  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1273  Dynamin family protein  31.22 
 
 
407 aa  90.9  6e-17  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.0000000146438  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1654  dynamin  26.99 
 
 
686 aa  90.9  7e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0311974  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2547  dynamin  34.71 
 
 
551 aa  90.5  8e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.164219 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1639  dynamin family protein  26.27 
 
 
605 aa  90.5  9e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.143429  normal 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0435  GTP-binding protein  25.9 
 
 
728 aa  89  2e-16  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0336  conserved hypothetical protein, predicted ATP/GTP-binding protein  23.97 
 
 
741 aa  89.7  2e-16  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0404  glucosamine fructose-6-phosphate aminotransferase (isomerizing)  29.06 
 
 
610 aa  89.4  2e-16  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1546  GTP-binding protein  25.54 
 
 
728 aa  88.6  3e-16  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1096  GTP-binding protein, HSR1-related  29.41 
 
 
664 aa  87.8  5e-16  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1654  dynamin family protein  36.53 
 
 
603 aa  87.8  6e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.964955 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0460  GTP-binding protein  25.18 
 
 
728 aa  87.4  7e-16  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.839985  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2196  dynamin family protein  20.82 
 
 
506 aa  84  0.000000000000008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000046764 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2546  hypothetical protein  27.12 
 
 
719 aa  83.6  0.00000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0908682 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5313  hypothetical protein  33.02 
 
 
743 aa  82.8  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0397  Dynamin family protein  24.05 
 
 
789 aa  82.8  0.00000000000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0111735  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3084  hypothetical protein  30.42 
 
 
627 aa  81.6  0.00000000000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0860  GTP-binding protein  25.9 
 
 
601 aa  80.9  0.00000000000007  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2545  dynamin  27.78 
 
 
390 aa  79.7  0.0000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0649757  normal  0.0791445 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36820  hypothetical protein  26.73 
 
 
624 aa  78.2  0.0000000000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.19264 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0273  hypothetical protein  30.73 
 
 
608 aa  78.2  0.0000000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0830  hypothetical protein  20.87 
 
 
712 aa  77.4  0.0000000000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00896739  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0815  GTPase  23.66 
 
 
712 aa  77.4  0.0000000000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0624  hypothetical protein  28.43 
 
 
602 aa  77  0.0000000000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.318926  normal  0.0782013 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39100  GTPase of unknown function  27.61 
 
 
617 aa  76.6  0.000000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  decreased coverage  0.0000974304  normal  0.356305 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0403  dynamin family protein  25.54 
 
 
693 aa  77  0.000000000001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0436  GTP-binding protein  30.52 
 
 
569 aa  73.2  0.00000000001  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1545  GTP-binding protein  30.05 
 
 
569 aa  73.6  0.00000000001  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.712051  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0447  hypothetical protein  28.62 
 
 
619 aa  72  0.00000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.276019  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0457  hypothetical protein  28.62 
 
 
619 aa  72  0.00000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.374169  normal  0.488282 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0434  hypothetical protein  28.62 
 
 
619 aa  71.2  0.00000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.827508  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1433  hypothetical protein  28.57 
 
 
927 aa  69.3  0.0000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.219985 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3777  hypothetical protein  26.2 
 
 
927 aa  69.3  0.0000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00148359 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3506  TPR repeat-containing protein  26.2 
 
 
927 aa  68.6  0.0000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0255227  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3865  hypothetical protein  28.57 
 
 
927 aa  68.6  0.0000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6053  hypothetical protein  30.71 
 
 
570 aa  68.6  0.0000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3805  hypothetical protein  27.78 
 
 
927 aa  68.2  0.0000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.206657  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0337  conserved hypothetical protein, predicted ATP/GTP-binding protein  28.32 
 
 
605 aa  68.6  0.0000000004  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3518  TPR repeat-containing protein  26.2 
 
 
927 aa  67.8  0.0000000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0461  GTP-binding protein  29.11 
 
 
569 aa  67  0.000000001  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.0612543  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3609  hypothetical protein  25.76 
 
 
927 aa  66.6  0.000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3896  hypothetical protein  25.76 
 
 
927 aa  66.6  0.000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7004  GTP-binding protein HSR1-related  33.97 
 
 
610 aa  65.9  0.000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.793634  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1896  Dynamin family protein  33.08 
 
 
1228 aa  65.9  0.000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00444431  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3725  hypothetical protein  31.03 
 
 
569 aa  66.2  0.000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.491681  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3536  TPR repeat-containing protein  27.55 
 
 
927 aa  65.9  0.000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.262936  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1741  hypothetical protein  27.62 
 
 
1219 aa  65.9  0.000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000058782  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10347  isoniazid inductible gene protein iniA  31.02 
 
 
640 aa  65.9  0.000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.997288 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1701  hypothetical protein  27.62 
 
 
1219 aa  65.5  0.000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1479  hypothetical protein  27.03 
 
 
1219 aa  64.7  0.000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1451  GTP1/OBG family GTPase  27.03 
 
 
1219 aa  64.7  0.000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1595  hypothetical protein  27.03 
 
 
1219 aa  64.7  0.000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3459  hypothetical protein  31.91 
 
 
568 aa  65.1  0.000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.825542 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1665  hypothetical protein  27.03 
 
 
1219 aa  64.7  0.000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3715  hypothetical protein  27.03 
 
 
1219 aa  64.7  0.000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1451  GTP1/OBG family GTPase  27.03 
 
 
1219 aa  64.3  0.000000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.472831  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1630  hypothetical protein  24 
 
 
1219 aa  63.9  0.000000009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00254693  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0372  hypothetical protein  26.34 
 
 
587 aa  63.5  0.000000009  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0400  hypothetical protein  23.19 
 
 
662 aa  63.2  0.00000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0733804  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3798  hypothetical protein  25 
 
 
927 aa  63.5  0.00000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.245299  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1501  hypothetical protein  24.32 
 
 
1146 aa  63.2  0.00000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1530  hypothetical protein  24.32 
 
 
1146 aa  63.2  0.00000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.532706  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1494  dynamin family protein  26 
 
 
1219 aa  62.8  0.00000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.248245  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0282  hypothetical protein  22.99 
 
 
648 aa  62  0.00000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0922  hypothetical protein  25.65 
 
 
766 aa  62  0.00000003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00229589 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0255  hypothetical protein  22.99 
 
 
648 aa  62  0.00000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.142183  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0374  hypothetical protein  30.34 
 
 
621 aa  61.6  0.00000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3605  hypothetical protein  28.51 
 
 
653 aa  61.6  0.00000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.169107  normal  0.037636 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2392  Dynamin family protein  29.15 
 
 
1249 aa  61.2  0.00000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0969  Dynamin family protein  25.83 
 
 
648 aa  61.2  0.00000005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>