109 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHAB381_0860 on replicon NC_009714
Organism: Campylobacter hominis ATCC BAA-381



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009714  CHAB381_0860  GTP-binding protein  100 
 
 
601 aa  1201    Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0438  GTP-binding protein  44.2 
 
 
599 aa  474  1e-132  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2209  GTP-binding protein  36.14 
 
 
615 aa  353  4e-96  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0404  glucosamine fructose-6-phosphate aminotransferase (isomerizing)  35.94 
 
 
610 aa  320  5e-86  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0337  conserved hypothetical protein, predicted ATP/GTP-binding protein  33.28 
 
 
605 aa  298  1e-79  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1545  GTP-binding protein  34.16 
 
 
569 aa  270  5e-71  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.712051  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0436  GTP-binding protein  33.52 
 
 
569 aa  264  4e-69  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0461  GTP-binding protein  33.46 
 
 
569 aa  258  2e-67  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.0612543  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0398  Dynamin family protein  28.92 
 
 
674 aa  245  1.9999999999999999e-63  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6880  Dynamin family protein  28 
 
 
1164 aa  92.8  2e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3240  hypothetical protein  34.66 
 
 
537 aa  82.8  0.00000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.41085  normal  0.440891 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39120  GTPase of unknown function  32 
 
 
536 aa  82  0.00000000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.480255 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6878  Dynamin family protein  25.9 
 
 
620 aa  80.5  0.00000000000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2910  dynamin family protein  28.46 
 
 
605 aa  79.3  0.0000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.518789  normal  0.400566 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7006  hypothetical protein  31.17 
 
 
497 aa  79.3  0.0000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.707702  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2994  dynamin family protein  28.23 
 
 
614 aa  79  0.0000000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.214598  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3036  dynamin family protein  28.23 
 
 
614 aa  79  0.0000000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0241135  normal  0.688737 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0933  dynamin family protein  31.72 
 
 
679 aa  79  0.0000000000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.807319  hitchhiker  0.00750508 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1273  Dynamin family protein  27.73 
 
 
407 aa  78.2  0.0000000000005  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.0000000146438  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2259  Dynamin family protein  30.22 
 
 
444 aa  78.2  0.0000000000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000551632  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3725  hypothetical protein  29.89 
 
 
569 aa  71.2  0.00000000005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.491681  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2425  GTP-binding protein HSR1-related  34.92 
 
 
533 aa  70.1  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2213  Dynamin family protein  28.18 
 
 
587 aa  70.1  0.0000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0787  dynamin family protein  28.51 
 
 
655 aa  69.3  0.0000000002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.0394271  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1439  Dynamin family protein  27.6 
 
 
546 aa  68.6  0.0000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.784928  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1653  GTP-binding protein, HSR1-related  36.36 
 
 
524 aa  68.6  0.0000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0754256  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3459  hypothetical protein  28.8 
 
 
568 aa  68.6  0.0000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.825542 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6053  hypothetical protein  33.96 
 
 
570 aa  68.6  0.0000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0397  Dynamin family protein  25.87 
 
 
789 aa  68.2  0.0000000004  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0111735  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3727  hypothetical protein  28.99 
 
 
503 aa  67.4  0.0000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0286482 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10348  isoniazid inductible gene protein iniC  30.22 
 
 
493 aa  67.4  0.0000000007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1095  dynamin  29.66 
 
 
588 aa  66.6  0.000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.845511  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0625  isoniazid inductible gene protein IniC  28.49 
 
 
496 aa  65.9  0.000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0105414  normal  0.124728 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0859  GTP-binding protein  28.71 
 
 
692 aa  66.2  0.000000002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.547864  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1096  GTP-binding protein, HSR1-related  28.8 
 
 
664 aa  64.7  0.000000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1377  dynamin family protein  22.19 
 
 
585 aa  64.3  0.000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.682843  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1741  hypothetical protein  28.07 
 
 
1219 aa  64.3  0.000000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000058782  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1479  hypothetical protein  28.07 
 
 
1219 aa  63.9  0.000000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1451  GTP1/OBG family GTPase  28.07 
 
 
1219 aa  63.9  0.000000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1451  GTP1/OBG family GTPase  28.07 
 
 
1219 aa  64.3  0.000000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.472831  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1351  heat shock protein DnaJ-like  31.75 
 
 
741 aa  63.9  0.000000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0473185 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1595  hypothetical protein  28.07 
 
 
1219 aa  63.9  0.000000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1665  hypothetical protein  28.07 
 
 
1219 aa  64.3  0.000000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1701  hypothetical protein  28.07 
 
 
1219 aa  63.2  0.00000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0435  isoniazid inductible gene protein IniC  28.33 
 
 
502 aa  63.2  0.00000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.495119  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1630  hypothetical protein  27.33 
 
 
1219 aa  63.5  0.00000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00254693  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0448  isoniazid inductible gene protein IniC  28.33 
 
 
502 aa  62.8  0.00000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.608591  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0458  isoniazid inductible gene protein IniC  28.33 
 
 
502 aa  62.8  0.00000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.148496  normal  0.646066 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0914  Dynamin family protein  25.53 
 
 
548 aa  62.4  0.00000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.440355 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1494  dynamin family protein  28.29 
 
 
1219 aa  62.8  0.00000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.248245  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0632  Dynamin family protein  23.76 
 
 
589 aa  62.8  0.00000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3715  hypothetical protein  24.24 
 
 
1219 aa  62.8  0.00000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1306  dynamin family protein  28.07 
 
 
1219 aa  61.6  0.00000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.604786  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0403  dynamin family protein  28 
 
 
693 aa  62  0.00000003  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2546  hypothetical protein  27.95 
 
 
719 aa  61.6  0.00000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0908682 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0437  GTP-binding protein  24.47 
 
 
692 aa  61.6  0.00000004  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1510  GTP-binding protein HSR1-related  26.64 
 
 
523 aa  61.6  0.00000004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2545  dynamin  30.91 
 
 
390 aa  61.2  0.00000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0649757  normal  0.0791445 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3083  putative GTPase of unknown function  31.4 
 
 
496 aa  60.1  0.0000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0815  GTPase  30.2 
 
 
712 aa  58.9  0.0000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0830  hypothetical protein  30.2 
 
 
712 aa  58.5  0.0000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00896739  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3531  dynamin family protein  20.88 
 
 
585 aa  58.2  0.0000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0322  Dynamin family protein  28.15 
 
 
585 aa  58.2  0.0000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1193  hypothetical protein  26.76 
 
 
614 aa  57.4  0.0000008  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.108086  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0273  hypothetical protein  28.67 
 
 
608 aa  56.6  0.000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0272  isoniazid inductible gene protein IniC  29.01 
 
 
468 aa  55.8  0.000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1896  Dynamin family protein  32.14 
 
 
1228 aa  55.8  0.000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00444431  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2392  Dynamin family protein  27.98 
 
 
1249 aa  56.2  0.000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6055  hypothetical protein  25.48 
 
 
696 aa  55.5  0.000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5963  hypothetical protein  30.37 
 
 
610 aa  55.5  0.000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0107791  normal  0.0849156 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0372  hypothetical protein  40.3 
 
 
587 aa  54.3  0.000006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1733  hypothetical protein  30 
 
 
976 aa  54.3  0.000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1654  dynamin  28.57 
 
 
686 aa  54.3  0.000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0311974  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2547  dynamin  25.5 
 
 
551 aa  53.5  0.00001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.164219 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3242  hypothetical protein  24.69 
 
 
377 aa  53.1  0.00001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.202403 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2968  dynamin family protein  21.17 
 
 
583 aa  52.8  0.00002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2424  Dynamin family protein  27.78 
 
 
666 aa  52.4  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1013  hypothetical protein  25.67 
 
 
1145 aa  52.4  0.00003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.445275  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0435  GTP-binding protein  26.82 
 
 
728 aa  52.4  0.00003  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1653  GTP-binding protein, HSR1-related  28.12 
 
 
501 aa  52  0.00003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.481236  normal  0.975567 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1638  GTP-binding protein HSR1-related  28.81 
 
 
501 aa  52  0.00003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.178731  normal 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1546  GTP-binding protein  27.22 
 
 
728 aa  51.2  0.00006  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0460  GTP-binding protein  26.26 
 
 
728 aa  50.8  0.00007  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.839985  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2106  dynamin  22.69 
 
 
564 aa  50.4  0.00009  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.78205 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0624  hypothetical protein  26.06 
 
 
602 aa  50.4  0.00009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.318926  normal  0.0782013 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4402  hypothetical protein  28.83 
 
 
847 aa  50.1  0.0001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00858282  hitchhiker  0.00244016 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4146  hypothetical protein  28.82 
 
 
283 aa  50.4  0.0001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.575249 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1350  dynamin  35.71 
 
 
693 aa  48.9  0.0002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0228271 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1501  hypothetical protein  33.72 
 
 
1146 aa  48.9  0.0003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1530  hypothetical protein  33.72 
 
 
1146 aa  48.9  0.0003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.532706  n/a   
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5313  hypothetical protein  25 
 
 
743 aa  48.1  0.0004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2560  AAA ATPase  27.57 
 
 
687 aa  47.8  0.0006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0377  hypothetical protein  40.62 
 
 
852 aa  47.4  0.0008  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1639  dynamin family protein  24.06 
 
 
605 aa  47.4  0.0009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.143429  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1654  dynamin family protein  23.31 
 
 
603 aa  46.6  0.001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.964955 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4205  hypothetical protein  27.73 
 
 
809 aa  47  0.001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4244  GTPase (dynamin-related)-like protein  27.73 
 
 
809 aa  47  0.001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  unclonable  0.000109098  hitchhiker  0.00000166794 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0312  hypothetical protein  31.51 
 
 
784 aa  45.8  0.002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0131093 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0336  conserved hypothetical protein, predicted ATP/GTP-binding protein  25.86 
 
 
741 aa  45.8  0.002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5314  hypothetical protein  50 
 
 
952 aa  45.4  0.003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>