265 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dgeo_2106 on replicon NC_008025
Organism: Deinococcus geothermalis DSM 11300



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008025  Dgeo_2106  dynamin  100 
 
 		 564 aa  1099    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.78205 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0632  Dynamin family protein  36 
 
 		 589 aa  370  1e-101  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3531  dynamin family protein  40.6 
 
 		 585 aa  361  2e-98  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2968  dynamin family protein  38.04 
 
 		 583 aa  360  3e-98  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1377  dynamin family protein  40.26 
 
 		 585 aa  347  3e-94  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.682843  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2213  Dynamin family protein  37.14 
 
 		 587 aa  326  6e-88  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0322  Dynamin family protein  37.09 
 
 		 585 aa  295  2e-78  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0914  Dynamin family protein  35.97 
 
 		 548 aa  257  4e-67  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.440355 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1439  Dynamin family protein  36.31 
 
 		 546 aa  253  7e-66  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.784928  normal  1 
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_44250  predicted protein  35.24 
 
 		 632 aa  176  9e-43  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.755773  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6878  Dynamin family protein  37.77 
 
 		 620 aa  119  9.999999999999999e-26  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1510  GTP-binding protein HSR1-related  29.5 
 
 		 523 aa  110  9.000000000000001e-23  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6880  Dynamin family protein  34.71 
 
 		 1164 aa  105  2e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2994  dynamin family protein  32.42 
 
 		 614 aa  95.9  2e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.214598  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3036  dynamin family protein  32.42 
 
 		 614 aa  95.9  2e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0241135  normal  0.688737 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1273  Dynamin family protein  29.58 
 
 		 407 aa  95.9  2e-18  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.0000000146438  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2910  dynamin family protein  28.01 
 
 		 605 aa  90.1  9e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.518789  normal  0.400566 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2259  Dynamin family protein  25.82 
 
 		 444 aa  89.4  1e-16  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000551632  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0933  dynamin family protein  30.35 
 
 		 679 aa  86.3  0.000000000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.807319  hitchhiker  0.00750508 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2392  Dynamin family protein  29.21 
 
 		 1249 aa  81.6  0.00000000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1095  dynamin  30.54 
 
 		 588 aa  80.5  0.00000000000007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.845511  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2424  Dynamin family protein  29.11 
 
 		 666 aa  80.5  0.00000000000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1193  hypothetical protein  28.71 
 
 		 614 aa  78.6  0.0000000000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.108086  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1096  GTP-binding protein, HSR1-related  30.88 
 
 		 664 aa  77.8  0.0000000000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5314  hypothetical protein  25.16 
 
 		 952 aa  76.3  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0398  Dynamin family protein  28.38 
 
 		 674 aa  76.3  0.000000000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1306  dynamin family protein  29.88 
 
 		 1219 aa  72  0.00000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.604786  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2196  dynamin family protein  26.56 
 
 		 506 aa  71.2  0.00000000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000046764 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1896  Dynamin family protein  25.29 
 
 		 1228 aa  69.7  0.0000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00444431  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1479  hypothetical protein  28.22 
 
 		 1219 aa  68.2  0.0000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1451  GTP1/OBG family GTPase  28.22 
 
 		 1219 aa  68.2  0.0000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.472831  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1595  hypothetical protein  28.22 
 
 		 1219 aa  68.2  0.0000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1494  dynamin family protein  28.18 
 
 		 1219 aa  68.2  0.0000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.248245  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3715  hypothetical protein  28.22 
 
 		 1219 aa  68.2  0.0000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1701  hypothetical protein  28.22 
 
 		 1219 aa  67.8  0.0000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1451  GTP1/OBG family GTPase  28.22 
 
 		 1219 aa  67.8  0.0000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1741  hypothetical protein  28.22 
 
 		 1219 aa  67.8  0.0000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000058782  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1665  hypothetical protein  28.22 
 
 		 1219 aa  67.8  0.0000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1630  hypothetical protein  28.22 
 
 		 1219 aa  67.4  0.0000000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00254693  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6053  hypothetical protein  26.51 
 
 		 570 aa  66.6  0.000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39100  GTPase of unknown function  32.1 
 
 		 617 aa  65.5  0.000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  decreased coverage  0.0000974304  normal  0.356305 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1350  dynamin  28.57 
 
 		 693 aa  65.1  0.000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0228271 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1654  dynamin  29.21 
 
 		 686 aa  65.5  0.000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0311974  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08870  hypothetical protein  31.29 
 
 		 566 aa  65.1  0.000000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0706838  normal  0.0205572 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1654  dynamin family protein  27.4 
 
 		 603 aa  65.1  0.000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.964955 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2209  GTP-binding protein  27.91 
 
 		 615 aa  64.3  0.000000006  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1351  heat shock protein DnaJ-like  32.34 
 
 		 741 aa  63.2  0.00000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0473185 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2547  dynamin  28.73 
 
 		 551 aa  63.5  0.00000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.164219 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1530  hypothetical protein  22.61 
 
 		 1146 aa  62.8  0.00000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.532706  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3240  hypothetical protein  29.67 
 
 		 537 aa  62.4  0.00000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.41085  normal  0.440891 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1501  hypothetical protein  22.61 
 
 		 1146 aa  62.8  0.00000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1013  hypothetical protein  25.19 
 
 		 1145 aa  61.2  0.00000005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.445275  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0436  GTP-binding protein  25.67 
 
 		 569 aa  61.2  0.00000005  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1086  hypothetical protein  34.23 
 
 		 551 aa  60.8  0.00000006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  decreased coverage  0.00952601  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1639  dynamin family protein  27.04 
 
 		 605 aa  60.8  0.00000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.143429  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1349  hypothetical protein  29.84 
 
 		 566 aa  60.5  0.00000009  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000440573 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1813  GTP-binding protein EngA  30.68 
 
 		 436 aa  60.5  0.00000009  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.18548  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7362  hypothetical protein  32.3 
 
 		 564 aa  60.5  0.00000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0821059  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0828  hypothetical protein  22.62 
 
 		 516 aa  60.1  0.0000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000529126  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1545  GTP-binding protein  25.67 
 
 		 569 aa  60.1  0.0000001  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.712051  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3729  hypothetical protein  28.48 
 
 		 626 aa  59.7  0.0000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.731679  normal  0.057897 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0461  GTP-binding protein  26.48 
 
 		 569 aa  59.3  0.0000002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.0612543  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0813  hypothetical protein  25 
 
 		 516 aa  59.3  0.0000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2220  putative ABC transporter  30.63 
 
 		 619 aa  59.3  0.0000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2131  GTP-binding protein EngA  28.29 
 
 		 441 aa  59.3  0.0000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000643599  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2751  GTP-binding protein, HSR1-related  30.4 
 
 		 549 aa  59.3  0.0000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.859645  normal  0.205011 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0404  glucosamine fructose-6-phosphate aminotransferase (isomerizing)  31.67 
 
 		 610 aa  58.9  0.0000003  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0859  GTP-binding protein  23.71 
 
 		 692 aa  58.5  0.0000003  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.547864  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3084  hypothetical protein  27.21 
 
 		 627 aa  58.5  0.0000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24320  hypothetical protein  30.26 
 
 		 584 aa  57.8  0.0000005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2546  hypothetical protein  22.5 
 
 		 719 aa  57.8  0.0000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0908682 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2523  putative ABC transporter  32.87 
 
 		 571 aa  57.8  0.0000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0273  hypothetical protein  27.14 
 
 		 608 aa  57.8  0.0000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5313  hypothetical protein  28.62 
 
 		 743 aa  57.4  0.0000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2013  GTP-binding protein EngA  30.99 
 
 		 437 aa  57.4  0.0000007  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00580637  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08690  hypothetical protein  30.67 
 
 		 602 aa  56.2  0.000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0372  hypothetical protein  27.05 
 
 		 587 aa  56.6  0.000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2260  putative ABC transporter  32.17 
 
 		 571 aa  56.2  0.000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000139745 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0438  GTP-binding protein  25.98 
 
 		 599 aa  56.6  0.000001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3535  GTP-binding protein Era  27.92 
 
 		 324 aa  55.8  0.000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2356  GTP-binding protein EngA  25.93 
 
 		 437 aa  55.1  0.000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0403  dynamin family protein  22.87 
 
 		 693 aa  55.1  0.000003  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0759  putative GTPase  28.44 
 
 		 291 aa  55.1  0.000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0536  putative GTP-binding protein EngA  24.08 
 
 		 473 aa  54.7  0.000004  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0624  hypothetical protein  23.53 
 
 		 602 aa  55.1  0.000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.318926  normal  0.0782013 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3430  putative ABC transporter  30.63 
 
 		 631 aa  54.3  0.000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.790282  normal  0.301569 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04795  GTP-binding protein EngA  28.8 
 
 		 434 aa  54.7  0.000005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5964  hypothetical protein  30.51 
 
 		 641 aa  54.7  0.000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0285067  normal  0.193033 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0421  GTP-binding protein EngA  30.11 
 
 		 437 aa  54.3  0.000006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0613118  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4957  tRNA modification GTPase TrmE  32.72 
 
 		 459 aa  53.9  0.000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000028541  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08880  predicted GTPase  28.33 
 
 		 564 aa  53.5  0.000009  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.141009  normal  0.0562111 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2016  GTP-binding protein EngA  28.33 
 
 		 435 aa  53.5  0.000009  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3291  small GTP-binding protein domain-containing protein  33.57 
 
 		 492 aa  53.1  0.00001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2545  dynamin  26.28 
 
 		 390 aa  53.1  0.00001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0649757  normal  0.0791445 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1324  hypothetical protein  28.66 
 
 		 569 aa  53.5  0.00001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.577358  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_8770  predicted protein  27.71 
 
 		 390 aa  52.8  0.00001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1651  GTP-binding protein EngA  28.57 
 
 		 443 aa  52.4  0.00002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1080  small GTP-binding protein  32.64 
 
 		 484 aa  52.8  0.00002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6542  small GTP-binding protein  28.76 
 
 		 441 aa  52.4  0.00002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3381  GTP-binding protein EngA  29.79 
 
 		 441 aa  52.4  0.00002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000285965  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>