88 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_7362 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014165  Tbis_2560  AAA ATPase  65.6 
 
 		 687 aa  729    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7362  hypothetical protein  100 
 
 		 564 aa  1120    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0821059  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1324  hypothetical protein  55.91 
 
 		 569 aa  593  1e-168  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.577358  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3430  putative ABC transporter  44.41 
 
 		 631 aa  442  9.999999999999999e-123  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.790282  normal  0.301569 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2220  putative ABC transporter  45.42 
 
 		 619 aa  431  1e-119  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3266  putative ABC transporter  41.92 
 
 		 571 aa  356  5e-97  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.025779  normal  0.223838 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8871  putative ABC transporter  42.19 
 
 		 629 aa  348  1e-94  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.872872  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2260  putative ABC transporter  40.07 
 
 		 571 aa  336  7.999999999999999e-91  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000139745 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0079  putative ABC transporter  41.62 
 
 		 565 aa  335  2e-90  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.459634  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08870  hypothetical protein  38.73 
 
 		 566 aa  323  7e-87  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0706838  normal  0.0205572 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1353  putative ABC transporter  39.63 
 
 		 667 aa  322  9.999999999999999e-87  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  hitchhiker  0.00435841  hitchhiker  0.000139423 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1549  putative ABC transporter  40 
 
 		 586 aa  320  3.9999999999999996e-86  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1572  putative ABC transporter  40 
 
 		 586 aa  320  3.9999999999999996e-86  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2523  putative ABC transporter  40.43 
 
 		 571 aa  319  7e-86  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1520  putative ABC transporter  40.11 
 
 		 576 aa  318  1e-85  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.703438  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2641  putative ABC transporter  40.83 
 
 		 669 aa  308  1.0000000000000001e-82  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.374728  normal  0.779452 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24320  hypothetical protein  38.83 
 
 		 584 aa  289  1e-76  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24700  hypothetical protein  38.9 
 
 		 784 aa  286  5e-76  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.303383  normal  0.0806263 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1366  putative ABC transporter  36.96 
 
 		 572 aa  283  8.000000000000001e-75  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1090  hypothetical protein  37.12 
 
 		 737 aa  270  5e-71  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08690  hypothetical protein  36.35 
 
 		 602 aa  267  4e-70  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0932  hypothetical protein  34.36 
 
 		 650 aa  267  5e-70  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1086  hypothetical protein  32.33 
 
 		 551 aa  216  7e-55  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  decreased coverage  0.00952601  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1349  hypothetical protein  37.65 
 
 		 566 aa  199  1.0000000000000001e-49  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000440573 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24740  hypothetical protein  36.31 
 
 		 551 aa  191  2.9999999999999997e-47  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.043803  normal  0.105516 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0928  hypothetical protein  36.45 
 
 		 540 aa  189  1e-46  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2645  putative transcriptional regulator, TetR family  35 
 
 		 526 aa  187  5e-46  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1736  putative ABC transporter  27.91 
 
 		 556 aa  118  3e-25  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1735  putative ABC transporter  35.5 
 
 		 552 aa  85.9  0.000000000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.43735  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1350  putative ABC transporter  34.8 
 
 		 524 aa  84  0.000000000000007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.43815  hitchhiker  0.000106139 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1354  GTP-binding protein HSR1-related protein  37.7 
 
 		 542 aa  83.6  0.000000000000009  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0428896  hitchhiker  0.0000949376 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08880  predicted GTPase  34.9 
 
 		 564 aa  79.7  0.0000000000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.141009  normal  0.0562111 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6775  putative ABC transporter  33.47 
 
 		 589 aa  77  0.0000000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.122043  normal  0.131288 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1326  hypothetical protein  29.91 
 
 		 568 aa  72.4  0.00000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1367  putative ABC transporter  34.01 
 
 		 555 aa  72.4  0.00000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.621246  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2640  GTP-binding protein HSR1-related protein  34.93 
 
 		 550 aa  72.4  0.00000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.133942  normal  0.721182 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3429  hypothetical protein  31.58 
 
 		 802 aa  72  0.00000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.224896 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0933  hypothetical protein  33.52 
 
 		 578 aa  72  0.00000000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2522  putative ABC transporter  32.46 
 
 		 539 aa  71.2  0.00000000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.504723  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1087  putative ABC transporter  31.33 
 
 		 523 aa  71.2  0.00000000005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0151577  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24690  GTPase of unknown function  36.96 
 
 		 539 aa  70.5  0.00000000009  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.6041  normal  0.0378138 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2559  putative ABC transporter  38.69 
 
 		 542 aa  67  0.0000000008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1091  putative ABC transporter  32.63 
 
 		 585 aa  67  0.0000000009  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.631509  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0929  hypothetical protein  28.84 
 
 		 518 aa  66.6  0.000000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3531  dynamin family protein  28.02 
 
 		 585 aa  65.9  0.000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24310  hypothetical protein  33.56 
 
 		 568 aa  66.2  0.000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24730  predicted GTPase  29.66 
 
 		 517 aa  65.5  0.000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0664672  normal  0.0671171 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0080  GTP-binding protein HSR1-related protein  35.9 
 
 		 532 aa  64.7  0.000000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.170633  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3265  putative ABC transporter  33.91 
 
 		 532 aa  64.3  0.000000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.169453  normal  0.30236 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1377  dynamin family protein  25.74 
 
 		 585 aa  63.9  0.000000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.682843  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2219  GTPase  28.57 
 
 		 673 aa  63.5  0.00000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7361  putative ABC transporter  37.59 
 
 		 547 aa  62.8  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.901699  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1519  putative ABC transporter  28.94 
 
 		 525 aa  62.8  0.00000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0914  Dynamin family protein  28.87 
 
 		 548 aa  62.4  0.00000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.440355 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1571  putative ABC transporter  28.57 
 
 		 525 aa  62  0.00000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2968  dynamin family protein  26.61 
 
 		 583 aa  62  0.00000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1548  putative ABC transporter  28.57 
 
 		 525 aa  62  0.00000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8870  putative ABC transporter  29.92 
 
 		 590 aa  61.2  0.00000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0939636  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08700  hypothetical protein  30.13 
 
 		 586 aa  60.8  0.00000006  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3997  hypothetical protein  27.57 
 
 		 642 aa  60.5  0.00000009  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1439  Dynamin family protein  26.38 
 
 		 546 aa  60.1  0.0000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.784928  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2106  dynamin  32.3 
 
 		 564 aa  60.1  0.0000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.78205 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1394  hypothetical protein  26.04 
 
 		 543 aa  59.3  0.0000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2213  Dynamin family protein  29.05 
 
 		 587 aa  58.5  0.0000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2259  GTP-binding protein HSR1-related  28 
 
 		 537 aa  57.8  0.0000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000117964 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3738  hypothetical protein  30.88 
 
 		 618 aa  57.8  0.0000006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0322  Dynamin family protein  32.26 
 
 		 585 aa  54.7  0.000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0632  Dynamin family protein  23.65 
 
 		 589 aa  51.2  0.00004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2644  ATP-binding membrane protein  29.47 
 
 		 453 aa  51.6  0.00004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.908609 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1013  hypothetical protein  21.28 
 
 		 1145 aa  50.4  0.00008  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.445275  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6880  Dynamin family protein  29.19 
 
 		 1164 aa  49.7  0.0002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1665  hypothetical protein  21.66 
 
 		 1219 aa  47.8  0.0006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1741  hypothetical protein  21.66 
 
 		 1219 aa  47.8  0.0006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000058782  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1479  hypothetical protein  21.66 
 
 		 1219 aa  47.8  0.0006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1595  hypothetical protein  21.66 
 
 		 1219 aa  47.8  0.0006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1451  GTP1/OBG family GTPase  21.66 
 
 		 1219 aa  47.4  0.0006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.472831  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1451  GTP1/OBG family GTPase  21.66 
 
 		 1219 aa  47.8  0.0006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1530  hypothetical protein  19.12 
 
 		 1146 aa  47.4  0.0008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.532706  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1501  hypothetical protein  19.12 
 
 		 1146 aa  47.4  0.0008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3715  hypothetical protein  21.66 
 
 		 1219 aa  46.6  0.001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1306  dynamin family protein  21.04 
 
 		 1219 aa  46.6  0.001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.604786  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1630  hypothetical protein  21.66 
 
 		 1219 aa  46.6  0.001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00254693  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1701  hypothetical protein  21.66 
 
 		 1219 aa  47  0.001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2910  dynamin family protein  26.54 
 
 		 605 aa  45.8  0.002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.518789  normal  0.400566 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1494  dynamin family protein  21.66 
 
 		 1219 aa  45.8  0.002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.248245  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2424  Dynamin family protein  27.63 
 
 		 666 aa  44.7  0.004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0881  GTP-binding protein Era  33.33 
 
 		 332 aa  45.1  0.004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.427391  normal  0.11596 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1510  GTP-binding protein HSR1-related  21.74 
 
 		 523 aa  44.7  0.005  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>