63 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_2644 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012669  Bcav_2644  ATP-binding membrane protein  100 
 
 		 453 aa  856    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.908609 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1350  putative ABC transporter  51.37 
 
 		 524 aa  291  1e-77  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.43815  hitchhiker  0.000106139 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1087  putative ABC transporter  49.72 
 
 		 523 aa  271  2e-71  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0151577  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0929  hypothetical protein  43.67 
 
 		 518 aa  268  1e-70  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24730  predicted GTPase  48.73 
 
 		 517 aa  265  2e-69  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0664672  normal  0.0671171 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7361  putative ABC transporter  42.01 
 
 		 547 aa  210  4e-53  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.901699  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2559  putative ABC transporter  44.48 
 
 		 542 aa  207  3e-52  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3265  putative ABC transporter  52.42 
 
 		 532 aa  206  8e-52  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.169453  normal  0.30236 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2219  GTPase  43.75 
 
 		 673 aa  206  9e-52  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1367  putative ABC transporter  49.79 
 
 		 555 aa  203  6e-51  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.621246  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8870  putative ABC transporter  41.57 
 
 		 590 aa  197  2.0000000000000003e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0939636  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1326  hypothetical protein  48.16 
 
 		 568 aa  197  3e-49  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1519  putative ABC transporter  37.92 
 
 		 525 aa  194  3e-48  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1548  putative ABC transporter  38.16 
 
 		 525 aa  194  3e-48  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1571  putative ABC transporter  38.16 
 
 		 525 aa  194  3e-48  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2522  putative ABC transporter  41.14 
 
 		 539 aa  182  1e-44  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.504723  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6775  putative ABC transporter  43.31 
 
 		 589 aa  181  2e-44  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.122043  normal  0.131288 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08880  predicted GTPase  41.85 
 
 		 564 aa  180  4e-44  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.141009  normal  0.0562111 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1354  GTP-binding protein HSR1-related protein  50.46 
 
 		 542 aa  176  5e-43  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0428896  hitchhiker  0.0000949376 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2640  GTP-binding protein HSR1-related protein  39.8 
 
 		 550 aa  171  2e-41  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.133942  normal  0.721182 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1091  putative ABC transporter  46.55 
 
 		 585 aa  171  4e-41  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.631509  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24690  GTPase of unknown function  46.67 
 
 		 539 aa  170  4e-41  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.6041  normal  0.0378138 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0080  GTP-binding protein HSR1-related protein  50.48 
 
 		 532 aa  170  6e-41  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.170633  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2259  GTP-binding protein HSR1-related  44.16 
 
 		 537 aa  160  4e-38  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000117964 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08700  hypothetical protein  41.45 
 
 		 586 aa  149  9e-35  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24310  hypothetical protein  41.15 
 
 		 568 aa  129  1.0000000000000001e-28  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1735  putative ABC transporter  36.67 
 
 		 552 aa  127  5e-28  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.43735  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0933  hypothetical protein  34.08 
 
 		 578 aa  123  8e-27  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1394  hypothetical protein  31.35 
 
 		 543 aa  75.1  0.000000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2523  putative ABC transporter  30.18 
 
 		 571 aa  63.9  0.000000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2260  putative ABC transporter  34.2 
 
 		 571 aa  59.7  0.0000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000139745 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1353  putative ABC transporter  30.35 
 
 		 667 aa  57  0.0000007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  hitchhiker  0.00435841  hitchhiker  0.000139423 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1349  hypothetical protein  32.34 
 
 		 566 aa  55.8  0.000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000440573 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08690  hypothetical protein  31.16 
 
 		 602 aa  53.1  0.000009  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0759  putative GTPase  29.94 
 
 		 291 aa  53.1  0.000009  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3738  hypothetical protein  31.33 
 
 		 618 aa  53.1  0.00001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1439  Dynamin family protein  27.4 
 
 		 546 aa  52  0.00002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.784928  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2220  putative ABC transporter  27.48 
 
 		 619 aa  52.4  0.00002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08870  hypothetical protein  32.79 
 
 		 566 aa  52.4  0.00002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0706838  normal  0.0205572 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7362  hypothetical protein  29.02 
 
 		 564 aa  51.2  0.00003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0821059  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0928  hypothetical protein  30 
 
 		 540 aa  51.2  0.00004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24740  hypothetical protein  33.9 
 
 		 551 aa  50.8  0.00005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.043803  normal  0.105516 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8871  putative ABC transporter  31.52 
 
 		 629 aa  50.4  0.00007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.872872  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3430  putative ABC transporter  31.13 
 
 		 631 aa  50.4  0.00007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.790282  normal  0.301569 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1086  hypothetical protein  29.14 
 
 		 551 aa  50.1  0.00008  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  decreased coverage  0.00952601  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2645  putative transcriptional regulator, TetR family  30.86 
 
 		 526 aa  50.1  0.00009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2560  AAA ATPase  28.1 
 
 		 687 aa  49.7  0.0001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24320  hypothetical protein  30.37 
 
 		 584 aa  47.8  0.0004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1366  putative ABC transporter  34.05 
 
 		 572 aa  47.8  0.0004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1324  hypothetical protein  30.71 
 
 		 569 aa  46.2  0.001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.577358  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1549  putative ABC transporter  32.42 
 
 		 586 aa  46.2  0.001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1572  putative ABC transporter  32.42 
 
 		 586 aa  46.2  0.001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1520  putative ABC transporter  30.89 
 
 		 576 aa  45.8  0.002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.703438  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1096  GTP-binding proten HflX  31.4 
 
 		 392 aa  44.7  0.003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4797  putative GTPase  30.38 
 
 		 294 aa  45.1  0.003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.276697 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0914  Dynamin family protein  27.78 
 
 		 548 aa  45.1  0.003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.440355 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5013  GTP-binding proten HflX  27.27 
 
 		 404 aa  45.1  0.003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0596854  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3402  putative GTPase  30.38 
 
 		 294 aa  45.1  0.003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2641  putative ABC transporter  30.32 
 
 		 669 aa  44.7  0.004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.374728  normal  0.779452 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1176  small GTP-binding protein  31.4 
 
 		 392 aa  44.3  0.004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.668458  normal  0.446741 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3202  putative GTPase  29.52 
 
 		 294 aa  43.9  0.005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0322  Dynamin family protein  27.03 
 
 		 585 aa  44.3  0.005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2213  Dynamin family protein  28.35 
 
 		 587 aa  43.9  0.006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>