78 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbis_3265 on replicon NC_014165
Organism: Thermobispora bispora DSM 43833



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014165  Tbis_3265  putative ABC transporter  100 
 
 		 532 aa  996    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.169453  normal  0.30236 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8870  putative ABC transporter  57.58 
 
 		 590 aa  520  1e-146  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0939636  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1548  putative ABC transporter  47.33 
 
 		 525 aa  374  1e-102  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1571  putative ABC transporter  47.33 
 
 		 525 aa  374  1e-102  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1519  putative ABC transporter  47.06 
 
 		 525 aa  374  1e-102  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2522  putative ABC transporter  47.19 
 
 		 539 aa  345  8.999999999999999e-94  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.504723  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2640  GTP-binding protein HSR1-related protein  50.3 
 
 		 550 aa  338  9.999999999999999e-92  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.133942  normal  0.721182 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24690  GTPase of unknown function  46.89 
 
 		 539 aa  335  1e-90  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.6041  normal  0.0378138 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2559  putative ABC transporter  41.73 
 
 		 542 aa  326  8.000000000000001e-88  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2259  GTP-binding protein HSR1-related  47.8 
 
 		 537 aa  324  3e-87  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000117964 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0080  GTP-binding protein HSR1-related protein  50.23 
 
 		 532 aa  323  5e-87  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.170633  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1354  GTP-binding protein HSR1-related protein  51.03 
 
 		 542 aa  320  3.9999999999999996e-86  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0428896  hitchhiker  0.0000949376 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08880  predicted GTPase  43.43 
 
 		 564 aa  319  9e-86  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.141009  normal  0.0562111 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7361  putative ABC transporter  40.82 
 
 		 547 aa  315  9.999999999999999e-85  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.901699  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1091  putative ABC transporter  43.94 
 
 		 585 aa  312  7.999999999999999e-84  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.631509  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2219  GTPase  42.27 
 
 		 673 aa  303  5.000000000000001e-81  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1326  hypothetical protein  41.73 
 
 		 568 aa  299  9e-80  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1367  putative ABC transporter  47.68 
 
 		 555 aa  297  3e-79  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.621246  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3429  hypothetical protein  38.81 
 
 		 802 aa  266  7e-70  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.224896 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24310  hypothetical protein  42.51 
 
 		 568 aa  259  1e-67  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08700  hypothetical protein  41.15 
 
 		 586 aa  257  3e-67  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6775  putative ABC transporter  34.33 
 
 		 589 aa  240  5e-62  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.122043  normal  0.131288 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0933  hypothetical protein  35.84 
 
 		 578 aa  213  4.9999999999999996e-54  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2644  ATP-binding membrane protein  52.42 
 
 		 453 aa  206  6e-52  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.908609 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24730  predicted GTPase  47.79 
 
 		 517 aa  197  5.000000000000001e-49  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0664672  normal  0.0671171 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1735  putative ABC transporter  36.2 
 
 		 552 aa  195  2e-48  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.43735  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1087  putative ABC transporter  35.65 
 
 		 523 aa  182  1e-44  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0151577  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0929  hypothetical protein  44.87 
 
 		 518 aa  177  5e-43  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2260  putative ABC transporter  34.78 
 
 		 571 aa  75.9  0.000000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000139745 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2220  putative ABC transporter  34.27 
 
 		 619 aa  75.1  0.000000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1324  hypothetical protein  34.46 
 
 		 569 aa  74.3  0.000000000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.577358  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08870  hypothetical protein  31.34 
 
 		 566 aa  73.2  0.00000000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0706838  normal  0.0205572 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3430  putative ABC transporter  33.5 
 
 		 631 aa  72.8  0.00000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.790282  normal  0.301569 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7362  hypothetical protein  31.33 
 
 		 564 aa  70.5  0.00000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0821059  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1572  putative ABC transporter  33.04 
 
 		 586 aa  69.3  0.0000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1349  hypothetical protein  34.29 
 
 		 566 aa  69.3  0.0000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000440573 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1549  putative ABC transporter  33.04 
 
 		 586 aa  69.3  0.0000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1439  Dynamin family protein  30.05 
 
 		 546 aa  69.3  0.0000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.784928  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1366  putative ABC transporter  35.62 
 
 		 572 aa  68.6  0.0000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2523  putative ABC transporter  31.17 
 
 		 571 aa  68.2  0.0000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1520  putative ABC transporter  32.6 
 
 		 576 aa  68.2  0.0000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.703438  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1086  hypothetical protein  31.64 
 
 		 551 aa  67.4  0.0000000006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  decreased coverage  0.00952601  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3266  putative ABC transporter  36.56 
 
 		 571 aa  67.4  0.0000000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.025779  normal  0.223838 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2560  AAA ATPase  29.73 
 
 		 687 aa  66.2  0.000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24740  hypothetical protein  38.79 
 
 		 551 aa  65.9  0.000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.043803  normal  0.105516 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08690  hypothetical protein  31.18 
 
 		 602 aa  65.1  0.000000003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1353  putative ABC transporter  31.2 
 
 		 667 aa  62.4  0.00000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  hitchhiker  0.00435841  hitchhiker  0.000139423 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0928  hypothetical protein  34.96 
 
 		 540 aa  58.9  0.0000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3997  hypothetical protein  30.41 
 
 		 642 aa  58.5  0.0000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1394  hypothetical protein  29.35 
 
 		 543 aa  57.8  0.0000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2645  putative transcriptional regulator, TetR family  39.66 
 
 		 526 aa  58.2  0.0000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0914  Dynamin family protein  30.6 
 
 		 548 aa  57.8  0.0000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.440355 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8871  putative ABC transporter  35 
 
 		 629 aa  57  0.0000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.872872  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2641  putative ABC transporter  32.43 
 
 		 669 aa  56.2  0.000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.374728  normal  0.779452 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0079  putative ABC transporter  34.44 
 
 		 565 aa  53.9  0.000008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.459634  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3738  hypothetical protein  34.93 
 
 		 618 aa  52.8  0.00002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24320  hypothetical protein  31.91 
 
 		 584 aa  51.6  0.00003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0932  hypothetical protein  27.54 
 
 		 650 aa  51.2  0.00004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24700  hypothetical protein  30.24 
 
 		 784 aa  50.8  0.00006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.303383  normal  0.0806263 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0322  Dynamin family protein  28.35 
 
 		 585 aa  50.4  0.00007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2392  Dynamin family protein  25.31 
 
 		 1249 aa  50.1  0.00009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1388  GTP-binding protein HSR1-related protein  26.84 
 
 		 291 aa  47  0.0009  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1306  dynamin family protein  23.72 
 
 		 1219 aa  46.6  0.001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.604786  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5156  small GTP-binding protein  28.09 
 
 		 566 aa  45.8  0.002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.61556 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2106  dynamin  27.97 
 
 		 564 aa  46.2  0.002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.78205 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2392  tRNA modification GTPase TrmE  32.86 
 
 		 468 aa  45.4  0.002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0118764  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0646  GTP-binding protein Era  21.86 
 
 		 305 aa  45.4  0.003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.601606  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0398  Dynamin family protein  19.73 
 
 		 674 aa  45.4  0.003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19310  small GTP-binding protein  26.5 
 
 		 411 aa  44.7  0.004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00194835  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0208  GTP-binding protein Era  27.8 
 
 		 297 aa  44.7  0.004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6880  Dynamin family protein  27.27 
 
 		 1164 aa  45.1  0.004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1377  dynamin family protein  30 
 
 		 585 aa  44.7  0.004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.682843  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18431  GTPase SAR1 and related small G proteins  26.06 
 
 		 440 aa  44.7  0.005  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.491382 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2968  dynamin family protein  28.41 
 
 		 583 aa  44.3  0.005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0933  dynamin family protein  26.4 
 
 		 679 aa  44.3  0.006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.807319  hitchhiker  0.00750508 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0358  GTP-binding protein Era  24.61 
 
 		 300 aa  43.9  0.007  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.954921  normal  0.603117 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_15631  GTPase SAR1 and related small G protein  27.88 
 
 		 440 aa  43.9  0.007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1736  putative ABC transporter  33.1 
 
 		 556 aa  43.9  0.008  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>