65 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmcs_1548 on replicon NC_008146
Organism: Mycobacterium sp. MCS



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008146  Mmcs_1548  putative ABC transporter  100 
 
 
525 aa  1006    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1571  putative ABC transporter  100 
 
 
525 aa  1006    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1519  putative ABC transporter  99.05 
 
 
525 aa  998    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8870  putative ABC transporter  44.66 
 
 
590 aa  371  1e-101  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0939636  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2522  putative ABC transporter  44.66 
 
 
539 aa  338  1.9999999999999998e-91  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.504723  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2640  GTP-binding protein HSR1-related protein  47.47 
 
 
550 aa  330  3e-89  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.133942  normal  0.721182 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7361  putative ABC transporter  41.39 
 
 
547 aa  325  1e-87  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.901699  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2559  putative ABC transporter  43.02 
 
 
542 aa  325  2e-87  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2259  GTP-binding protein HSR1-related  44 
 
 
537 aa  319  7e-86  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000117964 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24690  GTPase of unknown function  45.61 
 
 
539 aa  318  2e-85  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.6041  normal  0.0378138 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0080  GTP-binding protein HSR1-related protein  47.98 
 
 
532 aa  313  3.9999999999999997e-84  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.170633  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1326  hypothetical protein  40.96 
 
 
568 aa  313  5.999999999999999e-84  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1367  putative ABC transporter  45.14 
 
 
555 aa  307  3e-82  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.621246  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2219  GTPase  40.87 
 
 
673 aa  305  1.0000000000000001e-81  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1354  GTP-binding protein HSR1-related protein  49.53 
 
 
542 aa  305  1.0000000000000001e-81  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0428896  hitchhiker  0.0000949376 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3265  putative ABC transporter  46.29 
 
 
532 aa  304  3.0000000000000004e-81  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.169453  normal  0.30236 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08880  predicted GTPase  42.64 
 
 
564 aa  303  3.0000000000000004e-81  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.141009  normal  0.0562111 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1091  putative ABC transporter  42.91 
 
 
585 aa  303  6.000000000000001e-81  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.631509  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3429  hypothetical protein  39.3 
 
 
802 aa  282  1e-74  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.224896 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24310  hypothetical protein  43.95 
 
 
568 aa  261  3e-68  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08700  hypothetical protein  41.43 
 
 
586 aa  257  4e-67  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6775  putative ABC transporter  34.62 
 
 
589 aa  244  3e-63  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.122043  normal  0.131288 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1735  putative ABC transporter  36.18 
 
 
552 aa  199  7e-50  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.43735  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2644  ATP-binding membrane protein  48.77 
 
 
453 aa  192  1e-47  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.908609 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0933  hypothetical protein  31.84 
 
 
578 aa  190  5e-47  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0929  hypothetical protein  36.83 
 
 
518 aa  183  7e-45  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1350  putative ABC transporter  45.42 
 
 
524 aa  180  4.999999999999999e-44  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.43815  hitchhiker  0.000106139 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1087  putative ABC transporter  44.36 
 
 
523 aa  180  4.999999999999999e-44  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0151577  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24730  predicted GTPase  41.51 
 
 
517 aa  174  5e-42  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0664672  normal  0.0671171 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1394  hypothetical protein  29.83 
 
 
543 aa  69.3  0.0000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2560  AAA ATPase  30.49 
 
 
687 aa  68.9  0.0000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1086  hypothetical protein  31.34 
 
 
551 aa  67.8  0.0000000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  decreased coverage  0.00952601  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2220  putative ABC transporter  27.71 
 
 
619 aa  67  0.0000000007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1349  hypothetical protein  31.44 
 
 
566 aa  66.6  0.000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000440573 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3430  putative ABC transporter  29.38 
 
 
631 aa  65.9  0.000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.790282  normal  0.301569 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2260  putative ABC transporter  28.73 
 
 
571 aa  65.1  0.000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000139745 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1324  hypothetical protein  28.81 
 
 
569 aa  64.7  0.000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.577358  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1353  putative ABC transporter  31.12 
 
 
667 aa  64.7  0.000000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  hitchhiker  0.00435841  hitchhiker  0.000139423 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3266  putative ABC transporter  30.77 
 
 
571 aa  64.3  0.000000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.025779  normal  0.223838 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08870  hypothetical protein  29.17 
 
 
566 aa  64.3  0.000000006  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0706838  normal  0.0205572 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2645  putative transcriptional regulator, TetR family  31.52 
 
 
526 aa  63.9  0.000000007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8871  putative ABC transporter  31.82 
 
 
629 aa  63.9  0.000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.872872  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0928  hypothetical protein  29.79 
 
 
540 aa  63.2  0.00000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7362  hypothetical protein  27.55 
 
 
564 aa  63.2  0.00000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0821059  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2523  putative ABC transporter  27.88 
 
 
571 aa  60.5  0.00000008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1736  putative ABC transporter  36.7 
 
 
556 aa  58.9  0.0000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24320  hypothetical protein  29.83 
 
 
584 aa  58.2  0.0000004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0079  putative ABC transporter  30.36 
 
 
565 aa  57.8  0.0000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.459634  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1366  putative ABC transporter  30.04 
 
 
572 aa  57.8  0.0000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24740  hypothetical protein  28.78 
 
 
551 aa  57.8  0.0000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.043803  normal  0.105516 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1572  putative ABC transporter  28 
 
 
586 aa  56.6  0.000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1520  putative ABC transporter  28 
 
 
576 aa  56.2  0.000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.703438  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1549  putative ABC transporter  28 
 
 
586 aa  56.6  0.000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3738  hypothetical protein  31.97 
 
 
618 aa  55.8  0.000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2641  putative ABC transporter  29.06 
 
 
669 aa  53.9  0.000008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.374728  normal  0.779452 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1896  Dynamin family protein  22.12 
 
 
1228 aa  52.4  0.00002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00444431  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08690  hypothetical protein  28.04 
 
 
602 aa  51.6  0.00003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2392  Dynamin family protein  27.17 
 
 
1249 aa  50.8  0.00007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3997  hypothetical protein  29.28 
 
 
642 aa  48.9  0.0002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1090  hypothetical protein  28.85 
 
 
737 aa  49.3  0.0002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0914  Dynamin family protein  26.77 
 
 
548 aa  48.5  0.0003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.440355 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3611  GTP-binding proten HflX  28 
 
 
414 aa  47.4  0.0007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0108116  normal  0.379187 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6878  Dynamin family protein  26.13 
 
 
620 aa  46.2  0.001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0932  hypothetical protein  29.17 
 
 
650 aa  44.7  0.004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0378  ribosome biogenesis GTP-binding protein YsxC  27.78 
 
 
225 aa  44.3  0.006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.753804  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>