58 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_8870 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013595  Sros_8870  putative ABC transporter  100 
 
 
590 aa  1107    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0939636  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3265  putative ABC transporter  56.52 
 
 
532 aa  424  1e-117  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.169453  normal  0.30236 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1548  putative ABC transporter  44.66 
 
 
525 aa  377  1e-103  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1519  putative ABC transporter  44.48 
 
 
525 aa  377  1e-103  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1571  putative ABC transporter  44.66 
 
 
525 aa  377  1e-103  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2522  putative ABC transporter  45.05 
 
 
539 aa  360  4e-98  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.504723  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2640  GTP-binding protein HSR1-related protein  49.03 
 
 
550 aa  357  2.9999999999999997e-97  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.133942  normal  0.721182 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0080  GTP-binding protein HSR1-related protein  48.1 
 
 
532 aa  347  4e-94  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.170633  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08880  predicted GTPase  45.18 
 
 
564 aa  344  2e-93  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.141009  normal  0.0562111 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2259  GTP-binding protein HSR1-related  43.72 
 
 
537 aa  340  4e-92  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000117964 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24690  GTPase of unknown function  44.97 
 
 
539 aa  338  9.999999999999999e-92  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.6041  normal  0.0378138 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1091  putative ABC transporter  46.36 
 
 
585 aa  335  1e-90  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.631509  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1367  putative ABC transporter  45.25 
 
 
555 aa  330  4e-89  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.621246  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2559  putative ABC transporter  38.55 
 
 
542 aa  326  8.000000000000001e-88  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1354  GTP-binding protein HSR1-related protein  47.7 
 
 
542 aa  321  1.9999999999999998e-86  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0428896  hitchhiker  0.0000949376 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1326  hypothetical protein  39.51 
 
 
568 aa  303  8.000000000000001e-81  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7361  putative ABC transporter  37.85 
 
 
547 aa  291  2e-77  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.901699  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2219  GTPase  38.97 
 
 
673 aa  291  3e-77  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08700  hypothetical protein  43.4 
 
 
586 aa  285  1.0000000000000001e-75  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3429  hypothetical protein  36.99 
 
 
802 aa  263  6e-69  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.224896 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24310  hypothetical protein  39.2 
 
 
568 aa  238  3e-61  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6775  putative ABC transporter  33.22 
 
 
589 aa  229  1e-58  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.122043  normal  0.131288 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0933  hypothetical protein  34.18 
 
 
578 aa  212  2e-53  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24730  predicted GTPase  45.45 
 
 
517 aa  196  1e-48  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0664672  normal  0.0671171 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2644  ATP-binding membrane protein  43 
 
 
453 aa  191  2.9999999999999997e-47  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.908609 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1087  putative ABC transporter  43.15 
 
 
523 aa  187  4e-46  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0151577  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1350  putative ABC transporter  42.73 
 
 
524 aa  185  2.0000000000000003e-45  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.43815  hitchhiker  0.000106139 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1735  putative ABC transporter  32.66 
 
 
552 aa  179  1e-43  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.43735  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0929  hypothetical protein  36.11 
 
 
518 aa  174  5e-42  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2260  putative ABC transporter  36.07 
 
 
571 aa  89.7  1e-16  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000139745 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1353  putative ABC transporter  33.86 
 
 
667 aa  68.2  0.0000000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  hitchhiker  0.00435841  hitchhiker  0.000139423 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2523  putative ABC transporter  33.33 
 
 
571 aa  67.4  0.0000000007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1324  hypothetical protein  28.73 
 
 
569 aa  67  0.000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.577358  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2560  AAA ATPase  28.05 
 
 
687 aa  66.6  0.000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3430  putative ABC transporter  31.13 
 
 
631 aa  66.2  0.000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.790282  normal  0.301569 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0079  putative ABC transporter  35.48 
 
 
565 aa  63.5  0.000000009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.459634  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2220  putative ABC transporter  32.45 
 
 
619 aa  62.8  0.00000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7362  hypothetical protein  29.92 
 
 
564 aa  61.6  0.00000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0821059  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08690  hypothetical protein  31.02 
 
 
602 aa  60.1  0.0000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24320  hypothetical protein  33.82 
 
 
584 aa  56.6  0.000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08870  hypothetical protein  30.89 
 
 
566 aa  56.6  0.000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0706838  normal  0.0205572 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2641  putative ABC transporter  32.11 
 
 
669 aa  54.7  0.000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.374728  normal  0.779452 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1086  hypothetical protein  29.49 
 
 
551 aa  53.1  0.00001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  decreased coverage  0.00952601  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1394  hypothetical protein  25.64 
 
 
543 aa  51.6  0.00004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3266  putative ABC transporter  33.46 
 
 
571 aa  51.6  0.00004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.025779  normal  0.223838 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3997  hypothetical protein  26.85 
 
 
642 aa  51.2  0.00005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1366  putative ABC transporter  30.35 
 
 
572 aa  50.4  0.00008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1572  putative ABC transporter  28.85 
 
 
586 aa  47.8  0.0006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1549  putative ABC transporter  28.85 
 
 
586 aa  47.8  0.0006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1520  putative ABC transporter  28.85 
 
 
576 aa  47.4  0.0007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.703438  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1090  hypothetical protein  30.88 
 
 
737 aa  47.4  0.0007  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8871  putative ABC transporter  30.69 
 
 
629 aa  47  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.872872  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2645  putative transcriptional regulator, TetR family  29.27 
 
 
526 aa  46.6  0.001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3738  hypothetical protein  30.39 
 
 
618 aa  45.8  0.002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0932  hypothetical protein  29.07 
 
 
650 aa  46.2  0.002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19310  small GTP-binding protein  26.62 
 
 
411 aa  45.4  0.003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00194835  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1451  GTP1/OBG family GTPase  22.11 
 
 
1219 aa  43.9  0.009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.472831  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1349  hypothetical protein  35 
 
 
566 aa  43.5  0.01  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000440573 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>