96 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cfla_1354 on replicon NC_014151
Organism: Cellulomonas flavigena DSM 20109



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014151  Cfla_1354  GTP-binding protein HSR1-related protein  100 
 
 
542 aa  988    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0428896  hitchhiker  0.0000949376 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2640  GTP-binding protein HSR1-related protein  56.58 
 
 
550 aa  419  1e-116  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.133942  normal  0.721182 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24690  GTPase of unknown function  54.36 
 
 
539 aa  407  1.0000000000000001e-112  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.6041  normal  0.0378138 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1091  putative ABC transporter  55.63 
 
 
585 aa  408  1.0000000000000001e-112  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.631509  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2522  putative ABC transporter  49.05 
 
 
539 aa  362  1e-98  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.504723  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8870  putative ABC transporter  47.16 
 
 
590 aa  353  5.9999999999999994e-96  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0939636  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1519  putative ABC transporter  49.72 
 
 
525 aa  348  2e-94  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1571  putative ABC transporter  49.35 
 
 
525 aa  343  5.999999999999999e-93  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1548  putative ABC transporter  49.35 
 
 
525 aa  343  5.999999999999999e-93  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2259  GTP-binding protein HSR1-related  47.17 
 
 
537 aa  333  6e-90  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000117964 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08880  predicted GTPase  44.59 
 
 
564 aa  316  8e-85  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.141009  normal  0.0562111 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0080  GTP-binding protein HSR1-related protein  50.67 
 
 
532 aa  309  1.0000000000000001e-82  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.170633  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24310  hypothetical protein  46.93 
 
 
568 aa  288  2e-76  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08700  hypothetical protein  46.11 
 
 
586 aa  283  4.0000000000000003e-75  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2559  putative ABC transporter  40.07 
 
 
542 aa  281  2e-74  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3265  putative ABC transporter  50.28 
 
 
532 aa  280  5e-74  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.169453  normal  0.30236 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1367  putative ABC transporter  42.36 
 
 
555 aa  270  5e-71  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.621246  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1326  hypothetical protein  40.29 
 
 
568 aa  260  4e-68  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2219  GTPase  38.52 
 
 
673 aa  248  2e-64  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7361  putative ABC transporter  39.41 
 
 
547 aa  248  3e-64  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.901699  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3429  hypothetical protein  37.79 
 
 
802 aa  239  9e-62  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.224896 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0933  hypothetical protein  37.43 
 
 
578 aa  235  2.0000000000000002e-60  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6775  putative ABC transporter  36.77 
 
 
589 aa  233  5e-60  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.122043  normal  0.131288 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1350  putative ABC transporter  45.48 
 
 
524 aa  192  1e-47  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.43815  hitchhiker  0.000106139 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1735  putative ABC transporter  46.43 
 
 
552 aa  191  4e-47  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.43735  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0929  hypothetical protein  39.5 
 
 
518 aa  185  1.0000000000000001e-45  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24730  predicted GTPase  44.36 
 
 
517 aa  184  3e-45  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0664672  normal  0.0671171 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2644  ATP-binding membrane protein  46.21 
 
 
453 aa  181  2.9999999999999997e-44  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.908609 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1087  putative ABC transporter  46.46 
 
 
523 aa  173  6.999999999999999e-42  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0151577  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2260  putative ABC transporter  36.65 
 
 
571 aa  86.7  0.000000000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000139745 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7362  hypothetical protein  37.7 
 
 
564 aa  84.3  0.000000000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0821059  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1353  putative ABC transporter  35.24 
 
 
667 aa  80.5  0.00000000000007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  hitchhiker  0.00435841  hitchhiker  0.000139423 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2523  putative ABC transporter  37.5 
 
 
571 aa  79.3  0.0000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2560  AAA ATPase  36.55 
 
 
687 aa  78.2  0.0000000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1324  hypothetical protein  37.76 
 
 
569 aa  75.9  0.000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.577358  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2220  putative ABC transporter  34.73 
 
 
619 aa  75.9  0.000000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08690  hypothetical protein  34.22 
 
 
602 aa  74.3  0.000000000005  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3430  putative ABC transporter  34.59 
 
 
631 aa  74.3  0.000000000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.790282  normal  0.301569 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1349  hypothetical protein  36.18 
 
 
566 aa  70.9  0.00000000006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000440573 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0928  hypothetical protein  36.18 
 
 
540 aa  69.7  0.0000000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3266  putative ABC transporter  36.61 
 
 
571 aa  67  0.0000000008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.025779  normal  0.223838 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24320  hypothetical protein  33.17 
 
 
584 aa  65.5  0.000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1086  hypothetical protein  35.94 
 
 
551 aa  65.1  0.000000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  decreased coverage  0.00952601  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2645  putative transcriptional regulator, TetR family  38.46 
 
 
526 aa  64.7  0.000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24740  hypothetical protein  35.29 
 
 
551 aa  63.5  0.000000009  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.043803  normal  0.105516 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0079  putative ABC transporter  35.23 
 
 
565 aa  63.5  0.00000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.459634  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1439  Dynamin family protein  27.86 
 
 
546 aa  63.5  0.00000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.784928  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1394  hypothetical protein  29.85 
 
 
543 aa  63.2  0.00000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1366  putative ABC transporter  37.78 
 
 
572 aa  62.4  0.00000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0914  Dynamin family protein  29.05 
 
 
548 aa  61.6  0.00000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.440355 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1736  putative ABC transporter  38.01 
 
 
556 aa  60.1  0.00000009  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8871  putative ABC transporter  34.76 
 
 
629 aa  59.7  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.872872  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0932  hypothetical protein  32.61 
 
 
650 aa  60.1  0.0000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2641  putative ABC transporter  38.04 
 
 
669 aa  59.3  0.0000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.374728  normal  0.779452 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3997  hypothetical protein  28.74 
 
 
642 aa  58.9  0.0000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08870  hypothetical protein  34.03 
 
 
566 aa  58.5  0.0000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0706838  normal  0.0205572 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1572  putative ABC transporter  37.98 
 
 
586 aa  55.8  0.000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1549  putative ABC transporter  37.98 
 
 
586 aa  55.8  0.000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1520  putative ABC transporter  37.98 
 
 
576 aa  55.8  0.000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.703438  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7327  ribosome biogenesis GTP-binding protein YsxC  27.05 
 
 
220 aa  54.3  0.000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0933  dynamin family protein  27.51 
 
 
679 aa  54.3  0.000005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.807319  hitchhiker  0.00750508 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2142  GTP-binding protein HFLX  29.31 
 
 
444 aa  51.2  0.00004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.501341  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3531  dynamin family protein  30.05 
 
 
585 aa  51.6  0.00004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2968  dynamin family protein  26.96 
 
 
583 aa  51.6  0.00004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2106  dynamin  27.95 
 
 
564 aa  51.2  0.00005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.78205 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1896  Dynamin family protein  24.57 
 
 
1228 aa  51.2  0.00005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00444431  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2392  Dynamin family protein  25.13 
 
 
1249 aa  50.8  0.00006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0322  Dynamin family protein  29.89 
 
 
585 aa  49.7  0.0001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24700  hypothetical protein  33.5 
 
 
784 aa  50.1  0.0001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.303383  normal  0.0806263 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6880  Dynamin family protein  28.42 
 
 
1164 aa  50.1  0.0001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2213  Dynamin family protein  27.62 
 
 
587 aa  49.7  0.0002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3738  hypothetical protein  28.83 
 
 
618 aa  48.9  0.0002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1377  dynamin family protein  28.57 
 
 
585 aa  48.9  0.0002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.682843  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1494  dynamin family protein  21.98 
 
 
1219 aa  47  0.0008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.248245  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1451  GTP1/OBG family GTPase  23.08 
 
 
1219 aa  46.2  0.001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1306  dynamin family protein  23 
 
 
1219 aa  46.2  0.001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.604786  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6878  Dynamin family protein  27.95 
 
 
620 aa  47  0.001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0759  putative GTPase  25.73 
 
 
291 aa  47  0.001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1595  hypothetical protein  23.08 
 
 
1219 aa  46.2  0.001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3702  ribosome biogenesis GTP-binding protein YsxC  28.92 
 
 
217 aa  46.6  0.001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5156  small GTP-binding protein  30.16 
 
 
566 aa  46.6  0.001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.61556 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1479  hypothetical protein  23.08 
 
 
1219 aa  46.2  0.001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1451  GTP1/OBG family GTPase  23.21 
 
 
1219 aa  46.2  0.002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.472831  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1820  GTP-binding proten HflX  28.45 
 
 
441 aa  46.2  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0332414  normal  0.106789 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1741  hypothetical protein  23.08 
 
 
1219 aa  46.2  0.002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000058782  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1665  hypothetical protein  23.08 
 
 
1219 aa  46.2  0.002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3715  hypothetical protein  24.26 
 
 
1219 aa  45.1  0.003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1630  hypothetical protein  24.26 
 
 
1219 aa  45.1  0.003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00254693  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1633  GTP-binding proten HflX  28.45 
 
 
441 aa  45.1  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.192278  normal  0.293033 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1069  GTP-binding proten HflX  32.21 
 
 
490 aa  45.4  0.003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1701  hypothetical protein  24.04 
 
 
1219 aa  45.4  0.003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4797  putative GTPase  25.41 
 
 
294 aa  44.7  0.004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.276697 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1090  hypothetical protein  36.17 
 
 
737 aa  45.1  0.004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3402  putative GTPase  27.16 
 
 
294 aa  45.1  0.004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2910  dynamin family protein  26.18 
 
 
605 aa  44.3  0.007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.518789  normal  0.400566 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0179  ribosome-associated GTPase  46.51 
 
 
347 aa  43.5  0.009  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>