96 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tfu_2219 on replicon NC_007333
Organism: Thermobifida fusca YX



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007333  Tfu_2219  GTPase  100 
 
 		 673 aa  1320    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3429  hypothetical protein  52.77 
 
 		 802 aa  600  1e-170  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.224896 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2559  putative ABC transporter  45.51 
 
 		 542 aa  394  1e-108  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7361  putative ABC transporter  45.74 
 
 		 547 aa  384  1e-105  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.901699  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1326  hypothetical protein  44.85 
 
 		 568 aa  376  1e-103  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1519  putative ABC transporter  40.68 
 
 		 525 aa  303  5.000000000000001e-81  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1571  putative ABC transporter  40.68 
 
 		 525 aa  300  6e-80  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1548  putative ABC transporter  40.68 
 
 		 525 aa  300  6e-80  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8870  putative ABC transporter  42.3 
 
 		 590 aa  293  1e-77  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0939636  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1367  putative ABC transporter  43.63 
 
 		 555 aa  289  9e-77  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.621246  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2522  putative ABC transporter  41.78 
 
 		 539 aa  289  1e-76  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.504723  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0080  GTP-binding protein HSR1-related protein  46.76 
 
 		 532 aa  273  7e-72  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.170633  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24690  GTPase of unknown function  42.64 
 
 		 539 aa  253  6e-66  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.6041  normal  0.0378138 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2259  GTP-binding protein HSR1-related  41.41 
 
 		 537 aa  244  3e-63  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000117964 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1091  putative ABC transporter  40.12 
 
 		 585 aa  244  5e-63  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.631509  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08880  predicted GTPase  38.22 
 
 		 564 aa  240  5e-62  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.141009  normal  0.0562111 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3265  putative ABC transporter  40.33 
 
 		 532 aa  240  6.999999999999999e-62  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.169453  normal  0.30236 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6775  putative ABC transporter  34.4 
 
 		 589 aa  231  3e-59  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.122043  normal  0.131288 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08700  hypothetical protein  40.18 
 
 		 586 aa  230  7e-59  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2640  GTP-binding protein HSR1-related protein  39.57 
 
 		 550 aa  226  8e-58  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.133942  normal  0.721182 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1354  GTP-binding protein HSR1-related protein  40.68 
 
 		 542 aa  214  2.9999999999999995e-54  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0428896  hitchhiker  0.0000949376 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1350  putative ABC transporter  44.3 
 
 		 524 aa  207  7e-52  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.43815  hitchhiker  0.000106139 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24730  predicted GTPase  50.4 
 
 		 517 aa  204  3e-51  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0664672  normal  0.0671171 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2644  ATP-binding membrane protein  47.62 
 
 		 453 aa  201  3.9999999999999996e-50  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.908609 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0929  hypothetical protein  40.76 
 
 		 518 aa  196  2e-48  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1735  putative ABC transporter  37.01 
 
 		 552 aa  194  4e-48  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.43735  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24310  hypothetical protein  37.41 
 
 		 568 aa  191  4e-47  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0933  hypothetical protein  31.94 
 
 		 578 aa  190  7e-47  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1087  putative ABC transporter  45.53 
 
 		 523 aa  185  3e-45  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0151577  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1394  hypothetical protein  28.85 
 
 		 543 aa  77.8  0.0000000000006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1086  hypothetical protein  32.21 
 
 		 551 aa  69.7  0.0000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  decreased coverage  0.00952601  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2260  putative ABC transporter  34.63 
 
 		 571 aa  70.1  0.0000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000139745 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1353  putative ABC transporter  32.57 
 
 		 667 aa  69.3  0.0000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  hitchhiker  0.00435841  hitchhiker  0.000139423 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2523  putative ABC transporter  32 
 
 		 571 aa  68.2  0.0000000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2220  putative ABC transporter  33.73 
 
 		 619 aa  66.6  0.000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7362  hypothetical protein  28.57 
 
 		 564 aa  63.5  0.00000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0821059  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08690  hypothetical protein  32.91 
 
 		 602 aa  63.2  0.00000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3430  putative ABC transporter  33.33 
 
 		 631 aa  63.5  0.00000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.790282  normal  0.301569 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08870  hypothetical protein  34.09 
 
 		 566 aa  62.8  0.00000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0706838  normal  0.0205572 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0928  hypothetical protein  28.51 
 
 		 540 aa  62.4  0.00000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1324  hypothetical protein  31.88 
 
 		 569 aa  60.5  0.0000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.577358  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1349  hypothetical protein  32.35 
 
 		 566 aa  58.5  0.0000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000440573 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2560  AAA ATPase  28.28 
 
 		 687 aa  58.2  0.0000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24740  hypothetical protein  32.54 
 
 		 551 aa  57.4  0.0000009  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.043803  normal  0.105516 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2645  putative transcriptional regulator, TetR family  32.95 
 
 		 526 aa  57  0.000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24320  hypothetical protein  30.3 
 
 		 584 aa  55.8  0.000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3738  hypothetical protein  30.46 
 
 		 618 aa  56.6  0.000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1549  putative ABC transporter  34.35 
 
 		 586 aa  54.3  0.000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1572  putative ABC transporter  34.35 
 
 		 586 aa  54.3  0.000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1520  putative ABC transporter  34.35 
 
 		 576 aa  53.9  0.000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.703438  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5013  GTP-binding proten HflX  29.82 
 
 		 404 aa  53.5  0.00001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0596854  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8871  putative ABC transporter  33.06 
 
 		 629 aa  52.4  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.872872  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2641  putative ABC transporter  33.87 
 
 		 669 aa  52.8  0.00002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.374728  normal  0.779452 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0079  putative ABC transporter  32.39 
 
 		 565 aa  52.4  0.00002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.459634  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2080  small GTP-binding protein domain-containing protein  32.72 
 
 		 414 aa  51.2  0.00006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.455149  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1360  ribosome biogenesis GTP-binding protein YsxC  28.21 
 
 		 241 aa  50.8  0.00008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.225445  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0398  Dynamin family protein  21.28 
 
 		 674 aa  50.4  0.00009  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3997  hypothetical protein  27.78 
 
 		 642 aa  50.4  0.0001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1736  putative ABC transporter  31.14 
 
 		 556 aa  50.4  0.0001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1024  ribosome biogenesis GTP-binding protein YsxC  27.69 
 
 		 267 aa  49.7  0.0002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0965  ribosome biogenesis GTP-binding protein YsxC  27.69 
 
 		 267 aa  49.7  0.0002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1096  GTP-binding protein HSR1-related  32.14 
 
 		 465 aa  49.3  0.0002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.774913  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0816  ribosome biogenesis GTP-binding protein YsxC  26.34 
 
 		 216 aa  48.9  0.0003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.720609  normal  0.865249 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0094  ribosome biogenesis GTP-binding protein YsxC  26.21 
 
 		 217 aa  48.9  0.0003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0913226  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0079  ribosome biogenesis GTP-binding protein YsxC  25.73 
 
 		 217 aa  48.5  0.0004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0426673  normal  0.213307 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1221  hypothetical protein  31.62 
 
 		 417 aa  48.1  0.0005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00041238  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0759  putative GTPase  25.37 
 
 		 291 aa  48.1  0.0005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1990  putative GTP-binding protein  31.12 
 
 		 414 aa  48.1  0.0006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.592796  normal  0.0213321 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0378  ribosome biogenesis GTP-binding protein YsxC  25.25 
 
 		 225 aa  47.8  0.0006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.753804  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2180  tRNA modification GTPase TrmE  25.12 
 
 		 472 aa  48.1  0.0006  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0456  ribosome biogenesis GTP-binding protein YsxC  26.73 
 
 		 219 aa  47.8  0.0007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0574752  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0932  hypothetical protein  26.97 
 
 		 650 aa  47.4  0.001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0078  ribosome biogenesis GTP-binding protein YsxC  25.85 
 
 		 217 aa  46.6  0.001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1439  Dynamin family protein  24.1 
 
 		 546 aa  46.2  0.002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.784928  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3266  putative ABC transporter  32.16 
 
 		 571 aa  46.6  0.002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.025779  normal  0.223838 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0298  ribosome biogenesis GTP-binding protein YsxC  29.44 
 
 		 235 aa  46.2  0.002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0082  ribosome small subunit-dependent GTPase A  31.5 
 
 		 358 aa  46.6  0.002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2411  small GTP-binding protein  29 
 
 		 413 aa  45.4  0.003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.000356758  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1065  GTP-binding proten HflX  30.17 
 
 		 417 aa  45.8  0.003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5156  small GTP-binding protein  28 
 
 		 566 aa  45.8  0.003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.61556 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1157  GTP-binding proten HflX  30.17 
 
 		 417 aa  45.4  0.003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.961099 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1049  ribosome biogenesis GTP-binding protein YsxC  23.88 
 
 		 215 aa  45.8  0.003  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0113767  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1612  GTP-binding protein, HSR1-related  30.2 
 
 		 460 aa  45.4  0.003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2301  small GTP-binding protein domain-containing protein  30.2 
 
 		 382 aa  45.8  0.003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.772558  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3291  small GTP-binding protein domain-containing protein  27.27 
 
 		 492 aa  45.1  0.004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2721  GTP-binding proten HflX  27.23 
 
 		 442 aa  45.1  0.004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.43015  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0322  Dynamin family protein  26.09 
 
 		 585 aa  44.7  0.005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19310  small GTP-binding protein  26.9 
 
 		 411 aa  44.7  0.005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00194835  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1388  GTP-binding protein HSR1-related protein  28.03 
 
 		 291 aa  44.7  0.006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2602  GTP-binding protein, HSR1-related  30.35 
 
 		 386 aa  44.7  0.006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0415025  normal  0.601696 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0914  Dynamin family protein  25.46 
 
 		 548 aa  44.3  0.007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.440355 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7327  ribosome biogenesis GTP-binding protein YsxC  24.58 
 
 		 220 aa  44.3  0.007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0635  ribosome biogenesis GTP-binding protein YsxC  25.31 
 
 		 216 aa  44.3  0.007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2910  dynamin family protein  27.67 
 
 		 605 aa  44.3  0.008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.518789  normal  0.400566 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1366  putative ABC transporter  31.61 
 
 		 572 aa  44.3  0.008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1713  GTP-binding proten HflX  29.54 
 
 		 464 aa  43.9  0.009  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.639031  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>