More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmar_2721 on replicon NC_013501
Organism: Rhodothermus marinus DSM 4252



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013501  Rmar_2721  GTP-binding proten HflX  100 
 
 
442 aa  880    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.43015  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1731  GTP-binding proten HflX  54.39 
 
 
434 aa  411  1e-113  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0970  GTP-binding proten HflX  55.56 
 
 
433 aa  411  1e-113  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.602614 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1174  GTP-binding protein HflX  56.3 
 
 
431 aa  409  1e-113  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.929711  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1737  GTP-binding protein, HSR1-related  54.24 
 
 
434 aa  399  9.999999999999999e-111  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.260139  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1584  GTP-binding proten HflX  55.64 
 
 
434 aa  395  1e-109  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1506  GTP-binding proten HflX  54.29 
 
 
433 aa  397  1e-109  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00115562  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1355  GTP-binding protein HflX  56.48 
 
 
435 aa  394  1e-108  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4167  GTP-binding proten HflX  53.56 
 
 
396 aa  385  1e-106  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.0000123151  unclonable  0.00000000000307153 
 
 
-
 
NC_002950  PG1886  GTP-binding protein HflX  52.22 
 
 
406 aa  380  1e-104  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.968139 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0477  GTP-binding proten HflX  51.87 
 
 
401 aa  369  1e-101  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  decreased coverage  0.00918489  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3121  GTP-binding proten HflX  51.99 
 
 
411 aa  365  1e-100  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.653968 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6253  GTP-binding proten HflX  56.78 
 
 
426 aa  363  3e-99  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1408  GTP-binding proten HflX  49.88 
 
 
441 aa  354  2e-96  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1171  GTP-binding protein, HSR1-related  48.93 
 
 
409 aa  353  2e-96  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0590  GTP-binding proten HflX  52.6 
 
 
396 aa  353  2.9999999999999997e-96  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1232  hypothetical protein  48.94 
 
 
395 aa  353  5e-96  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.125901 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04515  GTP-binding protein HflX  49.46 
 
 
407 aa  349  7e-95  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.546831  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0898  GTP-binding proten HflX  47.65 
 
 
417 aa  335  1e-90  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.105158  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0574  GTP-binding protein, HSR1-related  50.67 
 
 
421 aa  332  1e-89  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.227405  hitchhiker  0.000000000264606 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002260  GTP-binding protein HflX  47.21 
 
 
429 aa  328  1.0000000000000001e-88  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2666  putative GTP-binding protein  44.32 
 
 
441 aa  328  2.0000000000000001e-88  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00093  putative GTPase HflX  47.21 
 
 
429 aa  327  2.0000000000000001e-88  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3144  small GTP-binding protein  45.64 
 
 
454 aa  327  3e-88  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.000830464  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0567  GTP-binding protein, HSR1-related  47.97 
 
 
432 aa  326  5e-88  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.102684  normal  0.249219 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3840  GTP1/OBG family GTP-binding protein  49.46 
 
 
392 aa  326  6e-88  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0772  GTP-binding proten HflX  46 
 
 
437 aa  325  1e-87  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.426006  normal  0.338027 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3204  GTP-binding protein, HSR1-related  46.84 
 
 
435 aa  324  2e-87  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.266449  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2334  small GTP-binding protein  46.19 
 
 
454 aa  323  3e-87  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00154  GTP-binding protein  48.66 
 
 
428 aa  323  5e-87  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2759  putative GTPase HflX  46.95 
 
 
429 aa  323  5e-87  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.563886  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1713  GTP-binding proten HflX  47.03 
 
 
464 aa  323  5e-87  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.639031  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3097  GTP-binding proten HflX  46.5 
 
 
461 aa  322  8e-87  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.0000356343  normal  0.400149 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0010  hypothetical protein  46.25 
 
 
414 aa  322  8e-87  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0497  GTP-binding proten HflX  47.93 
 
 
441 aa  322  9.999999999999999e-87  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.135524  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0010  hypothetical protein  46.25 
 
 
414 aa  321  1.9999999999999998e-86  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65300  putative GTP-binding protein  47.69 
 
 
433 aa  321  1.9999999999999998e-86  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1278  GTP-binding protein, HSR1-related  48.07 
 
 
439 aa  320  3e-86  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.424036  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5672  GTP-binding proten HflX  47.95 
 
 
433 aa  320  3e-86  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3024  GTP-binding protein HflX  46.24 
 
 
435 aa  320  3e-86  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000099061  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3539  small GTP-binding protein  47.21 
 
 
431 aa  320  3e-86  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0887499  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1472  GTP-binding proten HflX  48.91 
 
 
436 aa  319  5e-86  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0636  GTP-binding protein, HSR1-related  45.5 
 
 
433 aa  318  2e-85  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.0477069 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4893  GTP-binding protein HflX  53.4 
 
 
433 aa  317  3e-85  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4945  GTP-binding proten HflX  53.4 
 
 
433 aa  317  3e-85  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.017296 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4769  GTP-binding protein, HSR1-related  53.4 
 
 
433 aa  317  3e-85  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2012  GTP-binding proten HflX  45.58 
 
 
440 aa  315  8e-85  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0355  GTP - binding protein, phage lambda cII repressor  45.24 
 
 
489 aa  315  9.999999999999999e-85  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0536  putative GTPase HflX  47.29 
 
 
426 aa  315  9.999999999999999e-85  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.000302275  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0396  GTP-binding protein, HSR1-related  45.24 
 
 
489 aa  315  9.999999999999999e-85  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3310  GTP-binding protein, HSR1-related  46.31 
 
 
435 aa  314  1.9999999999999998e-84  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3720  putative GTPase HflX  48.24 
 
 
426 aa  313  2.9999999999999996e-84  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00523075  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3918  putative GTPase HflX  48.24 
 
 
426 aa  313  2.9999999999999996e-84  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.240209  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2081  small GTP-binding protein  47.19 
 
 
582 aa  314  2.9999999999999996e-84  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00812611  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1087  small GTP-binding protein domain-containing protein  44.64 
 
 
436 aa  312  5.999999999999999e-84  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.824642  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3820  GTP-binding proten HflX  46.51 
 
 
426 aa  312  9e-84  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0373648  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1689  GTP1/OBG protein  43.8 
 
 
419 aa  312  9e-84  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4640  putative GTPase HflX  45.99 
 
 
426 aa  311  1e-83  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.208484  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2926  GTP1/OBG protein  45.38 
 
 
444 aa  311  1e-83  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0180067  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4630  putative GTPase HflX  45.99 
 
 
426 aa  311  1e-83  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.048412  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4723  putative GTPase HflX  45.99 
 
 
426 aa  311  1e-83  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4780  putative GTPase HflX  45.99 
 
 
426 aa  311  1e-83  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0452958  normal  0.331117 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3979  GTP-binding protein, HSR1-related  42.45 
 
 
432 aa  311  1e-83  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00650  GTP-binding protein HflX  44.44 
 
 
429 aa  311  1e-83  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.108619  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2768  GTP-binding protein, HSR1-related  46.46 
 
 
432 aa  311  1e-83  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3797  putative GTPase HflX  46.91 
 
 
428 aa  311  2e-83  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0756965  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0493  putative GTPase HflX  46.77 
 
 
433 aa  311  2e-83  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0353897  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4759  putative GTPase HflX  45.99 
 
 
426 aa  311  2e-83  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0698  putative GTPase HflX  46.91 
 
 
428 aa  311  2e-83  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3652  putative GTPase HflX  46.91 
 
 
428 aa  311  2e-83  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1434  GTP-binding protein HSR1-related  43.29 
 
 
419 aa  311  2e-83  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0057  GTP-binding proten HflX  44.94 
 
 
450 aa  310  2e-83  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.583436  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04040  predicted GTPase  46.51 
 
 
426 aa  310  2.9999999999999997e-83  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.188583  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04002  hypothetical protein  46.51 
 
 
426 aa  310  2.9999999999999997e-83  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.170688  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5689  putative GTPase HflX  46.51 
 
 
426 aa  310  2.9999999999999997e-83  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0600434  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2979  GTP-binding protein, HSR1-related  49.73 
 
 
384 aa  310  2.9999999999999997e-83  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.908653  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4704  putative GTPase HflX  46.51 
 
 
426 aa  310  2.9999999999999997e-83  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4415  putative GTPase HflX  46.51 
 
 
426 aa  310  2.9999999999999997e-83  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.446722  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4644  putative GTPase HflX  46.51 
 
 
426 aa  310  2.9999999999999997e-83  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.0602066 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4731  putative GTPase HflX  46.51 
 
 
426 aa  310  2.9999999999999997e-83  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3840  putative GTPase HflX  46.51 
 
 
426 aa  310  2.9999999999999997e-83  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.209609  hitchhiker  0.000000230034 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1414  GTP-binding proten HflX  51.42 
 
 
414 aa  310  4e-83  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000434774 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2589  GTP-binding protein, HSR1-related  48.6 
 
 
382 aa  309  5.9999999999999995e-83  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0427105  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1469  GTP-binding proten HflX  50.14 
 
 
396 aa  309  5.9999999999999995e-83  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.795442  normal  0.339069 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11140  small GTP-binding protein  48.24 
 
 
395 aa  309  5.9999999999999995e-83  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1259  GTP-binding protein, HSR1-related  48.45 
 
 
421 aa  309  8e-83  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.027448  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0069  GTP-binding protein  44.94 
 
 
450 aa  308  9e-83  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10790  GTP-binding proten HflX  43.51 
 
 
433 aa  308  1.0000000000000001e-82  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.000931239  unclonable  0.00000000274038 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0432  putative GTPase HflX  46.51 
 
 
426 aa  308  1.0000000000000001e-82  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000150209  unclonable  0.0000000363353 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2776  putative GTPase HflX  45.69 
 
 
439 aa  308  1.0000000000000001e-82  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.114582  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5107  small GTP-binding protein  50.14 
 
 
396 aa  308  2.0000000000000002e-82  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.245706  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2535  GTP-binding proten HflX  50.99 
 
 
404 aa  308  2.0000000000000002e-82  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0955087  hitchhiker  0.0000726108 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3237  GTP-binding protein, HSR1-related  44.05 
 
 
430 aa  308  2.0000000000000002e-82  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2240  GTP-binding protein HflX  50.71 
 
 
392 aa  307  3e-82  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.224831  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1600  small GTP-binding protein  51.56 
 
 
404 aa  307  3e-82  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0793347  normal  0.128476 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1835  GTP-binding protein  43.29 
 
 
419 aa  306  4.0000000000000004e-82  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1830  GTP-binding proten HflX  50.42 
 
 
395 aa  306  5.0000000000000004e-82  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.497778 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1806  small GTP-binding protein  50.42 
 
 
395 aa  306  5.0000000000000004e-82  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1872  GTP-binding protein  43.04 
 
 
419 aa  306  5.0000000000000004e-82  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000726379 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2349  GTP-binding protein HflX  50.42 
 
 
392 aa  306  6e-82  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>