89 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tfu_2220 on replicon NC_007333
Organism: Thermobifida fusca YX



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014210  Ndas_3430  putative ABC transporter  58.37 
 
 		 631 aa  678    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.790282  normal  0.301569 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2220  putative ABC transporter  100 
 
 		 619 aa  1228    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1324  hypothetical protein  45.26 
 
 		 569 aa  460  9.999999999999999e-129  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.577358  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7362  hypothetical protein  45.6 
 
 		 564 aa  450  1e-125  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0821059  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2560  AAA ATPase  45.77 
 
 		 687 aa  449  1.0000000000000001e-124  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8871  putative ABC transporter  39.55 
 
 		 629 aa  307  3e-82  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.872872  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08870  hypothetical protein  38.19 
 
 		 566 aa  303  5.000000000000001e-81  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0706838  normal  0.0205572 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3266  putative ABC transporter  39.21 
 
 		 571 aa  301  2e-80  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.025779  normal  0.223838 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2523  putative ABC transporter  36.88 
 
 		 571 aa  301  3e-80  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0079  putative ABC transporter  40.11 
 
 		 565 aa  300  6e-80  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.459634  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1520  putative ABC transporter  37.48 
 
 		 576 aa  295  1e-78  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.703438  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2260  putative ABC transporter  36.46 
 
 		 571 aa  291  3e-77  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000139745 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1549  putative ABC transporter  36.77 
 
 		 586 aa  290  5.0000000000000004e-77  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1572  putative ABC transporter  36.77 
 
 		 586 aa  290  5.0000000000000004e-77  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24320  hypothetical protein  34.82 
 
 		 584 aa  281  4e-74  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1353  putative ABC transporter  36.06 
 
 		 667 aa  277  3e-73  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  hitchhiker  0.00435841  hitchhiker  0.000139423 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08690  hypothetical protein  35.41 
 
 		 602 aa  276  8e-73  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2641  putative ABC transporter  36.45 
 
 		 669 aa  261  3e-68  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.374728  normal  0.779452 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1366  putative ABC transporter  36.86 
 
 		 572 aa  260  6e-68  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0932  hypothetical protein  33.21 
 
 		 650 aa  255  1.0000000000000001e-66  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24700  hypothetical protein  35.46 
 
 		 784 aa  246  9.999999999999999e-64  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.303383  normal  0.0806263 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1090  hypothetical protein  35.14 
 
 		 737 aa  236  8e-61  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1349  hypothetical protein  35.56 
 
 		 566 aa  188  3e-46  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000440573 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1086  hypothetical protein  31.44 
 
 		 551 aa  183  7e-45  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  decreased coverage  0.00952601  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24740  hypothetical protein  30.05 
 
 		 551 aa  165  3e-39  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.043803  normal  0.105516 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0928  hypothetical protein  34.57 
 
 		 540 aa  162  1e-38  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2645  putative transcriptional regulator, TetR family  34.78 
 
 		 526 aa  153  7e-36  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1736  putative ABC transporter  29.82 
 
 		 556 aa  139  2e-31  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08880  predicted GTPase  33.33 
 
 		 564 aa  105  4e-21  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.141009  normal  0.0562111 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24690  GTPase of unknown function  32.62 
 
 		 539 aa  87.4  6e-16  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.6041  normal  0.0378138 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1367  putative ABC transporter  30.88 
 
 		 555 aa  83.2  0.00000000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.621246  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1735  putative ABC transporter  30.49 
 
 		 552 aa  82.8  0.00000000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.43735  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24310  hypothetical protein  34.05 
 
 		 568 aa  77.4  0.0000000000007  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3997  hypothetical protein  27.41 
 
 		 642 aa  76.3  0.000000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1354  GTP-binding protein HSR1-related protein  30.81 
 
 		 542 aa  75.9  0.000000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0428896  hitchhiker  0.0000949376 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3429  hypothetical protein  31.47 
 
 		 802 aa  75.1  0.000000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.224896 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6775  putative ABC transporter  32.05 
 
 		 589 aa  75.5  0.000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.122043  normal  0.131288 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3265  putative ABC transporter  34.27 
 
 		 532 aa  75.5  0.000000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.169453  normal  0.30236 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2259  GTP-binding protein HSR1-related  29.86 
 
 		 537 aa  73.9  0.000000000007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000117964 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1091  putative ABC transporter  31.47 
 
 		 585 aa  73.6  0.00000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.631509  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24730  predicted GTPase  31.69 
 
 		 517 aa  72.4  0.00000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0664672  normal  0.0671171 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2522  putative ABC transporter  28.73 
 
 		 539 aa  72.4  0.00000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.504723  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2640  GTP-binding protein HSR1-related protein  35.51 
 
 		 550 aa  72  0.00000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.133942  normal  0.721182 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1326  hypothetical protein  31.73 
 
 		 568 aa  72  0.00000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0080  GTP-binding protein HSR1-related protein  29.19 
 
 		 532 aa  70.1  0.0000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.170633  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1350  putative ABC transporter  31.46 
 
 		 524 aa  70.1  0.0000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.43815  hitchhiker  0.000106139 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1571  putative ABC transporter  27.71 
 
 		 525 aa  67  0.0000000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1548  putative ABC transporter  27.71 
 
 		 525 aa  67  0.0000000009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2219  GTPase  33.73 
 
 		 673 aa  67  0.0000000009  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1087  putative ABC transporter  28.8 
 
 		 523 aa  66.6  0.000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0151577  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1519  putative ABC transporter  27.71 
 
 		 525 aa  66.6  0.000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0929  hypothetical protein  30.22 
 
 		 518 aa  65.1  0.000000004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1394  hypothetical protein  25.81 
 
 		 543 aa  64.3  0.000000007  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8870  putative ABC transporter  29.49 
 
 		 590 aa  63.2  0.00000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0939636  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2559  putative ABC transporter  31.05 
 
 		 542 aa  62.8  0.00000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3738  hypothetical protein  34.42 
 
 		 618 aa  62.8  0.00000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7361  putative ABC transporter  31.93 
 
 		 547 aa  62.8  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.901699  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0933  hypothetical protein  32.02 
 
 		 578 aa  60.1  0.0000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2106  dynamin  30.63 
 
 		 564 aa  58.5  0.0000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.78205 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0632  Dynamin family protein  24.44 
 
 		 589 aa  56.6  0.000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08700  hypothetical protein  27.45 
 
 		 586 aa  56.2  0.000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0914  Dynamin family protein  27.92 
 
 		 548 aa  55.1  0.000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.440355 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2213  Dynamin family protein  25.62 
 
 		 587 aa  55.1  0.000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1377  dynamin family protein  26.29 
 
 		 585 aa  53.9  0.000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.682843  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1439  Dynamin family protein  23.53 
 
 		 546 aa  53.5  0.00001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.784928  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2644  ATP-binding membrane protein  27.15 
 
 		 453 aa  53.5  0.00001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.908609 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2910  dynamin family protein  26.71 
 
 		 605 aa  53.1  0.00002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.518789  normal  0.400566 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3531  dynamin family protein  25.76 
 
 		 585 aa  53.1  0.00002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2968  dynamin family protein  24.39 
 
 		 583 aa  52.4  0.00003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0322  Dynamin family protein  25.28 
 
 		 585 aa  50.1  0.0001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1701  hypothetical protein  24.34 
 
 		 1219 aa  50.1  0.0001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1479  hypothetical protein  24.86 
 
 		 1219 aa  50.1  0.0001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1451  GTP1/OBG family GTPase  24.86 
 
 		 1219 aa  50.1  0.0001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1741  hypothetical protein  23.91 
 
 		 1219 aa  50.1  0.0001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000058782  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1451  GTP1/OBG family GTPase  23.91 
 
 		 1219 aa  50.1  0.0001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.472831  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1665  hypothetical protein  24.86 
 
 		 1219 aa  50.1  0.0001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1595  hypothetical protein  24.86 
 
 		 1219 aa  50.1  0.0001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6880  Dynamin family protein  28.07 
 
 		 1164 aa  49.3  0.0002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3715  hypothetical protein  24.72 
 
 		 1219 aa  49.3  0.0002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2392  Dynamin family protein  24.54 
 
 		 1249 aa  48.9  0.0003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1510  GTP-binding protein HSR1-related  20.86 
 
 		 523 aa  48.1  0.0005  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1630  hypothetical protein  24.14 
 
 		 1219 aa  47  0.001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00254693  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1501  hypothetical protein  20.37 
 
 		 1146 aa  45.1  0.004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1530  hypothetical protein  20.37 
 
 		 1146 aa  45.1  0.004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.532706  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1013  hypothetical protein  19.05 
 
 		 1145 aa  45.1  0.004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.445275  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0107  small GTP-binding protein domain-containing protein  29.05 
 
 		 472 aa  44.3  0.006  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.130324  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1494  dynamin family protein  24.14 
 
 		 1219 aa  44.7  0.006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.248245  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1306  dynamin family protein  22.53 
 
 		 1219 aa  43.9  0.008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.604786  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1096  GTP-binding protein, HSR1-related  25.6 
 
 		 664 aa  43.9  0.01  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>