82 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SERP1013 on replicon NC_002976
Organism: Staphylococcus epidermidis RP62A



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002976  SERP1013  hypothetical protein  100 
 
 		 1145 aa  2315    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.445275  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1501  hypothetical protein  65.5 
 
 		 1146 aa  1509    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1530  hypothetical protein  65.5 
 
 		 1146 aa  1509    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.532706  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1741  hypothetical protein  27.49 
 
 		 1219 aa  344  5e-93  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000058782  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3715  hypothetical protein  27.63 
 
 		 1219 aa  342  2.9999999999999998e-92  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1630  hypothetical protein  27.83 
 
 		 1219 aa  340  5.9999999999999996e-92  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00254693  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1896  Dynamin family protein  26.06 
 
 		 1228 aa  340  9.999999999999999e-92  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00444431  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1701  hypothetical protein  27.25 
 
 		 1219 aa  338  3.9999999999999995e-91  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1595  hypothetical protein  27.74 
 
 		 1219 aa  337  5.999999999999999e-91  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1479  hypothetical protein  27.74 
 
 		 1219 aa  337  5.999999999999999e-91  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1451  GTP1/OBG family GTPase  27.16 
 
 		 1219 aa  337  1e-90  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.472831  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1665  hypothetical protein  27.62 
 
 		 1219 aa  337  1e-90  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1451  GTP1/OBG family GTPase  27.62 
 
 		 1219 aa  336  1e-90  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1306  dynamin family protein  27.9 
 
 		 1219 aa  328  4.0000000000000003e-88  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.604786  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1494  dynamin family protein  26.59 
 
 		 1219 aa  324  5e-87  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.248245  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2392  Dynamin family protein  26.64 
 
 		 1249 aa  195  4e-48  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0969  Dynamin family protein  32.31 
 
 		 648 aa  135  3e-30  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0968  small GTP-binding protein  25.17 
 
 		 501 aa  100  1e-19  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2259  Dynamin family protein  28.57 
 
 		 444 aa  75.1  0.000000000007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000551632  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0460  GTP-binding protein  29.22 
 
 		 728 aa  75.1  0.000000000007  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.839985  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0435  GTP-binding protein  28.81 
 
 		 728 aa  73.2  0.00000000003  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1546  GTP-binding protein  28.81 
 
 		 728 aa  72  0.00000000006  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0787  dynamin family protein  27.43 
 
 		 655 aa  70.9  0.0000000001  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.0394271  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2994  dynamin family protein  27 
 
 		 614 aa  70.1  0.0000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.214598  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3036  dynamin family protein  27 
 
 		 614 aa  70.1  0.0000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0241135  normal  0.688737 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1925  hypothetical protein  25.81 
 
 		 788 aa  70.9  0.0000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0368958  hitchhiker  0.0041869 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1095  dynamin  24.87 
 
 		 588 aa  68.9  0.0000000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.845511  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6054  hypothetical protein  24.15 
 
 		 747 aa  67.8  0.000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0373  hypothetical protein  27.35 
 
 		 737 aa  64.3  0.00000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2910  dynamin family protein  22.89 
 
 		 605 aa  63.5  0.00000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.518789  normal  0.400566 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0322  Dynamin family protein  23.93 
 
 		 585 aa  62  0.00000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2106  dynamin  25.19 
 
 		 564 aa  61.6  0.00000009  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.78205 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0914  Dynamin family protein  25 
 
 		 548 aa  61.2  0.0000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.440355 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1096  GTP-binding protein, HSR1-related  24.1 
 
 		 664 aa  60.5  0.0000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1510  GTP-binding protein HSR1-related  25.29 
 
 		 523 aa  60.5  0.0000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6880  Dynamin family protein  24.1 
 
 		 1164 aa  59.7  0.0000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0933  dynamin family protein  19.89 
 
 		 679 aa  58.5  0.0000006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.807319  hitchhiker  0.00750508 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0830  hypothetical protein  22.02 
 
 		 712 aa  57.4  0.000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00896739  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0397  Dynamin family protein  25.97 
 
 		 789 aa  57.4  0.000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0111735  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0815  GTPase  24.15 
 
 		 712 aa  55.8  0.000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0461  GTP-binding protein  27.81 
 
 		 569 aa  55.5  0.000006  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.0612543  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0336  conserved hypothetical protein, predicted ATP/GTP-binding protein  23.98 
 
 		 741 aa  55.1  0.000007  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2968  dynamin family protein  25.47 
 
 		 583 aa  55.1  0.000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0404  glucosamine fructose-6-phosphate aminotransferase (isomerizing)  32.99 
 
 		 610 aa  55.1  0.000007  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1193  hypothetical protein  25.27 
 
 		 614 aa  55.1  0.000008  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.108086  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6878  Dynamin family protein  26.79 
 
 		 620 aa  54.7  0.000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1273  Dynamin family protein  22.28 
 
 		 407 aa  54.7  0.00001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.0000000146438  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0436  GTP-binding protein  27.22 
 
 		 569 aa  53.5  0.00002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1377  dynamin family protein  26.5 
 
 		 585 aa  52.8  0.00003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.682843  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0437  GTP-binding protein  22.88 
 
 		 692 aa  53.1  0.00003  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1545  GTP-binding protein  33.33 
 
 		 569 aa  52.4  0.00004  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.712051  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0860  GTP-binding protein  25.67 
 
 		 601 aa  52.4  0.00005  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1439  Dynamin family protein  22.52 
 
 		 546 aa  52  0.00006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.784928  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1654  dynamin  23.16 
 
 		 686 aa  51.6  0.00009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0311974  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3531  dynamin family protein  26.32 
 
 		 585 aa  51.2  0.0001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1350  dynamin  37.68 
 
 		 693 aa  51.2  0.0001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0228271 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1351  heat shock protein DnaJ-like  34.09 
 
 		 741 aa  50.8  0.0001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0473185 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1639  dynamin family protein  20 
 
 		 605 aa  51.2  0.0001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.143429  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2213  Dynamin family protein  24.68 
 
 		 587 aa  51.2  0.0001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7362  hypothetical protein  21.28 
 
 		 564 aa  50.4  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0821059  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0438  GTP-binding protein  25.97 
 
 		 599 aa  50.4  0.0002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0632  Dynamin family protein  23.57 
 
 		 589 aa  50.4  0.0002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0398  Dynamin family protein  29.57 
 
 		 674 aa  50.8  0.0002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2547  dynamin  26.19 
 
 		 551 aa  50.4  0.0002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.164219 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0624  hypothetical protein  22.06 
 
 		 602 aa  50.1  0.0003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.318926  normal  0.0782013 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0337  conserved hypothetical protein, predicted ATP/GTP-binding protein  25.36 
 
 		 605 aa  50.1  0.0003  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_44250  predicted protein  23.03 
 
 		 632 aa  49.7  0.0003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.755773  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1733  hypothetical protein  22.89 
 
 		 976 aa  49.3  0.0004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1654  dynamin family protein  19.05 
 
 		 603 aa  48.9  0.0006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.964955 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0896  hypothetical protein  22.58 
 
 		 502 aa  47.8  0.001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.128039  normal  0.710649 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1406  hypothetical protein  24.07 
 
 		 914 aa  47.8  0.001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2209  GTP-binding protein  30.43 
 
 		 615 aa  47.4  0.002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5313  hypothetical protein  22.14 
 
 		 743 aa  46.6  0.003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0499  small GTP-binding protein  24.54 
 
 		 475 aa  46.6  0.003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.362987  normal  0.723657 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0273  hypothetical protein  21.11 
 
 		 608 aa  46.6  0.003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2424  Dynamin family protein  22.83 
 
 		 666 aa  46.2  0.003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2545  dynamin  21.79 
 
 		 390 aa  46.2  0.004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0649757  normal  0.0791445 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6053  hypothetical protein  53.49 
 
 		 570 aa  46.2  0.004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2220  putative ABC transporter  19.05 
 
 		 619 aa  45.8  0.005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5314  hypothetical protein  22.03 
 
 		 952 aa  45.4  0.006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0928  hypothetical protein  19.66 
 
 		 540 aa  45.1  0.008  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0932  hypothetical protein  20.87 
 
 		 650 aa  44.7  0.01  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>